菠菜SpoRaf28基因克隆及其高溫應答功能分析
發(fā)布時間:2020-07-12 16:49
【摘要】:非生物脅迫對植物生長有明顯影響,其中高溫脅迫嚴重影響植物生長發(fā)育和產量。研究植物高溫應答分子機制對于農作物改良具有重要意義。菠菜(Spinacia oleracea L.)是耐冷不耐熱的蔬菜,在我國北方廣泛種植。菠菜不適合長距離運輸,導致夏季南方菠菜供應不足,培育耐熱菠菜品種并在南方推廣種植具有重要意義。我們培育了菠菜耐熱材料Sp75,并開始利用分子生物學手段研究菠菜高溫應答機制。促絲裂素原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)級聯信號通路在植物發(fā)育與高溫應答過程中都具有重要作用。該通路由逐級激活的三級激酶MAP3K、MAP2K和MAPK通過順序磷酸化發(fā)揮功能。菠菜基因組中有35個MAP3K和5個MAP2K,其高溫應答模式和相互調控關系并不清楚。本研究在全基因組范圍內分析了SpoMAP3K家族的35個成員,其與擬南芥(Arabidopsis thaliana)、甜菜(Beta vulgaris L.)、藜麥(Chenopodium quinoa Willd)、南瓜(Cucurbita moschata L)、筍瓜(Cucurbita maxima Duch.)、黃瓜(Cucumis sativus L)等植物的MAP3K蛋白同源性較高,該蛋白的激酶結構域、磷酸化功能位點、半胱氨酸位點都較為保守。我們克隆了SpoMAP3K家族中SpoRaf28基因,其最大開放閱讀框為1101bp,共編碼366個氨基酸。利用煙草瞬時表達技術,對SpoRaf28進行亞細胞定位,結果顯示該蛋白定位于細胞質中。熒光定量PCR分析表明,高溫脅迫下在菠菜熱敏感材料Sp73中SpoRaf28基因表達水平沒有顯著差異,而在耐熱型材料Sp75中,SpoRaf28基因表達量顯著上升。菠菜材料Sp75在六葉期和抽薹期SpoRaf28基因表達量在不同組織器官中表達量差異明顯,兩種時期均在葉片表達量最高。菠菜材料Sp75經37℃高溫處理72h后,葉片明顯發(fā)生萎蔫現象,SpoRaf28基因表達量呈上升趨勢,但在不同鹽堿(NaCl、Na_2CO_3、NaHCO_3)與重金屬(CdCl_2)脅迫條件下,葉片表型無明顯現象,SpoRaf28基因表達量下降,這表明SpoRaf28受到高溫誘導,但是受鹽和重金屬脅迫抑制。37℃高溫處理下,過表達SpoRaf28基因的酵母菌株和擬南芥植物的生長都受到促進,這表明SpoRaf28在高溫應答過程中起正調控作用。酵母雙雜交試驗的結果表明SpoRaf28與SpoMAP2Ks不相互作用。我們的結果表明,SpoMAP3K家族成員SpoRaf28在菠菜高溫應答信號通路中起到了正調控作用,為研究MAPK級聯途徑的分子調控機理提供了新的證據。
【學位授予單位】:上海師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q943.2;S636.1
【圖文】:
利用 Primer5 設計基因全長特異性引物。以菠菜 Sp75 的 cDNA 為模板對 SpoRaf28 基因進行 PCR 擴增(圖3-2),將 DNA 擴增產物進行回收,連接克隆載體,轉化至大腸桿菌,將大腸桿菌菌液送生物公司測序。測序結果比對顯示與基因組預期結果吻合。圖 3-1 菠菜 Sp75 葉片總 RNA 凝膠電泳圖譜Fig.3-1 Total RNA of Sp75 leaves28S rRNA18S rRNA
第 3 章 結果 上海師范大學碩士學位論文3.2.3 SpoMAP3K 蛋白家族的系統(tǒng)發(fā)育分析從菠菜基因組數據庫中找到菠菜 MAP3K 家族的 35 個同源蛋白。通過蛋白質序列進行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,如圖 3-5 所示,在陰影部分有 4 個蛋白與菠菜Spo04124(SpoRaf28)最同源,菠菜 Spo04124 與 Spo10743、Spo02347、Spo16751、Spo19902 蛋白親緣關系最近,同源性最高。
293.2.4 SpoRaf28 的親疏水性分析利 用 ExPASy 數 據 庫 提 供 的 計 算 親 疏 水 性 分 布 的 ProtScale 工 具(https://web.expasy.org/protscale/),對 SpoRaf28 蛋白的氨基酸序列進行分析,如圖 3-6 可知,其中正值為疏水性,負值為親水性,結果顯示 SpoRaf28 蛋白具有明顯的親水性;結合亞細胞定位預測結果(https://rostlab.org/services/loctree3/),判斷其編碼蛋白可能位于細胞質中。
本文編號:2752240
【學位授予單位】:上海師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q943.2;S636.1
【圖文】:
利用 Primer5 設計基因全長特異性引物。以菠菜 Sp75 的 cDNA 為模板對 SpoRaf28 基因進行 PCR 擴增(圖3-2),將 DNA 擴增產物進行回收,連接克隆載體,轉化至大腸桿菌,將大腸桿菌菌液送生物公司測序。測序結果比對顯示與基因組預期結果吻合。圖 3-1 菠菜 Sp75 葉片總 RNA 凝膠電泳圖譜Fig.3-1 Total RNA of Sp75 leaves28S rRNA18S rRNA
第 3 章 結果 上海師范大學碩士學位論文3.2.3 SpoMAP3K 蛋白家族的系統(tǒng)發(fā)育分析從菠菜基因組數據庫中找到菠菜 MAP3K 家族的 35 個同源蛋白。通過蛋白質序列進行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,如圖 3-5 所示,在陰影部分有 4 個蛋白與菠菜Spo04124(SpoRaf28)最同源,菠菜 Spo04124 與 Spo10743、Spo02347、Spo16751、Spo19902 蛋白親緣關系最近,同源性最高。
293.2.4 SpoRaf28 的親疏水性分析利 用 ExPASy 數 據 庫 提 供 的 計 算 親 疏 水 性 分 布 的 ProtScale 工 具(https://web.expasy.org/protscale/),對 SpoRaf28 蛋白的氨基酸序列進行分析,如圖 3-6 可知,其中正值為疏水性,負值為親水性,結果顯示 SpoRaf28 蛋白具有明顯的親水性;結合亞細胞定位預測結果(https://rostlab.org/services/loctree3/),判斷其編碼蛋白可能位于細胞質中。
【相似文獻】
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1 張秋楠;菠菜SpoRaf28基因克隆及其高溫應答功能分析[D];上海師范大學;2019年
本文編號:2752240
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