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地黃屬植物全基因組復制與物種分化研究

發(fā)布時間:2020-05-23 00:47
【摘要】:基因組測序已經證明,除了頻繁的小規(guī)模重復之外,在生物進化樹的許多分支上發(fā)現(xiàn)大規(guī)模的重復事件,即全基因組復制(WGD)。大多數(shù)有花植物其實是古多倍體,在其進化早期經歷了一個或多個全基因組復制;蚣颖侗徽J為是進化的加速器,最近的研究表明,多倍體物種能夠增加對不同環(huán)境條件的耐受性,具有更高的適應性。地黃屬在進化歷史上是否經歷全基因組復制事件仍不清楚,本文利用地黃屬轉錄組數(shù)據,通過系統(tǒng)發(fā)育學分析方法估計了14個被子植物的系統(tǒng)關系與分化時間,并使用Ks值分析地黃屬5個物種是否存在WGD事件。研究表明該屬植物在進化歷史上經歷過兩次全基因組復制事件,分別對應核心雙子葉植物共享的γ古六倍體化事件(約116.07~128.28 mya),始新世中-晚期全球從溫室向冰期過渡的關鍵時期(約42.76~48.87 mya)。多次古多倍化事件產生的復制基因對地黃屬的功能進化有重要的影響。復制基因可以為植物基因的功能進化提供重要的材料來源,各種基因家族的復制擴增與減少可能加速了物種的分化,因此我們想探究經歷了多倍化后的受選擇基因在物種進化過程中的遺傳多樣性水平以及這些受選擇基因是否促進了地黃屬植物的分化與適應性。地黃屬的5個種具有不同地理分布與生態(tài)環(huán)境,地理生境的差異性往往導致種內種間自然選擇強度的不同。隨著測序成本降低以及生物信息學技術的發(fā)展,利用高通量轉錄組對生物體基因攜帶的遺傳信息進行深入挖掘的可行性X棜佟N教值鼗剖舾魑鎦摯贍艿納視π,

本文編號:2676869

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