目的:隨著對乳腺癌發(fā)病機制的進一步了解,有許多與乳腺癌相關(guān)的信號通路和治療靶點被發(fā)現(xiàn)。本研究通過使用生物信息學(xué)分析以及實驗驗證發(fā)現(xiàn)競爭性內(nèi)源RNA（ceRNA）網(wǎng)絡(luò)與SSP411基因?qū)τ谌橄侔┑陌l(fā)生和發(fā)展有影響。方法:1.從腫瘤基因組圖譜（TCGA）數(shù)據(jù)庫下載芯片數(shù)據(jù),在R軟件上分析得到差異的長鏈非編碼RNA（lncRNA）,構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)并進行GO和KEGG的富集分析。通過考慮每個與預(yù)后相關(guān)的lncRNA的功效,在多變量Cox回歸分析中擬合與預(yù)后相關(guān)lncRNA,構(gòu)建風(fēng)險評分模型。2.構(gòu)建SSP411敲除載體,通過細胞轉(zhuǎn)染將構(gòu)建好的載體轉(zhuǎn)入乳腺癌細胞SKBR3中,篩選獲得SSP411敲除的穩(wěn)定表達細胞株SKBR3-SSP411^-/-,通過Real-time PCR及Western Blot等實驗手段,根據(jù)基因表達結(jié)果、蛋白表達結(jié)果及細胞驗證的實驗結(jié)果來探究SSP411對于乳腺癌細胞SKBR3的影響。結(jié)果:1.本研究結(jié)果顯示,有5個lncRNA與乳腺癌的預(yù)后相關(guān)。這五個lncRNA不僅在ceRNA網(wǎng)絡(luò)中處于關(guān)鍵節(jié)點,而且與乳腺癌患者的總體預(yù)后生存也相關(guān)。2.成... 

【文章來源】：桂林醫(yī)學(xué)院廣西壯族自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

mRNA差異表達分析及KEGG富集分析

圖 2 lncRNA 差異表達分析Figure 2 Differential expression of lncRNA熱圖顯示，與正常組織相比，乳腺癌組織中有 106 種異常表達的 lncRNA。他們被認為是乳腺癌起始相關(guān)的。

圖 3 乳腺癌患者 DEmiRNAs 的 Kaplan-Meier 曲線分析Figure 3 Kaplan-Meier curve analysis of DEMINAs in breast cancer patients（A）乳腺癌中has-mir-3200的Kaplan-Meier曲線分析。（B）乳腺癌中has-mir-1258的Kaplan-Meier曲線分析。（C）乳腺癌中 has-mir-183 的 Kaplan-Meier 曲線分析。(D) 乳腺癌中 has-mir-21 的

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Nanoparticle-linked antagonist for leptin signaling inhibition in breast cancer[J]. Tia Harmon,Adriana Harbuzariu,Viola Lanier,Crystal C Lipsey,Ward Kirlin,Lily Yang,Ruben R Gonzalez-Perez.  World Journal of Clinical Oncology. 2017(01)



本文編號：2983370