基于葉綠體全基因組和核糖體編碼基因的新木姜子屬植物(樟科)的進(jìn)化差異
發(fā)布時(shí)間:2020-08-27 11:17
【摘要】:熱帶的植物往往有復(fù)雜多樣、分布廣泛的特點(diǎn),所以在研究他們的基因組進(jìn)化和生物地理學(xué)時(shí)往往會(huì)受到很多技術(shù)方面的阻礙。樟科植物廣泛分布在熱帶和亞熱帶地區(qū),是熱帶雨林的重要組成物種。全世界大約有3000多種樟科植物。但是今年國(guó)際自然保護(hù)聯(lián)盟紅色名單中樟科植物數(shù)量逐年增長(zhǎng),面臨滅絕的風(fēng)險(xiǎn),同時(shí)由于樟科植物之間缺乏關(guān)鍵性狀特征難以辨認(rèn),對(duì)樟科植物了解甚少,給保護(hù)的研究增加了一定的困難。新木姜子屬植物是樟科的一個(gè)屬,全世界大概有100多種,其中有五十多種分布在中國(guó)。目前對(duì)于新木姜子屬的內(nèi)部親緣關(guān)系及其在科中的進(jìn)化位置的研究非常少,在總結(jié)前人的分子學(xué)研究和形態(tài)學(xué)研究基礎(chǔ)上,我們對(duì)新木姜子屬的系統(tǒng)進(jìn)化位置進(jìn)行了探索。在我們的研究中,我們第一次提出利用全葉綠體基因去討論新木姜子屬的屬內(nèi)屬間親緣關(guān)系,在研究中一共使用16個(gè)新木姜子屬植物和7個(gè)樟科其他屬的植物,使用Mig-seq和下一代側(cè)序的方法得到的全葉綠體基因、核糖體基因、蛋白編碼序列和長(zhǎng)單拷貝序列。我們用Orgasm,Geneniou,OGDraw等進(jìn)行生物學(xué)分析,并構(gòu)建了基于最大似然法的SH-like 系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)表明N.chuii,N.sericea,N.dealbata,N,ovatifolia,N.cambodiana,N.aurata,N.chuii 在同一個(gè)分支A里面,而N.pinninervis,N.zeylanica,N.longipedicellata,N.shingningensis則被歸為分支B里面。另一方面,用蛋白編碼序列,長(zhǎng)單拷貝序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹被證明不能成功的反映出新木姜子屬屬內(nèi)的系統(tǒng)學(xué)關(guān)系,但基于全葉綠體基因與核糖體基因結(jié)合的數(shù)據(jù)可以較準(zhǔn)確的反映出新木姜子屬內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,同時(shí)為新木姜子屬是個(gè)單系類群提供了有力證據(jù)。在綜合幾種數(shù)據(jù)方法的使用后,正如我們的研究所證明的那樣,全葉綠體基因和核糖體核蛋白編碼基因的結(jié)合數(shù)據(jù)開辟了令人興奮的前景。研究新木姜子屬內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育對(duì)我們研究起源和全球氣候變化有一定的意義,并擴(kuò)充了樟科的基因庫。未來我們會(huì)加入更多的物種數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,新木姜子屬內(nèi)進(jìn)化研究也有待繼續(xù)完善。
【學(xué)位授予單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:Q943.2
本文編號(hào):2806031
【學(xué)位授予單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
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本文編號(hào):2806031
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