黃曲霉調(diào)控因子LaeB及孢子色素合成基因pks1功能的鑒定
【學(xué)位單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類(lèi)】:Q933
【部分圖文】:
引言的身體健康和生命安全。1.1.2 黃曲霉毒素及其危害真菌毒素是真菌在生長(zhǎng)過(guò)程中所產(chǎn)生的次級(jí)代謝產(chǎn)物,其具有生物水平累積效果,導(dǎo)致其能被攜帶到動(dòng)物體液,器官和組織中,最后使動(dòng)物中毒甚至死亡[15]。在生活中最常見(jiàn)的真菌毒素是黃曲霉毒素,它主要是由黃曲霉、寄生曲霉等真菌產(chǎn)生的一類(lèi)具有強(qiáng)毒性和強(qiáng)致癌性的二氫呋喃香豆素衍生物。目前已經(jīng)鑒定確認(rèn)的黃曲霉毒素有 28 種,它們具有較為類(lèi)似的化學(xué)結(jié)構(gòu),其中最為主要的有 4 種:AFB1、AFB2、AFG1和 AFG2(如圖 1-1)[2, 16]。黃曲霉根據(jù)菌核直徑大小可以分為 L 型(大于 400 m)和 S 型(小于 400 m),其中 L 型黃曲霉只能產(chǎn)生 AFB1和 AFB2兩種黃曲霉毒素,而 S 型黃曲霉能產(chǎn)生 AFB1、AFB2、AFG1和 AFG2四種黃曲霉毒素[17, 18]。
圖 2-1 不同真菌中 PKS1 同源蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析。Figure 2-1. Phylogenetic analysis of PKS1 homologous protein from different fungi.然后利用 antiSMASH 在線分析預(yù)測(cè)黃曲霉 pks1 基因所在基因簇,獲得預(yù)測(cè)的黃曲霉分生孢子色素合成基因簇基因類(lèi)型及結(jié)構(gòu)。通過(guò)與米曲霉、黑曲霉和構(gòu)巢曲霉等 5 個(gè)菌種同源基因簇分析比對(duì),發(fā)現(xiàn)該基因簇與米曲霉同源基因簇高度保守,且合成骨架基因 pks1 有 99%的相似度,與黑曲霉 albA(ANI_1_726084)、煙曲霉 alb1(AFUA_2G17600)和構(gòu)巢曲霉 wA(AN8209)三個(gè)黑色素生物合成基因相似性均在 73%以上,但與非曲霉屬的真菌無(wú)花果擬盤(pán)多毛孢的黑色素生物合成骨架基因 PfmaE(PFICI_07101)的相似性僅為 44%(圖 2-2 和附表 1)。上述結(jié)果分析可得,黃曲霉分生孢子色素合成途徑應(yīng)類(lèi)似于黑色素的 DHN 合成途徑。
圖 2-2 黃曲霉分生孢子色素合成基因 pks1 基因簇的同源性比對(duì)Figure 2-2. Homologue alignment of pks1 cluster in A. flavus.2.3.2 黃曲霉分生孢子色素合成基因 pks1 敲除菌株的構(gòu)建與驗(yàn)證利用通過(guò)生物信息學(xué)分析,確認(rèn)了分生孢子色素合成骨架基因?yàn)?pks1。本研究利用同源重組替換的方式敲除目標(biāo)基因,獲得敲除菌株 Δpks1,通過(guò)與野生型菌株分析對(duì)比兩者差異性。敲除原理如圖 2-3A 所示,本實(shí)驗(yàn)使用 double-joint技術(shù)手段獲得用于同源重組的融合片段[98]。通過(guò) PEG 介導(dǎo)的原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化方法將融合片段導(dǎo)入到黃曲霉 CA14 PTs 中。之后利用 pyrG 標(biāo)記初步篩選轉(zhuǎn)化子,多次篩選后,提取轉(zhuǎn)化子基因組 DNA 使用三對(duì)引物篩選正確的轉(zhuǎn)化子。因引物位于目標(biāo)基因內(nèi)部,擴(kuò)增出條帶 P1 則能證明目的基因未能敲除成功。之再使用引物進(jìn)一步擴(kuò)增條帶 P2 和 P3,能確認(rèn)轉(zhuǎn)化子成功敲除目標(biāo)基因。如圖 2-3B 所示,轉(zhuǎn)化子無(wú)法擴(kuò)增出條帶 P1,能擴(kuò)增出目標(biāo)條帶 P2 和 P3,證明轉(zhuǎn)化子是陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,而野生型則與之相反。PCR 結(jié)果圖所示獲得 3 個(gè)陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子并用于后續(xù)試驗(yàn)研究。
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本文編號(hào):2819170
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