B族維生素(VB)是多種水溶性型維生素的通稱,作為輔酶因子參與多種重要的生化反應(yīng),是生物不可或缺的生長因子。然而,近年來基因組學(xué)和生化分析證據(jù)表明,許多微生物盡管含有某類維生素依賴性的酶,卻由于基因的缺失并不能從頭合成該類維生素。這些缺陷型微生物的生理代謝或生態(tài)功能必需依靠外源的維生素或相近的前體分子。因此,不同微生物之間可能憑借維生素的種間傳遞而建立相互作用關(guān)系,對微生物群落結(jié)構(gòu)形成與功能發(fā)揮可能起到重要作用。湖泊中的微生物在生態(tài)系統(tǒng)平衡、重要元素生物地球化學(xué)循環(huán)等過程中發(fā)揮著重要作用。然而,湖泊微生物的種間關(guān)系與維生素合成和利用特征有著何種關(guān)聯(lián)尚未得到深入認(rèn)識(shí)。本研究從武漢市南湖微生物組學(xué)數(shù)據(jù)入手,依據(jù)基因組分析調(diào)查了多種微生物對重要B族維生素合成與利用情況,并結(jié)合物種共現(xiàn)性考察了 B族維生素在微生物種間可能存在的傳遞網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。本研究取得如下主要進(jìn)展:(1)微生物的B族維生素合成途徑和B族維生素必需基因的分布。結(jié)合生化知識(shí)和文獻(xiàn)分析,建立B族維生素合成關(guān)鍵基因模型和B族維生素依賴型基因的列表。對從數(shù)據(jù)庫IMG上下載所得9276個(gè)微生物基因組分析,合成基因和依賴基因,可推測微生物對B... 

【文章來源】：華中師范大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：92 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．２?ＶＢ２合成途徑

圖１．３?ＶＢ３合成途徑。??Ｆｉｇｕｒｅ?１．３?Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｐａｔｈｗａｙ?ｏｆ?ＶＢ２??煙酸的主要合成途徑如圖１．３所示，天門冬氨酸和磷酸二羥丙酮縮合生成喹諾??酸，喹諾酸進(jìn)過磷酸化和脫羧生成煙酸單核苷酸，經(jīng)過腺苷化后生成ＮＡＤ，經(jīng)過??磷酸化形成ＮＡＤＰ［３２］。??５??

圖１．４?ＶＢ５合成途徑。??Ｆｉｇｕｒｅ?１．４?Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｐａｔｈｗａｙ?ｏｆ?ＶＢ５．??泛酸的主要合成途徑如圖１．４所示。ａ－ｋｅｔｏｉｓｏｖａｌｅｒｉｃ?ａｃｉｄ在酮泛解酸輕甲基??轉(zhuǎn)移酶作用下生成酮泛解酸，酮泛解酸在酮泛解酸還原酶的作用下生成泛解酸，??與天冬氨酸脫羧形成的Ｐ－丙氨酸在泛酸合成酶作用下合成泛酸［３３］。??（５）?ＶＢ６??Ｄ－Ｅｒｙｔｈｒｏｓｅ－４－ｐｌｉｏｓｐｌｉ３ｔｅ??：ＧａｐＡ??ｌ－Ｄｅｏｘｙ－Ｄ－＾ｌｕｌｏｓｅ?５－ｐｌｉｏｓｐｈａｔｅ??Ｉ?ＰｄｘＢ??＋?Ｇｌｙｃｅｒａｌｄｅｈｙｄｅ－３－ｐｈｏｓｐｈａｔｅ?ｐｙｒｕｖａｔｅ??３－Ｈｖｄｒｏｘ＼－４－ｐｈｏｓｐｈｏｈｙｄｒｏ＞＾，－ａ－ｋｅｔｏｂｉｉｔ＼Ｔａｔｅ??ＤＸＳ??：ＰｄｘＦ?…￣」??ｉｒ??４－Ｐｈｏｓｐｌｉｏｂｙｄｒｏｘ＼－Ｌ－ｔｌｉｒｅｏｕｉｎｅ?Ｄｅｏｘ＾＾ｈｉｌｃｓｅ?５－ｐｈｏｓｐｈａｔｅ??＾?ＰｄｘＡ?！??ｉ??Ｐｖｒｉｄｏｘｉｕｅ?ｐｈｏｓｐｈａｔｅ??！?ＰｄｘＨ??Ｔ??Ｐ＼ｒｒｉｄｏｘａｌ?ｐｈｏｓｐｈａｔｅ?＜?＞?Ｐ＞ｒｉｉｄｏｘａｍｍｅ?ｐｈｏｓｐｈａｔｅ??圖１．５原核生物中ＶＢ６合成途徑。??Ｆｉｇｕｒｅ?１．５?Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｐａｔｈｗａｙ?ｏｆ?ＶＢ６．??ＶＢ６的主要合成途徑如圖１．５所示。ＰｄｘＡ和ＰｄｘＨ催化吡啶環(huán)的合成

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]芽孢桿菌SK007的分類鑒定及其拮抗植物病原菌的功能分析[J]. 靳澤星,秦婭,王潔麗,杜妮妮,李哲斐,陳衛(wèi)民.  微生物學(xué)通報(bào). 2019(10)
[2]陸地環(huán)境微生物多樣性研究技術(shù)的進(jìn)展[J]. 王孟孟,楊兆光,李海普.  化學(xué)工程與裝備. 2018(08)
[3]海洋噬菌蛭弧菌對對蝦病原菌及其他細(xì)菌的寄生作用[J]. 楊淑專,黃慶輝.  廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 1997(03)
[4]啤酒酵母與幾種乳酸細(xì)菌互生關(guān)系的初探[J]. 王禾,王金鳳,馬永強(qiáng).  黑龍江商學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 1992(02)
[5]海洋細(xì)菌在生物表面和非生物表面附著的研究[J]. 紀(jì)偉尚,許兵,徐懷恕,R.R.Colwell.  青島海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 1991(02)



本文編號(hào)：2935977