馬鈴薯StGRAS基因家族鑒定與StGAI基因克隆及其遺傳轉(zhuǎn)化
【學(xué)位單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:Q943.2;S532
【部分圖文】:
霉素(GAs)是一類調(diào)節(jié)植物生長的四環(huán)二萜類植物激素。其生物的發(fā)育過程,如種子萌發(fā)、莖伸長、花粉成熟以及從營養(yǎng)生長到生[75]。在植物的生長發(fā)育中,外界脅迫往往導(dǎo)致生長的停滯,因此生長的信號物質(zhì),此外 GA 信號途徑與植物的其他激素信號途徑一些脅迫響應(yīng)中 GA 起著重要的調(diào)節(jié)作用。在水稻和擬南芥中篩選物合成或信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的突變體來鑒定 GA 感受和信號傳導(dǎo)所必需的蛋了 GA 信號傳導(dǎo)的模型。目前的 GA 信號模型表明,GA 與可溶性受體 GID1 結(jié)合[76],GA-GID1 復(fù)合物隨后與 DELA 蛋白相互作用 蛋白通過 SCF(Skip/Cullin/F-box)復(fù)合物啟動(dòng)泛素-蛋白酶體途徑 E3 泛素酶的作用下 DELLA 被 26S 蛋白酶體降解,DELLA 對 GA[77]。盡管 GA 具有獨(dú)立的信號通路,但是越來越多的證據(jù)表明 GA信號通路出現(xiàn)相互重疊的現(xiàn)象,有研究甚至發(fā)現(xiàn) GA 對 IAA 有正,與 ABA 協(xié)同調(diào)節(jié)植物的一些生理活動(dòng)。
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士學(xué)位論文.2 馬鈴薯 GRAS 基因的定位及命名將獲得的馬鈴薯 GRAS 基因在馬鈴薯數(shù)據(jù)庫中查找其所在的染色體ttp://solanaceae.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/gbrowse/tomato/),將所有序薯上的位置找到,利用軟件 Mapinspect 作圖,得到基因在染色體上的圖 2.1),根據(jù)染色體上基因所處的位置順序進(jìn)行重新命名。分析發(fā)現(xiàn)馬條染色體上都有 GRAS 基因的分布。GRAS 基因在馬鈴薯染色體上分布數(shù)到 7 個(gè)不等,分布的部位也不一樣。將 GRAS 基因在染色體上分布的位依次命名為 StGRAS1-StGRAS52,所有的基因主要分布在染色體的兩端
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士學(xué)位論文、水稻、番茄做進(jìn)化樹進(jìn)行分析。將擬南芥、水稻、番茄的蛋白質(zhì)序列蛋白質(zhì)序列共 189 條其中馬鈴薯 52 條、擬南芥 33 條、番茄 53 條和水使用 MEGA5.1 軟件,采用鄰進(jìn)法(Neighbor-Joining)算法繪制系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)馬鈴薯 StGRAS 家族基因可以分成 8 個(gè)亞家族:SCR、LISLLA、Ls、HAM、PATI、SH 和 SCL3(圖 2.2)。各個(gè)亞家族所在的基因不同,亞家族中 PAT1 和 HMA 家族分別具有 10 條和 15 條。其他亞家R、LISCL、DELLA、SCL3、SHR 家族分別具有 4、8、5、4、4、3、2 StGRAS 基因。在馬鈴薯所有 StGRAS 蛋白的進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,歸A 亞家族的蛋白數(shù)目最多。在馬鈴薯中與擬南芥(AtSCL6、22、27)最原序列為 StGRAS7、StGRA35、StGRA10、StGRA49 四條。
【相似文獻(xiàn)】
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本文編號:2850110
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