劇毒鵝膏等溫擴增檢測及鵝膏毒素基因多樣性研究
發(fā)布時間:2021-01-11 18:42
誤食野生蘑菇中毒事件近年來在我國頻頻發(fā)生,已成為我國食物中毒事件中導(dǎo)致死亡的最主要因素,并且80%以上的蘑菇中毒死亡都是由劇毒的鵝膏菌所引起。中毒后蘑菇種類的早期鑒定對于中毒診斷和治療具有非常重要的作用,然而,由于鵝膏菌物種的多樣性以及往往中毒現(xiàn)場樣本的不完整性,形態(tài)鑒定又需要專業(yè)分類工作者,同時,目前的分子生物學(xué)鑒定需要PCR儀和DNA測序,所需時間長,難以滿足基層疾控和醫(yī)療單位對毒蘑菇中毒后需要快速鑒定毒源的要求。此外,目前劇毒鵝膏等含鵝膏毒素物種的轉(zhuǎn)錄組信息數(shù)據(jù)不足,相關(guān)毒素基因家族研究也正成為研究熱點,還有更多新的環(huán)肽基因及其編碼的肽類物質(zhì)有待發(fā)現(xiàn)。本文從劇毒鵝膏等溫擴增檢測方法的建立、劇毒鵝膏等子實體的de novo轉(zhuǎn)錄組測序、鵝膏毒素基因及脯氨酰寡肽酶基因(POP)的多樣性等方面展開了研究,主要結(jié)果如下:1.基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),以內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)作為靶序列,針對歐美的雙孢鵝膏Amanita bisporigera、綠蓋鵝膏A.phalloides以及我國的致命鵝膏A.exit...
【文章來源】:湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:138 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
α-AMA和PHA基因的cDNA和氨基酸序列的比對[61]
圖1-3鵝膏環(huán)肽的生物合成Figure 1-3 Biosynthesis of Amanita cyclopeptides.1.4. 環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)的研究進展環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新型的核酸分子擴增技術(shù),在 2000 年由 Notomi 等日本科學(xué)家發(fā)明,該技術(shù)基于靶基因的 6 個不同區(qū)域設(shè)計 4 條引物,利用鏈置換型 Bst DNA 聚合酶在恒溫條件(65 °C 左右)進行擴增反應(yīng),1 小時內(nèi)即可實現(xiàn) 109-1010倍的核酸擴增[74]。1.4.1 LAMP 反應(yīng)的原理
博士學(xué)位論文16圖1-4 LAMP反應(yīng)示意圖Figture 1-4 Schematic representation of the LAMP reaction.A. 引物及結(jié)合位點;B. 啞鈴結(jié)構(gòu)形成階段;C. 循環(huán)擴增階段1.4.2 LAMP 的特點第一、特異性強。LAMP 反應(yīng)需要四條特異性引物,分別對應(yīng)靶基因上 6
【參考文獻】:
期刊論文
[1]一起劇毒蘑菇新種假淡紅鵝膏中毒事件調(diào)查研究[J]. 周亞娟,俞紅,朱姝,章軼哲,李海蛟. 中國食品衛(wèi)生雜志. 2018(05)
[2]廣東省首起誤食劇毒裂皮鵝膏菌所致食物中毒死亡分析[J]. 倪錫河,張澤武,黃瓊,張巧利,葉新,張萌,鄧旺秋. 中國食品衛(wèi)生雜志. 2018(01)
[3]Smartphone-Imaged HIV-1 Reverse-Transcription Loop-Mediated Isothermal Ampliflcation(RT-LAMP) on a Chip from Whole Blood[J]. Gregory L.Damhorst,Carlos Duarte-Guevara,Weili Chen,Tanmay Ghonge,Brian T.Cunningham,Rashid Bashir. Engineering. 2015(03)
[4]致命天使之劇毒鵝膏[J]. 蔡箐,楊祝良. 生命世界. 2015(03)
[5]白斑綜合癥病毒超分支滾環(huán)檢測試紙的構(gòu)建及應(yīng)用[J]. 趙玉然,尹偉力,岳志芹,李八方. 武漢大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2014(01)
[6]超高效液相色譜-電噴霧離子化-四級桿飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜指紋圖譜檢測毒蕈中4種鵝膏肽類毒素[J]. 柳潔,丁文婕,何碧英,羅蘭,黃薔. 分析化學(xué). 2013(04)
[7]大型經(jīng)濟真菌的DNA條形碼研究——以我國劇毒鵝膏為例[J]. 蔡箐,唐麗萍,楊祝良. 植物分類與資源學(xué)報. 2012(06)
[8]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增法快速檢測乳中阪崎腸桿菌[J]. 董鑫悅,滿朝新,盧雁,郭穎,王今雨,楊相宜,郎友,龐心怡,姜毓君. 食品工業(yè)科技. 2013(05)
[9]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增法對乙肝病毒的快速檢測和分型[J]. 馬寅眾,李琦,李奎,王嵐,余曉麗,劉志國. 華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2012(01)
[10]一起淡玫紅鵝膏菌中毒事件處置報告[J]. 曹若明,劉仲,張濟,劉守欽,孫延斌,張軍,劉素華,劉嵐錚,曹小麗,賈堂宏. 山東大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2011(12)
本文編號:2971284
【文章來源】:湖南師范大學(xué)湖南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:138 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
α-AMA和PHA基因的cDNA和氨基酸序列的比對[61]
圖1-3鵝膏環(huán)肽的生物合成Figure 1-3 Biosynthesis of Amanita cyclopeptides.1.4. 環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)的研究進展環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新型的核酸分子擴增技術(shù),在 2000 年由 Notomi 等日本科學(xué)家發(fā)明,該技術(shù)基于靶基因的 6 個不同區(qū)域設(shè)計 4 條引物,利用鏈置換型 Bst DNA 聚合酶在恒溫條件(65 °C 左右)進行擴增反應(yīng),1 小時內(nèi)即可實現(xiàn) 109-1010倍的核酸擴增[74]。1.4.1 LAMP 反應(yīng)的原理
博士學(xué)位論文16圖1-4 LAMP反應(yīng)示意圖Figture 1-4 Schematic representation of the LAMP reaction.A. 引物及結(jié)合位點;B. 啞鈴結(jié)構(gòu)形成階段;C. 循環(huán)擴增階段1.4.2 LAMP 的特點第一、特異性強。LAMP 反應(yīng)需要四條特異性引物,分別對應(yīng)靶基因上 6
【參考文獻】:
期刊論文
[1]一起劇毒蘑菇新種假淡紅鵝膏中毒事件調(diào)查研究[J]. 周亞娟,俞紅,朱姝,章軼哲,李海蛟. 中國食品衛(wèi)生雜志. 2018(05)
[2]廣東省首起誤食劇毒裂皮鵝膏菌所致食物中毒死亡分析[J]. 倪錫河,張澤武,黃瓊,張巧利,葉新,張萌,鄧旺秋. 中國食品衛(wèi)生雜志. 2018(01)
[3]Smartphone-Imaged HIV-1 Reverse-Transcription Loop-Mediated Isothermal Ampliflcation(RT-LAMP) on a Chip from Whole Blood[J]. Gregory L.Damhorst,Carlos Duarte-Guevara,Weili Chen,Tanmay Ghonge,Brian T.Cunningham,Rashid Bashir. Engineering. 2015(03)
[4]致命天使之劇毒鵝膏[J]. 蔡箐,楊祝良. 生命世界. 2015(03)
[5]白斑綜合癥病毒超分支滾環(huán)檢測試紙的構(gòu)建及應(yīng)用[J]. 趙玉然,尹偉力,岳志芹,李八方. 武漢大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2014(01)
[6]超高效液相色譜-電噴霧離子化-四級桿飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜指紋圖譜檢測毒蕈中4種鵝膏肽類毒素[J]. 柳潔,丁文婕,何碧英,羅蘭,黃薔. 分析化學(xué). 2013(04)
[7]大型經(jīng)濟真菌的DNA條形碼研究——以我國劇毒鵝膏為例[J]. 蔡箐,唐麗萍,楊祝良. 植物分類與資源學(xué)報. 2012(06)
[8]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增法快速檢測乳中阪崎腸桿菌[J]. 董鑫悅,滿朝新,盧雁,郭穎,王今雨,楊相宜,郎友,龐心怡,姜毓君. 食品工業(yè)科技. 2013(05)
[9]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增法對乙肝病毒的快速檢測和分型[J]. 馬寅眾,李琦,李奎,王嵐,余曉麗,劉志國. 華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2012(01)
[10]一起淡玫紅鵝膏菌中毒事件處置報告[J]. 曹若明,劉仲,張濟,劉守欽,孫延斌,張軍,劉素華,劉嵐錚,曹小麗,賈堂宏. 山東大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2011(12)
本文編號:2971284
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