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嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫酸鹽代謝途徑調(diào)控機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2021-02-11 05:32
  嗜酸性喜溫硫桿菌(Acidithiobacillus caldus,簡(jiǎn)稱A.caldus)是一種化能自養(yǎng)細(xì)菌,該細(xì)菌中度嗜酸嗜熱,能夠氧化元素硫和各種還原性的無(wú)機(jī)硫化合物,并從中獲得能量和還原力,以此來(lái)完成自身的生長(zhǎng)代謝。A.caldus是生物冶金的優(yōu)勢(shì)菌株,被廣泛應(yīng)用于生物浸出和生物脫硫。A.caldus體內(nèi)存在一套復(fù)雜而又高效的無(wú)機(jī)硫化合物的代謝系統(tǒng)。其中,硫代硫酸鹽是在整個(gè)硫代謝系統(tǒng)中非常重要的中間代謝產(chǎn)物,它能夠通過(guò)連四硫酸鹽介導(dǎo)的硫代硫酸鹽代謝途徑(S4I pathway)以及Sox系統(tǒng)進(jìn)行代謝。因此,本文旨在揭示S4I途徑的作用和調(diào)控機(jī)制,深入了解A.caldus整個(gè)硫代謝系統(tǒng),以及相關(guān)的調(diào)控機(jī)制。本論文的研究工作主要從以下四個(gè)方面展開(kāi):第一,利用生物信息學(xué)手段對(duì)S4I途徑中的反應(yīng)調(diào)控蛋白R(shí)srR進(jìn)行分析:根據(jù)RsrR蛋白的氨基酸序列,利用在線分析軟件對(duì)RsrR蛋白的理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)以及三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了預(yù)測(cè)和分析,結(jié)果表明RsrR為胞內(nèi)親水性穩(wěn)定蛋白,無(wú)跨膜螺旋和信號(hào)肽。此外,根據(jù)RsrR蛋白的氨基酸序列,利用在線軟件,對(duì)RsrR蛋白的的保守性氨基酸位點(diǎn)進(jìn)行了分析,同時(shí)還對(duì)... 

【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫酸鹽代謝途徑調(diào)控機(jī)制研究


圖1.1喜溫硫桿菌中的硫氧化代謝圖(Chen?eM/.,2012)??Figure?1.1?The?model?of?sulfur?oxidation?in?A.?caldus.?(Chen?et?al.,?2012)??

模型圖,硫代硫酸鹽,周質(zhì),模型


?,?p;??圖1.1喜溫硫桿菌中的硫氧化代謝圖(Chen?eM/.,2012)??Figure?1.1?The?model?of?sulfur?oxidation?in?A.?caldus.?(Chen?et?al.,?2012)??1.3嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫黢鹽的氧化??硫代硫酸鹽(S2032_)是幾乎所有硫氧化微生物氧化的關(guān)鍵硫代謝中間體,??在地球化學(xué)硫循環(huán)中起重要作用。(Ghosh?and?Dam,?2009;?Welte?era/.,2009)。在??嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫酸鹽主要通過(guò)連四硫酸鹽介導(dǎo)的的硫代硫酸鹽代謝??途徑(S4I)和Sox系統(tǒng)兩種途徑進(jìn)行代謝。??1.3.1?S4I?途徑??S4I途徑在嗜酸性化學(xué)營(yíng)養(yǎng)細(xì)菌中具有普遍性和重要性。S4I途徑包括連四硫??酸鹽水解酶(TetH或TTH)和硫代硫酸鹽泛醌氧化還原酶(TQO或DoxDA)。??TQO可以將硫代硫酸鹽氧化成連四硫酸鹽,而TetH則可以將連四硫酸鹽水解成??硫代硫酸鹽和其他產(chǎn)物(Rzhepishevska?a/.,?2007;?Wang?a/.,2016)。除了編碼??這兩種酶的基因之外,在A?cflWw的M//基因的上游存在著RsrS-RsrR雙組分??調(diào)控系統(tǒng)(TCS)和一個(gè)轉(zhuǎn)座酶(ISacI)的編碼基因,如//和句〇兩個(gè)基因的轉(zhuǎn)??錄表達(dá)受到RsrS-RsrR雙組分系統(tǒng)的調(diào)控。此外

示意圖,雙組分系統(tǒng),示意圖,磷酸化


indicated?by?grey?arrows.??OmpR是原核生物中典型的雙組分調(diào)控系統(tǒng)OmpR-EnvZ中的反應(yīng)調(diào)控蛋白。??OmpR激活和DNA結(jié)合的過(guò)程如圖1.4所示:OmpR的C末端在3’半位點(diǎn)以高??親和力結(jié)合DNA?(Clb)作為單體(步驟U。作為結(jié)合的結(jié)果,構(gòu)象變化傳遞??至N末端,促進(jìn)磷酸化(步驟2)。兩個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離由連接它們的更長(zhǎng),更動(dòng)??態(tài)的連接子輔助。因此,磷酸化不會(huì)刺激信號(hào)接收結(jié)構(gòu)域釋放DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域??6??

【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]嗜酸性喜溫硫桿菌中連四硫酸鹽介導(dǎo)的硫代硫酸鹽代謝途徑(S4I)的調(diào)控機(jī)制研究[D]. 王兆寶.山東大學(xué) 2017



本文編號(hào):3028605

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