3種貂屬動物MHC-DRB遺傳變異的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-04-17 19:47
【摘要】:主要組織相容性復(fù)合體(Major Histocompatibility Complex,MHC)作為選擇性分子標(biāo)記,可以體現(xiàn)物種在進(jìn)化過程中對環(huán)境的適應(yīng)。目前僅有大陸種群及島嶼種群33個(gè)紫貂(Martes zibellina)樣本MHC-DRB基因的初步研究,缺乏較為全面的紫貂亞種及石貂(Martes foina)、歐洲松貂(Martes martes)MHC基因的研究。我們以PCR結(jié)合克隆的方法檢測出8個(gè)亞種紫貂及歐洲松貂、石貂MHC-DRB等位基因并對其進(jìn)行多態(tài)性分析,結(jié)合已發(fā)表的鼬科其他動物MHC-DRB基因綜合分析適應(yīng)性遺傳變異。主要研究結(jié)果如下:(1)在104只紫貂樣本中得到35個(gè)(26個(gè)有效等位基因及9個(gè)缺失1bp的假基因序列)DRB 等位基因(241-242bp),分別命名為 Mazi-DRB*01~Mazi-DRB*35;在 17 只歐洲松貂樣本中得到14個(gè)(11個(gè)有效等位基因及3個(gè)缺失1bp的假基因序列)DRB等位基因(241-242bp),分別命名為Mama-DRB*01~Mama-DRB*14;在10只石貂樣本中得到6個(gè)(3個(gè)有效等位基因及3個(gè)缺失1bp的假基因序列)DRB等位基因(241-242bp),分別命名為 Mafo-DRB*01~Mafo-DRB*06。(2)4種獾屬動物中Meles meles的遺傳多樣性明顯高于其他3種獾屬動物;鼬屬動物中Mustela nivalis遺傳多樣性明顯高于其他3種鼬屬動物;海獺屬遺傳多樣性高于其他大部分貂屬、獾屬、鼬屬動物;貂熊屬動物遺傳多樣性低于其他貂屬、獾屬、鼬屬大部分動物;3種貂屬動物遺傳多樣性差異很小;8個(gè)亞種紫貂種群遺傳多樣性水平比較相近,日本島嶼種群紫貂比大陸種群遺傳多樣性高。(3)紫貂、歐洲松貂、石貂DRB基因抗原結(jié)合位點(diǎn)非同義突變率均大于同義突變率(dN/dS1),受到正向選擇,紫貂非抗原結(jié)合位點(diǎn)dN/dS1,歐洲松貂和石貂所有位點(diǎn)及非抗原結(jié)合位點(diǎn)的dN/dS1,進(jìn)化過程中正向選擇及凈化選擇共同維持3種貂屬動物MHC基因多態(tài)性。(4)3種貂屬動物之間、4種獾屬動物之間、4種鼬屬動物之間及鼬科動物之間DRB基因存在跨物種進(jìn)化現(xiàn)象。(5)以平衡選擇維持3種貂屬動物MHC-DRB基因多態(tài)性。
【圖文】:
逡逑檢測,判斷是否為單一片段且回收產(chǎn)物濃度能否達(dá)到后續(xù)克隆實(shí)驗(yàn)的要求,結(jié)果如圖3-逡逑3所示,,符合后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求。逡逑圖3-3邋PCR產(chǎn)物回收電泳圖(lkb邋DNAMarker)逡逑Fig邋3-3邋PCR邋recycling邋products邋agarose邋gel邋electrophoresis邋(lkb邋DNA邋Marker)逡逑3.2_3陽性克隆檢測逡逑對菌液利用PCR法檢測陽性克隆,目的條帶不含雜帶且亮度很高,大小位于300bp逡逑附近位置(圖3-4)。本次實(shí)驗(yàn)中,總計(jì)挑菌3554個(gè),得到有效序列2459條。逡逑t邋.邐Jv邋<邐,邐二邋/.邋/f邋|邐煍逡逑:>.;,vj::";;?;;;:'i;邐'F邐;l,,.邋,3邋:逡逑圖邋3-4邋菌液邋PCR邋電泳圖(lkb邋DNA邋Marker)逡逑Fig邋3-4邋Bacteria邋solution邋PCR邋products邋agarose邋gel邋electrophoresis邋(lkb邋DNA邋Marker)逡逑3.3貂屬動物MHC-DRB基因多態(tài)性分析逡逑3.3.1等位基因確定逡逑本研宄在104只紫貂樣本中共檢測到35個(gè)MHC-DRB等位基因,長度為241-242逡逑bp邋
圖3-9由鼬科動物DRB等位基因繪制的中接網(wǎng)絡(luò)圖(紅色為未檢測到的過渡等位基因)逡逑Fig邋3-9邋median-joining邋network邋based邋on邋DRB邋alleles邋in邋three邋species邋of邋Mustelidae邋(Red邋represents邋an逡逑undetected邋transition邋allele)逡逑
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q953
【圖文】:
逡逑檢測,判斷是否為單一片段且回收產(chǎn)物濃度能否達(dá)到后續(xù)克隆實(shí)驗(yàn)的要求,結(jié)果如圖3-逡逑3所示,,符合后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求。逡逑圖3-3邋PCR產(chǎn)物回收電泳圖(lkb邋DNAMarker)逡逑Fig邋3-3邋PCR邋recycling邋products邋agarose邋gel邋electrophoresis邋(lkb邋DNA邋Marker)逡逑3.2_3陽性克隆檢測逡逑對菌液利用PCR法檢測陽性克隆,目的條帶不含雜帶且亮度很高,大小位于300bp逡逑附近位置(圖3-4)。本次實(shí)驗(yàn)中,總計(jì)挑菌3554個(gè),得到有效序列2459條。逡逑t邋.邐Jv邋<邐,邐二邋/.邋/f邋|邐煍逡逑:>.;,vj::";;?;;;:'i;邐'F邐;l,,.邋,3邋:逡逑圖邋3-4邋菌液邋PCR邋電泳圖(lkb邋DNA邋Marker)逡逑Fig邋3-4邋Bacteria邋solution邋PCR邋products邋agarose邋gel邋electrophoresis邋(lkb邋DNA邋Marker)逡逑3.3貂屬動物MHC-DRB基因多態(tài)性分析逡逑3.3.1等位基因確定逡逑本研宄在104只紫貂樣本中共檢測到35個(gè)MHC-DRB等位基因,長度為241-242逡逑bp邋
圖3-9由鼬科動物DRB等位基因繪制的中接網(wǎng)絡(luò)圖(紅色為未檢測到的過渡等位基因)逡逑Fig邋3-9邋median-joining邋network邋based邋on邋DRB邋alleles邋in邋three邋species邋of邋Mustelidae邋(Red邋represents邋an逡逑undetected邋transition邋allele)逡逑
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:Q953
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前3條
1 和占龍;禹文海;楊鳳梅;趙遠(yuǎn);魯帥堯;王俊斌;陳麗雄;乞素冬;李艷艷;劉龍丁;;中國云南地區(qū)恒河猴群MHC-DRB部分等位基因的調(diào)查[J];醫(yī)學(xué)研究雜志;2014年05期
2 虞健;梁文明;朱飛虎;徐思;吳海龍;;黃麂Mhc-DRB基因多態(tài)性及其維持機(jī)制[J];獸類學(xué)報(bào);2010年01期
3 侯東敏;王政昆;楊濤;朱萬龍;;基于MHC-DRB部分序列對不同地區(qū)中緬樹
本文編號:2631232
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/2631232.html
最近更新
教材專著