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粟酒裂殖酵母蛋白Ppr10結(jié)構(gòu)與功能的研究

發(fā)布時間:2020-07-01 16:58
【摘要】:粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe,S.pombe)線粒體蛋白Ppr10和Mpa1對線粒體呼吸鏈蛋白的合成非常重要。Ppr10與Mpa1形成復(fù)合體,但是Ppr10與Mpa1如何相互作用并不清楚。本文通過生物信息分析軟件HHpred和HHrepID預(yù)測發(fā)現(xiàn)Ppr10有13個重復(fù)序列,這些重復(fù)序列由35個氨基酸組成,富含亮氨酸。由于Ppr10與PPR蛋白存在相似性以及Ppr10重復(fù)序列與PPR模體存在相似性,因此將這些重復(fù)序列命名為類PPR模體(PPR-like motif)。為了研究這些類PPR模體對Ppr10功能的重要性,本文構(gòu)建了缺失單個或多個類PPR模體的突變菌株。本文分析了這些Ppr10突變體的穩(wěn)定性,Ppr10突變體與Mpa1的互作以及Ppr10突變體的功能。本文研究發(fā)現(xiàn),C-末端截短ppr10結(jié)果顯示,在甘油培養(yǎng)基上(促進有氧呼吸),截短到第9號類PPR模體,不影響突變菌株的生長,不影響Ppr10突變體表達水平,并且不影響Ppr10突變體與Mpa1的相互作用。截短到第8號類PPR模體,嚴(yán)重影響突變菌株的生長,嚴(yán)重影響了Ppr10蛋白表達水平,并破壞了Ppr10突變體與Mpa1的相互作用。敲除單一類PPR模體的結(jié)果顯示,分別缺失1-4號類PPR模體不影響Ppr10與Mpa1的相互作用,但影響突變菌株的生長;分別缺失5-8號類PPR模體破壞了Ppr10與Mpa1的相互作用,并且影響突變菌株的生長;分別缺失9-12號類PPR模體影響了Ppr10與Mpa1的相互作用,但不影響突變菌株的生長。本文研究表明,Ppr10的N端編碼的包含320個氨基酸的蛋白能夠正常表達,并且Ppr10能夠正常發(fā)揮功能;Ppr10的13個類PPR模體中,1-8號類PPR模體對于Ppr10正常發(fā)揮功能是至關(guān)重要的,5-8號類PPR模體對Ppr10與Mpa1相互作用是必不可少的,9-12號類PPR模體對于Ppr10和Mpa1的相互作用很重要。本文為后繼進一步研究Ppr10的結(jié)構(gòu)與功能打下了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:南京師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q78
【圖文】:

模體,結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)


PPR模體結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)圖

序列,模體,序列,序列比對


圖 3 預(yù)測類 PPR 模體序列Figure 3 Sequences of PPR-like motifsA 圖:Ppr10 的類 PPR 模體序列比對,每個類 PPR 模體為 35aa,;B 圖:類 PPR 模體序列 logo

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