【摘要】：基因組測序已經(jīng)證明,除了頻繁的小規(guī)模重復(fù)之外,在生物進(jìn)化樹的許多分支上發(fā)現(xiàn)大規(guī)模的重復(fù)事件,即全基因組復(fù)制(WGD)。大多數(shù)有花植物其實(shí)是古多倍體,在其進(jìn)化早期經(jīng)歷了一個(gè)或多個(gè)全基因組復(fù)制�；蚣颖侗徽J(rèn)為是進(jìn)化的加速器,最近的研究表明,多倍體物種能夠增加對不同環(huán)境條件的耐受性,具有更高的適應(yīng)性。地黃屬在進(jìn)化歷史上是否經(jīng)歷全基因組復(fù)制事件仍不清楚,本文利用地黃屬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析方法估計(jì)了14個(gè)被子植物的系統(tǒng)關(guān)系與分化時(shí)間,并使用Ks值分析地黃屬5個(gè)物種是否存在WGD事件。研究表明該屬植物在進(jìn)化歷史上經(jīng)歷過兩次全基因組復(fù)制事件,分別對應(yīng)核心雙子葉植物共享的γ古六倍體化事件(約116.07～128.28 mya),始新世中-晚期全球從溫室向冰期過渡的關(guān)鍵時(shí)期(約42.76～48.87 mya)。多次古多倍化事件產(chǎn)生的復(fù)制基因?qū)Φ攸S屬的功能進(jìn)化有重要的影響。復(fù)制基因可以為植物基因的功能進(jìn)化提供重要的材料來源,各種基因家族的復(fù)制擴(kuò)增與減少可能加速了物種的分化,因此我們想探究經(jīng)歷了多倍化后的受選擇基因在物種進(jìn)化過程中的遺傳多樣性水平以及這些受選擇基因是否促進(jìn)了地黃屬植物的分化與適應(yīng)性。地黃屬的5個(gè)種具有不同地理分布與生態(tài)環(huán)境,地理生境的差異性往往導(dǎo)致種內(nèi)種間自然選擇強(qiáng)度的不同。隨著測序成本降低以及生物信息學(xué)技術(shù)的發(fā)展,利用高通量轉(zhuǎn)錄組對生物體基因攜帶的遺傳信息進(jìn)行深入挖掘的可行性X棜�。为探讨地黄属各捂y摯贍艿納視π，

本文編號：2676869