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基于微衛(wèi)星標(biāo)記對南海珊瑚群體遺傳學(xué)的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-06-03 16:30
【摘要】:受人類活動(dòng)和氣候變化的雙重影響,南海珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)正快速退化。本研究選取在南海不同緯度珊瑚礁區(qū)廣泛分布的澄黃濱珊瑚(Porites lutea),以及主要分布于低緯度地區(qū)且對溫度比較敏感的鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)為研究對象,揭示南海不同區(qū)域珊瑚之間的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)以及遺傳連通性,這將有助于南海珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的科學(xué)保護(hù)和修復(fù)。雖然適用于廣布的濱珊瑚屬的微衛(wèi)星標(biāo)記已經(jīng)被開發(fā),且在實(shí)際運(yùn)用中十分成熟,但是主要分布于低緯度的鹿角杯形珊瑚卻缺乏微衛(wèi)星標(biāo)記。因此本研究應(yīng)用人工白化的方法獲得了污染較低的鹿角杯形珊瑚的基因組,并利用簡化基因組測序的方法對鹿角杯形珊瑚進(jìn)行微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)。另外,本研究通過9對高多態(tài)性的微衛(wèi)星標(biāo)記對南海6個(gè)地理區(qū)域、14個(gè)不同緯度的共334個(gè)澄黃濱珊瑚個(gè)體進(jìn)行了群體遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性研究,探討了南海澄黃濱珊瑚的有性繁殖方式、不同緯度之間的連通性、以及造成遺傳變異的因素。主要結(jié)論如下(1)采用簡化基因組測序?qū)β菇潜紊汉鬟M(jìn)行了微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā),一共得到鹿角杯形珊瑚微衛(wèi)星引物2786對,并成功驗(yàn)證了7對微衛(wèi)星引物,為南海珊瑚群體遺傳學(xué)的研究提供了新的技術(shù)支撐。(2)南海澄黃濱珊瑚具有豐富的獨(dú)立等位基因型(N/Ng=0.99±0.13),表明南海澄黃濱珊瑚以有性繁殖為主導(dǎo),能夠通過有性繁殖的方式進(jìn)行幼蟲補(bǔ)充。因此,南海的澄黃濱珊瑚群體可能具有較高的遺傳潛力。(3)與南海其他珊瑚礁區(qū)相比,位于大亞灣海區(qū)的澄黃濱珊瑚群體的遺傳多樣性較低,這可能是由于大亞灣邊緣性的地理環(huán)境(冬季低溫)和物種組成的緯度梯度等因素所致。(4)Mantel'test的結(jié)果顯示地理距離和遺傳距離的關(guān)聯(lián)性只有16.12%,表明地理隔離對南海澄黃濱珊瑚的遺傳變異的影響較小,相對高緯度與低緯度之間的遺傳變異可能是由于緯度間環(huán)境因素(如SST)的差異性導(dǎo)致的。(5)微衛(wèi)星標(biāo)記的FsT值揭示,相對高緯度的大亞灣珊瑚群體和其他的珊瑚群體存在顯著的遺傳變異,隨著緯度的降低,差異性越小,低緯度地區(qū)的珊瑚群體間不存在遺傳變異。據(jù)調(diào)查發(fā)現(xiàn),SST的波動(dòng)性隨著緯度的降低逐趨穩(wěn)定。因此,我們推測不同緯度的SST波動(dòng)性的差異導(dǎo)致澄黃濱珊瑚發(fā)生遺傳變異。
【圖文】:

珊瑚礁,采樣區(qū),南海


圖2-1南海珊瑚礁區(qū)采樣區(qū)域圖逡逑Figure邋2-1邋Sampling邋sites邋in邋the邋South邋China邋Sea邋coral邋reefs逡逑

基因組序列,珊瑚,鹿角,杯形


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本文編號(hào):2695089

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