天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

當(dāng)前位置:主頁 > 理工論文 > 生物學(xué)論文 >

雀形目NUMT及線粒體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究

發(fā)布時間:2020-12-05 02:50
  世界上現(xiàn)存鳥類的數(shù)量約為1萬種,分屬于40目、247科和2312屬。鳥類作為脊椎動物的一大類群,廣泛分布于世界各地,具有豐富的物種多樣性和基因多樣性。鳥類與人類的生存和發(fā)展息息相關(guān),并在維護(hù)生態(tài)平衡中起到重要的作用。雀形目(Passeriformes)是鳥綱中最大的目(約占總數(shù)60.4%),大多數(shù)雀形目鳥類在早第三紀(jì)(Paleogene)經(jīng)歷了快速進(jìn)化,關(guān)于雀形目的起源及各科間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系錯綜復(fù)雜,是鳥類學(xué)研究中爭論的熱點(diǎn)。由于線粒體的起源與進(jìn)化貫穿整個真核生物的起源與進(jìn)化過程,線粒體DNA具有嚴(yán)格的母性遺傳、較快的進(jìn)化速率等特點(diǎn),是系統(tǒng)進(jìn)化研究良好的分子標(biāo)記。本研究通過第一代測序技術(shù)擴(kuò)增并測定8種雀形目鳥類線粒體基因組,并利用新一代高通量測序技術(shù)對5個紅嘴藍(lán)鵲(Urocissa erythroryncha)個體進(jìn)行cDNA文庫的構(gòu)建及轉(zhuǎn)錄組測序。此外,本研究還通過高通量測序技術(shù)對6種雀形目鳥類和1種鸚形目鳥類進(jìn)行基因組文庫的構(gòu)建及序列的測定,并結(jié)合本課題組已測定的其他鳥類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以及NCBI公共數(shù)據(jù)庫中的相關(guān)數(shù)據(jù),我們探討了如下4個問題:(1)雀形目線粒體基因組結(jié)構(gòu)特征;(2)... 

【文章來源】:安徽師范大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】:147 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

雀形目NUMT及線粒體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究


鳥類線粒體基因順序Fig1-1.Mitochondrialgeneordersinaves

棕背伯勞,全基因組擴(kuò)增,線粒體,凝膠電泳


圖 2-2 棕背伯勞線粒體全基因組擴(kuò)增凝膠電泳檢測圖Fig2-2. Electrophoresis results of amplification of complete mitochondrial genomics in L. schach3.1.2 雀形目 8 種鳥類的線粒體 DNA 特征白頂溪鴝(P. leucocephalus)、銀喉長尾山雀(A. glaucogularis)、灰眶雀鹛(A.morrisonia)、七彩文鳥(E. gouldiae)、棕背伯勞(L. schach)、紅尾伯勞(L. cristatus)、藍(lán)喉歌鴝(L. svecica)和蒙古百靈(M. mongolica)線粒體的 DNA 均為環(huán)狀結(jié)構(gòu),長度、堿基組成和偏選如表 2-4 所示。和前人研究基本相似,8 種雀形目鳥類線粒體基因組均含有 37 個基因:13 個蛋白編碼基因,22 個 tRNA 基因,2 個 rRNA 基因。此外,灰眶雀鹛(A. morrisonia)、蒙古百靈(M. mongolica)和銀喉長尾山雀(A.glaucogularis)包含 2 個 CR 區(qū),其余 5 種鳥類只含有 1 個 CR 區(qū),8 種鳥類 mtDNA序列具有很高的同源性。本研究以白頂溪鴝(P. leucocephalus)作為單控制區(qū)類型的線粒體代表,其結(jié)構(gòu)如圖 2-3、表 2-5。其中外環(huán)代表 H 鏈,內(nèi)環(huán)表示 L 鏈,內(nèi)圈陰影環(huán)表示 GC 含量,2 個 rRNA 和 22 個 tRNA 基因分散在 13 個蛋白質(zhì)編碼基因之間。

蛋白編碼基因,線粒體,雀形目鳥類,終止密碼子


的蛋白編碼基因是 MT-ATP8,長度均為 168 bp,位置均處于 tRNALys基因和 MT-ATP6基因之間,8 種鳥類編碼蛋白基因堿基組成、堿基偏選情況見附件 9-10。除白頂溪鴝(P. leucocephalus)、藍(lán)喉歌鴝(L. svecica)和蒙古百靈(M. mongolica)的 MT-ND2 基因及灰眶雀鹛(A. morrisonia)、白頂溪鴝(P. leucocephalus)、七彩文鳥(E. gouldiae)、紅尾伯勞(L. cristatus)、棕背伯勞(L. schach)的 MT-COX1 基因的起始密碼子為 GTG 外,其余鳥類的其他蛋白編碼基因起始密碼子均為 ATG;8 種雀形目鳥類的 MT-ND5 終止密碼子均為為 AGA;MT-ND3 除銀喉長尾山雀(A.glaucogularis)和灰眶雀鹛(A. morrisonia)的終止密碼子為 TA-外,其余鳥類的終止密碼子均為 TAA;8 種雀形目鳥類的 MT-COX3 和 MT-ND4 基因終止密碼子均為T--、COX1 基因終止密碼子均為 AGG,銀喉長尾山雀(A. glaucogularis)的 MT-ND1和 MT-ND6,紅尾伯勞(L. cristatus)的 MT-ND1 終止密碼子也為 AGG。8 種雀形目鳥類線粒體蛋白編碼基因的起始和終止密碼子比較如下附件 11。本研究 8 個雀形目鳥類的氨基酸密碼子使用頻率見圖 2-4,由圖可以看出,在 20 個密碼子中密碼子 Leu在 8 個雀形目鳥類中的使用頻率均為最高,Cys 使用頻率均為最低。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基因組內(nèi)堿基分布整體均衡與局部不均衡的研究進(jìn)展[J]. 鐘東,趙貴軍,張振書,徐安龍.  遺傳. 2002(03)



本文編號:2898728

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/2898728.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶b01d1***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要刪除請E-mail郵箱bigeng88@qq.com
欧美激情中文字幕综合八区| 国产欧美一区二区三区精品视| 精品亚洲一区二区三区w竹菊| 亚洲欧美国产精品一区二区| 黄色在线免费高清观看| 精品人妻一区二区三区四在线 | 日本三区不卡高清更新二区| 黄色国产自拍在线观看| 亚洲日本久久国产精品久久| 成人国产一区二区三区精品麻豆| 亚洲第一视频少妇人妻系列| 中文字幕高清免费日韩视频| 国产盗摄精品一区二区视频| 久久精品色妇熟妇丰满人妻91 | 亚洲女同一区二区另类| 亚洲av熟女一区二区三区蜜桃| 国产午夜精品亚洲精品国产| 日本黄色高清视频久久| 国产成人免费激情视频| 五月婷婷六月丁香在线观看| 亚洲欧洲日韩综合二区| 欧美日韩国产一级91| 风韵人妻丰满熟妇老熟女av| 91后入中出内射在线| 亚洲国产成人爱av在线播放下载| 国产传媒一区二区三区| 初尝人妻少妇中文字幕在线| 国产精品一区日韩欧美| 亚洲欧美日本国产有色| 丁香六月婷婷基地伊人| 免费观看日韩一级黄色大片| 一区二区福利在线视频| 激情偷拍一区二区三区视频| 国产成人精品国产成人亚洲| 国产精品伦一区二区三区四季| 久久福利视频这里有精品| 亚洲一区在线观看蜜桃| 精品国产亚洲av成人一区| 国产又粗又猛又爽色噜噜 | 99久久精品国产日本| 东京热男人的天堂一二三区|