發(fā)布時(shí)間：2020-08-04 19:05

【摘要】：AKIRIN2作為一個(gè)高度保守的核內(nèi)因子,通過與其它蛋白形成復(fù)合物來調(diào)控靶基因進(jìn)而發(fā)揮生物學(xué)功能。目前,有關(guān)AKIRIN2蛋白研究主要是集中于肌肉發(fā)育和免疫調(diào)控領(lǐng)域,而對(duì)于akirin2基因自身轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究未見報(bào)道。啟動(dòng)子和miRNA在目的基因的轉(zhuǎn)錄前和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,本研究以雞為模式動(dòng)物,克隆不同品系雞akirin2基因5'-端上游2832 bp序列和3'-端下游417 nt序列,通過生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)獲得miR-142-3p可能靶向akirin2基因3'非翻譯區(qū)(3'UTR),綜合分析miR-142-3p和miR-142-5p的表達(dá)與功能特性,主要研究結(jié)果如下:首先,本研究克隆了海藍(lán)褐雞、AA~+雞和三黃雞的akirin2基因啟動(dòng)子區(qū)2832bp序列,并進(jìn)行序列比對(duì)和生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:蛋雞(海藍(lán)褐雞)和肉雞(AA~+雞和三黃雞)之間一共有38個(gè)SNP位點(diǎn),而AA~+雞和三黃雞之間只有4個(gè)SNP位點(diǎn);通過轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),蛋雞與肉雞間的19個(gè)SNP位點(diǎn)導(dǎo)致了轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)改變,進(jìn)而導(dǎo)致蛋雞和肉雞在轉(zhuǎn)錄因子的種類和數(shù)量上存在差異;通過CpG島預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),蛋雞和肉雞間CpG島序列差異不大,但有較多的SNP位點(diǎn)分布在CpG島內(nèi)。推測(cè)不同品系雞間的akirin2基因啟動(dòng)子調(diào)控機(jī)制存在差異。其次,本研究克隆了海藍(lán)褐雞、AA~+雞和三黃雞的akirin2基因終止密碼子下游3'UTR部分417nt序列,并進(jìn)行序列比對(duì)和生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:三個(gè)品系雞中3'UTR部分序列完全一致,推測(cè)不同品系雞akirin2基因的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制相似,生物信息學(xué)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)miR-142-3p可能靶向3'UTR序列。最后,pri-miR-142部分序列分析表明:三個(gè)品系雞pri-miR-142序列完全一致。miR-142-3p/5p組織表達(dá)譜表明:三個(gè)品系雞中miR-142-3p/5p在各組織中廣泛表達(dá),miR-142-3p/5p的表達(dá)活性與組織發(fā)育和免疫功能相關(guān),并且miR-142-3p相比miR-142-5p可能更具有功能多樣性。miR-142-3p/5p在炎癥模型和疫苗免疫模型的組織表達(dá)譜分析表明,miR-142-3p/5p均參與炎癥反應(yīng)和免疫應(yīng)答,并且在不同免疫組織中發(fā)揮著不同的調(diào)控作用;miR-142-3p和miR-142-5p間表達(dá)活性差異可能與二者的功能特性、不同品系雞性狀以及不同病理過程等相關(guān)。本研究表明akirin2啟動(dòng)子序列SNP位點(diǎn)可能是影響不同品系雞akirin2基因表達(dá)活性差異的關(guān)鍵因素之一。研究akirin2基因啟動(dòng)子及其相關(guān)miR-142表達(dá)與特性,對(duì)于深入理解akirin2基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制和miR-142在炎癥與免疫中的功能與應(yīng)用,具有重要的理論和實(shí)踐意義。
【學(xué)位授予單位】：哈爾濱師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：Q78
【圖文】：

15圖 2-1 akirin2 基因啟動(dòng)子序列 PCR 結(jié)果對(duì)分子量標(biāo)準(zhǔn)；P1-P3：akirin2 基因啟動(dòng)子 Pig.2-1 PCR products of akirin2 gene promoterrelative molecular mass standard; P1-P3: PCR p

圖 2-2 akirin2 基因啟動(dòng)子重組質(zhì)粒單酶切鑒定 DNA 相對(duì)分子量標(biāo)準(zhǔn)；P1-P3：akirin2 基因啟動(dòng)子單酶切產(chǎn)物gle enzyme digestion results of akirin2 gene promoter recombinant prelative molecular mass standard; P1-P3: Single enzyme digestion re基因啟動(dòng)子測(cè)序結(jié)果及不同品系雞序列比對(duì)

圖 2-4 akirin2 基因啟動(dòng)子序列同源性分析：NC_000070.6）；人（GenBank：NC_000006.12）；黑猩獼猴（GenBank: NC_027896.1）；牛（GenBank：NC_03C_006090.5）；AA+雞（GenBank：MK478013）；三黃雞褐雞（GenBank：MK478013）；綠頭鴨（GenBank：NCBank：NC_036854.1）；斑馬魚（GenBank：NC_00713130681.1）；澳洲咸水鱷（GenBank：NW_017728918.1）；NW_019776320.1）Fig.2-3 Homologous analysis of akirin2 gene promoterenBank: NC_000070.6); Homo sapiens(GenBank： NC_nBank: NC_036885.1); Macaca mulatta(GenBank: NC_0: NC_037336.1); Gallus gallus(Genbank: NC_006090.5);A; Sanhuang broiler(GenBank: MK478014); Hi-Line Brown lAnas platyrhynchos(GenBank: NC_040048.1); Salvelinus a1); Danio rerio(GenBank： NC_007131.7); Xenopus tropic

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前8條

1 王萬霞;黃锎靚;劉賀賀;代飛;寇潔;李亮;王繼文;;Akirin2基因在肉鴨胸肌和腿肌中的發(fā)育表達(dá)研究[J];中國(guó)家禽;2010年09期

2 郭豫杰;高會(huì)貞;李宏基;王月影;李奎;楊國(guó)宇;;豬akirin2基因的組織表達(dá)譜及序列分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年01期

3 劉傳高;鐘楚紅;任廣彩;朱嬌嬌;趙大偉;葉俊賢;趙兵;溫良海;陳瑞愛;;雞Akirin2基因?qū)魅拘苑ㄊ夏也〔《綱P2 DNA疫苗免疫反應(yīng)的影響[J];中國(guó)獸醫(yī)科學(xué);2016年09期

4 Ma J S;晉大鵬;;天府肉羊Akirin2基因的分子克隆、序列分析及組織特異性表達(dá)[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2014年10期

5 任廣彩;劉傳高;黃妙容;黃文科;鐘楚紅;劉郁夫;陳瑞愛;;雞Akirin2和GM-CSF促進(jìn)傳染性法氏囊病病毒VP2基因DNA疫苗免疫效果的研究[J];動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2017年10期

6 穆衛(wèi)濤;常楊;趙冬雪;滿朝來;;LPS誘導(dǎo)不同品系雛雞炎癥反應(yīng)相關(guān)基因的差異表達(dá)分析[J];中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào);2016年06期

7 徐志坤;薄聯(lián)峰;溫俊歌;孫巖;郜原;吳江;張德禮;;豬Akirin2基因的定位及其影響IL-1β和IL-6 mRNA表達(dá)的研究[J];中國(guó)獸醫(yī)雜志;2011年11期

8 代飛;黃锎靚;劉賀賀;韓春春;李亮;王繼文;;鴨Akirin2基因克隆、序列分析與組織表達(dá)特性研究[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2011年01期

相關(guān)會(huì)議論文 前1條

1 郭豫杰;楊國(guó)宇;魯維飛;韓立強(qiáng);朱河水;王江;;靶向Akirin2基因的shRNA基因沉默表達(dá)載體的構(gòu)建[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第七屆全國(guó)代表大會(huì)暨第十三次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前8條

1 徐思凡;不同品系雞akirin2基因調(diào)控序列及相關(guān)miR-142的克隆與表達(dá)分析[D];哈爾濱師范大學(xué);2019年

2 代飛;鴨Akirin2基因的克隆、序列分析及在組織和成肌細(xì)胞中的表達(dá)特性分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

3 李宗恩;雞TMEM9B同源基因的克隆及Akirin2基因的免疫功能研究[D];哈爾濱師范大學(xué);2012年

4 常楊;不同品系雞akirin2和miR-155的克隆與表達(dá)特性分析[D];哈爾濱師范大學(xué);2015年

5 曹金鎖;豬Akirin2基因的分子克隆及體外誘導(dǎo)表達(dá)[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年

6 徐志坤;豬Akirin2蛋白亞細(xì)胞定位及對(duì)IL-1β和IL-6 mRNA表達(dá)的影響[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2011年

7 劉傳高;IBD VP2 DNA疫苗及雞Akirin2和GM-CSF對(duì)其免疫調(diào)節(jié)效果的研究[D];華南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

8 穆衛(wèi)濤;LPS誘導(dǎo)雞幾個(gè)炎癥反應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控研究[D];哈爾濱師范大學(xué);2016年

本文編號(hào)：2780965