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乳桿菌屬(Lactobacillus)內(nèi)13個新種的分類

發(fā)布時間:2020-08-17 19:49
【摘要】:東北酸菜是我國傳統(tǒng)的發(fā)酵制品,主要分布在我國東北地區(qū),釀造和食用歷史悠久,以自釀酸菜為采集菌種的來源。西藏地區(qū)的自然發(fā)酵酸奶已經(jīng)有幾千年的歷史,具有獨特的營養(yǎng)價值,它們中都蘊藏著豐富的乳酸菌資源。本研究的目的是通過多相分類手段對從東北酸菜中分離得到的12個潛在乳酸菌新種和從西藏酸奶中分離得到的1個潛在乳酸菌新種進行鑒定,確定它們的分類學地位。采用多相方法進行鑒定,包括16S rRNA基因序列分析,phe S基因序列分析,rpo A基因序列分析,DNA G+C mol%測定,平均核苷酸一致性分析(ANI),脂肪酸甲酯(FAME)分析和表型特征分析。菌株54-2~T與Lactobacillus composti、Lactobacillus floricola、Lactobacillus selangorensis、Lactobacillus perolens、Lactobacillus harbinensis和Lactobacillus shenzhenensis處于一個系統(tǒng)發(fā)育分支,16S rRNA基因序列相似性在90.4-96.5%之間;phe S基因序列相似性在56.7-74.6%之間;rpo A基因序列相似性在57.2-81.6%之間;ANI計算結(jié)果分別在66.26-72.50%之間。菌株54-5~T、143-6~T、247-4~T、17-4~T和143-1~T與Lactobacillus dextrinicus和Lactobacillus concavus處于一個系統(tǒng)發(fā)育分支,16S rRNA基因序列相似性為94.9-99.9%;phe S基因序列相似性在70.1-83.1%之間;rpo A基因序列相似性在81.0-98.3%之間;ANI計算結(jié)果在70.34-81.73%之間。菌株33-7~T、116-2~T、184-8~T、204-8~T、8-1(1)~T,256-3~T和M1575~T與Lactobacillus tucceti、Lactobacillus nodensis、Lactobacillus insicii、Lactobacillus allii、Lactobacillus metriopterae、Lactobacillus terrae、Lactobacillus versmoldensis和Lactobacillus furfuricola處于一個系統(tǒng)發(fā)育分支,16S rRNA基因序列相似性在95.6-100%之間;phe S基因序列相似性在73.1-91.6%之間;rpo A基因序列相似性在78.9-98.2%之間;ANI計算結(jié)果在70.97-89.40%之間。菌株54-2~T、54-5~T、143-6~T、247-4~T、17-4~T、143-1~T、33-7~T、116-2~T、184-8~T、204-8~T、8-1(1)~T、256-3~T和M1575~T的DNA G+C mol%分別為39.96%、40.41%、42.48%、49.01%、41.47%、40.81%、35.56%、36.16%、34.57%、36.52%、36.71%、36.62%、39.36%。菌株54-2~T、54-5~T、143-6~T、17-4~T和33-7~T的主要脂肪酸為C16:0和C18:1ω9c,菌株247-4~T、143-1~T、116-2~T、8-1(1)~T和M1575~T的主要脂肪酸C16:0,C18:1ω9c和C18:1ω6c/C18:1ω7c,菌株184-8~T、204-8~T和256-3~T的主要脂肪酸為C16:0、C18:1ω9c、C19:1ω6c/C19:0 cycloω10c和C18:1ω6c/C18:1ω7c。本研究采用多項分類方法對13個乳酸菌新種進行鑒定,確定他們的分類學地位,并對13個乳酸菌新種進行命名,命名如下54-2~T(Lactobacillus yilanensis sp.nov.)、54-5~T(Lactobacillus bayanensis sp.nov.)、143-6~T(Lactobacillus mulanensis sp.nov.)、247-4~T(Lactobacillus achengensis sp.nov.)、17-4~T(Lactobacillus wuchangensis sp.nov.)、143-1~T(Lactobacillus gannanensis sp.nov.)、33-7~T(Lactobacillus keshanensis sp.nov.)、116-2~T(Lactobacillus kedongensis sp.nov.)、184-8~T(Lactobacillus baiquanensis sp.nov.)、204-8~T(Lactobacillus jidongensis sp.nov.)、8-1(1)~T(Lactobacillus hulinensis sp.nov.)、256-3~T(Lactobacillus mishanensis sp.nov.)、M1575~T(Lactobacillus zhongbaensis sp.nov.)。
【學位授予單位】:東北農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:TS201.3;Q939.117
【圖文】:

乳桿菌屬,進化樹,基因序列


前 言7圖1-1 乳桿菌屬內(nèi)已知種基于16S rRNA 基因序列的neighbour-joining進化樹Figure1-1 Neighbour-joining phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences showingrelationship between known species in Lactobacillus

進化樹,新種,基因序列


32圖4-1 13個新種與已知種基于16S rRNA基因序列的neighbour-joining進化樹Figure4-1 Neighbour-joining phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences showingrelationship between strain13 new species and known species

系統(tǒng)發(fā)育,乳酸菌,新種,進化樹


33圖4-2 13個乳酸菌新種與系統(tǒng)發(fā)育相關種基于16S rRNA基因序列的neighbour-joining進化樹Figure4-2 Neighbour-joining phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences showingrelationship between strain13 new species and type strains of phylogenetically related species

【參考文獻】

相關期刊論文 前1條

1 程池;楊梅;李金霞;姚粟;胡海蓉;;Biolog微生物自動分析系統(tǒng)——細菌鑒定操作規(guī)程的研究[J];食品與發(fā)酵工業(yè);2006年05期

相關博士學位論文 前1條

1 趙龍玉;益生乳酸菌的篩選及其在食品加工上的應用研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學;2015年



本文編號:2795761

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