嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫酸鹽代謝途徑調(diào)控機制研究
發(fā)布時間:2021-02-11 05:32
嗜酸性喜溫硫桿菌(Acidithiobacillus caldus,簡稱A.caldus)是一種化能自養(yǎng)細菌,該細菌中度嗜酸嗜熱,能夠氧化元素硫和各種還原性的無機硫化合物,并從中獲得能量和還原力,以此來完成自身的生長代謝。A.caldus是生物冶金的優(yōu)勢菌株,被廣泛應(yīng)用于生物浸出和生物脫硫。A.caldus體內(nèi)存在一套復(fù)雜而又高效的無機硫化合物的代謝系統(tǒng)。其中,硫代硫酸鹽是在整個硫代謝系統(tǒng)中非常重要的中間代謝產(chǎn)物,它能夠通過連四硫酸鹽介導(dǎo)的硫代硫酸鹽代謝途徑(S4I pathway)以及Sox系統(tǒng)進行代謝。因此,本文旨在揭示S4I途徑的作用和調(diào)控機制,深入了解A.caldus整個硫代謝系統(tǒng),以及相關(guān)的調(diào)控機制。本論文的研究工作主要從以下四個方面展開:第一,利用生物信息學(xué)手段對S4I途徑中的反應(yīng)調(diào)控蛋白RsrR進行分析:根據(jù)RsrR蛋白的氨基酸序列,利用在線分析軟件對RsrR蛋白的理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)以及三級結(jié)構(gòu)進行了預(yù)測和分析,結(jié)果表明RsrR為胞內(nèi)親水性穩(wěn)定蛋白,無跨膜螺旋和信號肽。此外,根據(jù)RsrR蛋白的氨基酸序列,利用在線軟件,對RsrR蛋白的的保守性氨基酸位點進行了分析,同時還對...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1喜溫硫桿菌中的硫氧化代謝圖(Chen?eM/.,2012)??Figure?1.1?The?model?of?sulfur?oxidation?in?A.?caldus.?(Chen?et?al.,?2012)??
?,?p;??圖1.1喜溫硫桿菌中的硫氧化代謝圖(Chen?eM/.,2012)??Figure?1.1?The?model?of?sulfur?oxidation?in?A.?caldus.?(Chen?et?al.,?2012)??1.3嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫黢鹽的氧化??硫代硫酸鹽(S2032_)是幾乎所有硫氧化微生物氧化的關(guān)鍵硫代謝中間體,??在地球化學(xué)硫循環(huán)中起重要作用。(Ghosh?and?Dam,?2009;?Welte?era/.,2009)。在??嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫酸鹽主要通過連四硫酸鹽介導(dǎo)的的硫代硫酸鹽代謝??途徑(S4I)和Sox系統(tǒng)兩種途徑進行代謝。??1.3.1?S4I?途徑??S4I途徑在嗜酸性化學(xué)營養(yǎng)細菌中具有普遍性和重要性。S4I途徑包括連四硫??酸鹽水解酶(TetH或TTH)和硫代硫酸鹽泛醌氧化還原酶(TQO或DoxDA)。??TQO可以將硫代硫酸鹽氧化成連四硫酸鹽,而TetH則可以將連四硫酸鹽水解成??硫代硫酸鹽和其他產(chǎn)物(Rzhepishevska?a/.,?2007;?Wang?a/.,2016)。除了編碼??這兩種酶的基因之外,在A?cflWw的M//基因的上游存在著RsrS-RsrR雙組分??調(diào)控系統(tǒng)(TCS)和一個轉(zhuǎn)座酶(ISacI)的編碼基因,如//和句〇兩個基因的轉(zhuǎn)??錄表達受到RsrS-RsrR雙組分系統(tǒng)的調(diào)控。此外
indicated?by?grey?arrows.??OmpR是原核生物中典型的雙組分調(diào)控系統(tǒng)OmpR-EnvZ中的反應(yīng)調(diào)控蛋白。??OmpR激活和DNA結(jié)合的過程如圖1.4所示:OmpR的C末端在3’半位點以高??親和力結(jié)合DNA?(Clb)作為單體(步驟U。作為結(jié)合的結(jié)果,構(gòu)象變化傳遞??至N末端,促進磷酸化(步驟2)。兩個結(jié)構(gòu)域的分離由連接它們的更長,更動??態(tài)的連接子輔助。因此,磷酸化不會刺激信號接收結(jié)構(gòu)域釋放DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域??6??
【參考文獻】:
博士論文
[1]嗜酸性喜溫硫桿菌中連四硫酸鹽介導(dǎo)的硫代硫酸鹽代謝途徑(S4I)的調(diào)控機制研究[D]. 王兆寶.山東大學(xué) 2017
本文編號:3028605
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1喜溫硫桿菌中的硫氧化代謝圖(Chen?eM/.,2012)??Figure?1.1?The?model?of?sulfur?oxidation?in?A.?caldus.?(Chen?et?al.,?2012)??
?,?p;??圖1.1喜溫硫桿菌中的硫氧化代謝圖(Chen?eM/.,2012)??Figure?1.1?The?model?of?sulfur?oxidation?in?A.?caldus.?(Chen?et?al.,?2012)??1.3嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫黢鹽的氧化??硫代硫酸鹽(S2032_)是幾乎所有硫氧化微生物氧化的關(guān)鍵硫代謝中間體,??在地球化學(xué)硫循環(huán)中起重要作用。(Ghosh?and?Dam,?2009;?Welte?era/.,2009)。在??嗜酸性喜溫硫桿菌中硫代硫酸鹽主要通過連四硫酸鹽介導(dǎo)的的硫代硫酸鹽代謝??途徑(S4I)和Sox系統(tǒng)兩種途徑進行代謝。??1.3.1?S4I?途徑??S4I途徑在嗜酸性化學(xué)營養(yǎng)細菌中具有普遍性和重要性。S4I途徑包括連四硫??酸鹽水解酶(TetH或TTH)和硫代硫酸鹽泛醌氧化還原酶(TQO或DoxDA)。??TQO可以將硫代硫酸鹽氧化成連四硫酸鹽,而TetH則可以將連四硫酸鹽水解成??硫代硫酸鹽和其他產(chǎn)物(Rzhepishevska?a/.,?2007;?Wang?a/.,2016)。除了編碼??這兩種酶的基因之外,在A?cflWw的M//基因的上游存在著RsrS-RsrR雙組分??調(diào)控系統(tǒng)(TCS)和一個轉(zhuǎn)座酶(ISacI)的編碼基因,如//和句〇兩個基因的轉(zhuǎn)??錄表達受到RsrS-RsrR雙組分系統(tǒng)的調(diào)控。此外
indicated?by?grey?arrows.??OmpR是原核生物中典型的雙組分調(diào)控系統(tǒng)OmpR-EnvZ中的反應(yīng)調(diào)控蛋白。??OmpR激活和DNA結(jié)合的過程如圖1.4所示:OmpR的C末端在3’半位點以高??親和力結(jié)合DNA?(Clb)作為單體(步驟U。作為結(jié)合的結(jié)果,構(gòu)象變化傳遞??至N末端,促進磷酸化(步驟2)。兩個結(jié)構(gòu)域的分離由連接它們的更長,更動??態(tài)的連接子輔助。因此,磷酸化不會刺激信號接收結(jié)構(gòu)域釋放DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域??6??
【參考文獻】:
博士論文
[1]嗜酸性喜溫硫桿菌中連四硫酸鹽介導(dǎo)的硫代硫酸鹽代謝途徑(S4I)的調(diào)控機制研究[D]. 王兆寶.山東大學(xué) 2017
本文編號:3028605
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3028605.html
最近更新
教材專著