小開放閱讀框（small open reading frame,sORF）一般指基因組中能夠編碼長度在100個氨基酸左右或以內(nèi)短肽的開放閱讀框。它們廣泛存在于植物基因組,卻因編碼短肽而常被基因組注釋忽視。隨著翻譯組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展,具有翻譯活性的sORF被證實廣泛存在于植物基因組,且參與植物生長發(fā)育等重要過程的調(diào)控。該文歸納了近些年來植物領(lǐng)域sORF的一些研究進展,主要包括sORF的來源與分類、信息學(xué)預(yù)測方法和生物學(xué)功能等,并基于此對植物sORF未來的研究方向進行了展望。 

【文章來源】：植物科學(xué)學(xué)報. 2020,38(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 s ORF的分類
    1.1 來源于ncRNA的s ORF
    1.2 來源于mRNA的s ORF
2 s ORF的預(yù)測方法
    2.1 基于轉(zhuǎn)錄組的生物信息學(xué)方法
    2.2 基于翻譯組學(xué)的生物信息學(xué)方法
    2.3 基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)方法
3 s ORF的生物學(xué)功能
5 展望


【參考文獻】：
期刊論文
[1]IRESfinder:Identifying RNA internal ribosome entry site in eukaryotic cell using framed k-mer features[J]. Jian Zhao,Jing Wu,Tianyi Xu,Qichang Yang,Junhao He,Xiaofeng Song.  Journal of Genetics and Genomics. 2018(07)



本文編號：3054843