Gliomastix和Phialophora多樣性及分類研究
發(fā)布時(shí)間:2020-05-05 03:51
【摘要】:粘鞭霉屬(Gliomastix),屬子囊菌門(Ascomycota),糞殼菌綱(Sordariomycetes);瓶霉屬(Phialophora),屬子囊菌門(Ascomycota),散囊菌綱(Eurotiomycetes)。兩屬真菌常見而廣布,多營腐生或弱寄生生活,二者普遍生存于土壤。Gliomastix屬真菌在醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)及工業(yè)上具有開發(fā)應(yīng)用前景,Phialophora屬真菌是多種植物和人的致病菌,對兩屬、種的準(zhǔn)確鑒定是研究、利用兩屬真菌的基礎(chǔ)。本研究自2016年至2018年,自貴陽、遵義、凱里、畢節(jié)、福州等地采集土壤標(biāo)本500余份,通過平板稀釋法分離得到300余個(gè)菌株,經(jīng)鑒定,其中11株為粘鞭霉屬,7株為瓶霉屬phialophora-like,在上述城市均分離到粘鞭霉屬,證明該屬廣泛存在于土壤中。另外,山東農(nóng)業(yè)大學(xué)贈送了21株粘鞭霉屬菌株,22株瓶霉屬菌株,采集地為貴州、湖北、海南、廣西、四川和青海等省。對粘鞭霉屬菌株,在形態(tài)學(xué)研究的基礎(chǔ)上,利用ITS、LSU、SSU、tub2和rpb2五個(gè)基因片段,分別通過最大似然法(Maximum Likelihood)、最大簡約法(Maximum Parsimony)和鄰接法(Neighbor-joining tree)構(gòu)建單基因和多基因進(jìn)化樹進(jìn)行系統(tǒng)學(xué)分析,并通過分析各個(gè)基因標(biāo)簽對該屬真菌種的區(qū)分度和可信度(自舉支持率),對5個(gè)基因標(biāo)簽做出評價(jià),結(jié)果:ITS、LSU、tub2和rpb2對種的區(qū)分度較高,分支處的自舉支持率由小到大為:tub2ITSLSUrpb2,SSU對種的區(qū)分度不高,部分近似種不能被區(qū)分開,因此,推薦使用ITS、LSU、tub2和rpb2鑒定粘鞭霉屬。本文鑒定出4個(gè)粘鞭霉屬的種:Gliomastix felina、G.rosegrise、G.murorum和G.polychroma。對于phialophora-like菌株,根據(jù)構(gòu)建的ITS,LSU和tub2基因加合樹及ITS序列單基因進(jìn)化樹,并參考文獻(xiàn),把phialophora-like的種劃分到另外15個(gè)屬,并組建了3個(gè)新組合種:Gaeumannomyces zeicola com.nov.(Deacon,D.B.ScottW.Gams)K.Y.WangY.L.Jiang,G.graminicola com.nov.(Deacon,D.B.ScottW.Gams)K.Y.WangY.L.Jiang Ramophialophora geniculate com.nov.(Emden J.H.Van.)K.Y.WangY.L.Jiang,另外,發(fā)現(xiàn)2個(gè)中國新紀(jì)錄種Capronia leucadendri、Fonsecaea multimorphosa。為比較粘鞭霉屬4個(gè)種和瓶霉屬6個(gè)種的物種間結(jié)構(gòu)差異,對這些種的ITS2的核苷酸序列進(jìn)行了比對分析并預(yù)測其二級結(jié)構(gòu)模型,結(jié)果表明:核苷酸比對構(gòu)建的系統(tǒng)樹與ITS2二級結(jié)構(gòu)特征的比較結(jié)果基本一致,這段高度保守的序列對系統(tǒng)樹的構(gòu)建以及親緣關(guān)系起判定作用,說明ITS2二級結(jié)構(gòu)對兩屬的鑒定和親緣關(guān)系研究有效。本試驗(yàn)所有標(biāo)本和菌株保存于貴州大學(xué)農(nóng)學(xué)院植物病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室標(biāo)本室(HGUP)。
【圖文】:
24圖 1 基于 LSU,ITS 序列對粘鞭霉屬構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹 ML 與 MP 節(jié)點(diǎn)支持率值大于 50%的數(shù)值標(biāo)在分枝處,,以 Acremonium alcalophilum(JCM7366)為外群.Fig. 1 Phylogentic tree of Gliomastix generated from Maximum Likelihood analysis and Maximum Parsimonyanalysis based on combined LSU, ITS sequences. Bootstrap values of ML、MP ≥50%areshownabovethebranches.The tree is rooted with Acremonium alcalophilum(JCM7366).
自舉支持率"g50%顯示在支上ing tree obtained from the 19 rpb2 sequences data. Bootstrap values a
【學(xué)位授予單位】:貴州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q949.32
本文編號:2649494
【圖文】:
24圖 1 基于 LSU,ITS 序列對粘鞭霉屬構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹 ML 與 MP 節(jié)點(diǎn)支持率值大于 50%的數(shù)值標(biāo)在分枝處,,以 Acremonium alcalophilum(JCM7366)為外群.Fig. 1 Phylogentic tree of Gliomastix generated from Maximum Likelihood analysis and Maximum Parsimonyanalysis based on combined LSU, ITS sequences. Bootstrap values of ML、MP ≥50%areshownabovethebranches.The tree is rooted with Acremonium alcalophilum(JCM7366).
自舉支持率"g50%顯示在支上ing tree obtained from the 19 rpb2 sequences data. Bootstrap values a
【學(xué)位授予單位】:貴州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q949.32
【參考文獻(xiàn)】
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1 王毅;劉秋宇;李剛;劉虹;覃瑞;;基于菊科紫菀族ITS2二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測和比較分析[J];中南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2015年04期
2 徐宏發(fā),王靜波;分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展[J];生態(tài)學(xué)雜志;2001年03期
3 李明,王小明;分子系統(tǒng)學(xué)及其應(yīng)用[J];大自然探索;1997年01期
本文編號:2649494
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