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基于5個(gè)免疫基因序列的金線鲃屬魚類分子系統(tǒng)發(fā)育和選擇壓力分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-02 18:49
  金線鲃屬(Sinocyclocheilus)隸屬于鯉形目(Cypriniformes)鯉科(Cyprinidae)鲃亞科(Barbinae),是中國特有屬魚類。該屬魚類與洞穴聯(lián)系密切,分化強(qiáng)烈,物種數(shù)多;谛螒B(tài)學(xué)和不同分子標(biāo)記對金線鲃屬魚類系統(tǒng)發(fā)育的研究還存在一定的爭議,因此金線鲃屬魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系并沒有完全解決。同時(shí),大量研究表明,天然免疫基因通過啟動模式識別受體和干擾素等細(xì)胞因子對外界病原體進(jìn)行識別以及參與免疫應(yīng)答過程,在生物進(jìn)化歷程中,免疫基因會受到環(huán)境的選擇作用,受到正選擇壓力的基因可使物種或個(gè)體更具繁殖和生存上的優(yōu)勢。目前尚未見金線鲃屬魚類免疫基因選擇壓力的相關(guān)研究,因此基于免疫基因序列對金線鲃屬魚類進(jìn)行選擇壓力分析有利于了解金線鲃屬魚類的適應(yīng)性進(jìn)化問題。本研究通過PCR直接測序法一共獲得了16種金線鲃屬魚類IFIH1、NOD1基因的編碼區(qū)部分序列(有效長度327bp、174bp)、22種金線鲃屬魚類IRF-2、TLR4的基因編碼區(qū)部分序列(有效長度123bp、450bp)、23種金線鲃屬魚類TLR7基因的編碼區(qū)部分序列(有效長度504bp)。通過分析它們的合并數(shù)據(jù)集對所... 

【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于5個(gè)免疫基因序列的金線鲃屬魚類分子系統(tǒng)發(fā)育和選擇壓力分析


圖1-1麻花金線耙形態(tài)學(xué)左側(cè)C引自劉濤)??

形態(tài)學(xué),洞穴,麻花,體表


金線鈀的很多性狀也表現(xiàn)出與洞穴生活的高度適應(yīng)性。金線鈀洞穴種與環(huán)境的高度適應(yīng)??性具體表現(xiàn)在體表色素的缺失、眼睛的退化、頭部形態(tài)變化和體鱗的變化等形態(tài)學(xué)方面,??因而金線鈀地表種與洞穴種在形態(tài)特征上存在明顯差異,以圖1-1地表種麻花金線鈀??(iS'.ffjaci/tows)和圖1-2洞穴種鷹嗓角金線(Xagw/Zzorwes)魚巴為例。??圖1-1麻花金線耙形態(tài)學(xué)左側(cè)C引自劉濤)??麻花金線鈀形態(tài)特征簡介:體側(cè)扁,頭背部無明顯隆起,但背部稍隆起;頭側(cè)扁,??3??

系統(tǒng)發(fā)育,類群,小眼,單源


早期的金線鈀系統(tǒng)發(fā)育主要基于形態(tài)學(xué),單鄉(xiāng)紅等研宄結(jié)果證明金線鈀魚類為一個(gè)??單源群,小眼金線鈀類群是金線鈀首先分化出的類群,大鱗金線鈀類群和撫仙金線鈀類??群為姐妹群并且在小眼金線鈀之后才分化出(圖1-3)?[4G]。??P???m??-?rfffl?卜大鱗金載類群????11?A?Simkjiiochi'ilus??_?L?■?4i-+|?觀金__?伽咖_??丨?n?n??B?/V,i///r(w/i>subgeii,?nov??圖1-3金線鈀屬的系統(tǒng)發(fā)育圖(引自單鄉(xiāng)紅等)??王大忠等研宄結(jié)果證明,金線鈀魚類為一個(gè)單源群,與四須鈀親緣關(guān)系較近(圖??1-4?),與裂腹魚有相似的染色體倍性[4|1。??5??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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[3]草魚IRF-2下調(diào)IFN、PKR、PKZ轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)制[D]. 谷美慧.南昌大學(xué) 2015
[4]食肉目TLR1,2和4基因的分子進(jìn)化初步研究[D]. 劉偉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]滇池金線鲃三個(gè)免疫相關(guān)基因的克隆鑒定與免疫應(yīng)答研究[D]. 紀(jì)森林.昆明理工大學(xué) 2014
[6]魚類TLR9及TfR基因的分子進(jìn)化分析[D]. 朱志煌.浙江海洋學(xué)院 2014
[7]中國漢族人群中IFIH1基因多態(tài)性與1型糖尿病的相關(guān)性研究[D]. 楊慧.南京醫(yī)科大學(xué) 2011
[8]雞TLR4和Mx基因遺傳變異及其表達(dá)規(guī)律分析[D]. 劉艷.揚(yáng)州大學(xué) 2011
[9]雞TLR7基因SNP篩選及遺傳多態(tài)性分析[D]. 毛興家.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009



本文編號:2953444

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