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引入基因型線性模型的變量選擇

發(fā)布時(shí)間:2020-04-03 01:41
【摘要】:近年來,基因與疾病之間的關(guān)聯(lián)分析已是生物信息學(xué)中非常重要的一個(gè)研究方向。傳統(tǒng)的基因型與疾病的研究主要集中在單個(gè)基因型與疾病之間的關(guān)聯(lián)分析,忽略了基因之間的關(guān)聯(lián)對(duì)疾病的影響。論文主要考慮引入基因型線性模型,對(duì)引入基因型線性AA,Aa,aa后所得的三種模型:隱性模型,可加模型和顯性模型。結(jié)合高維變量選擇方法和工具從理論和模擬兩個(gè)方向進(jìn)行了較為深入的研究。研究結(jié)果表明,在協(xié)變量個(gè)數(shù)p小于樣本容量n時(shí),LASSO方法在識(shí)別基因的準(zhǔn)確度方面,可以達(dá)到百分之90以上,在協(xié)變量個(gè)數(shù)p大于樣本容量n時(shí),LASSO方法最多只能識(shí)別n個(gè)。后續(xù)提出NAIVE ELASTIC NET方法,不僅可以在pn時(shí)不受限制,還在變量之間有強(qiáng)相關(guān)性時(shí)體現(xiàn)分組效應(yīng),模擬結(jié)果表明在變量之間有請(qǐng)相關(guān)性時(shí),NAIVE ELASTIC NET方法所得到的估計(jì)的MSE比LASSO所得到的要小一些。
【學(xué)位授予單位】:廣西師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:Q811.4

【相似文獻(xiàn)】

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10 王歆e,

本文編號(hào):2612749


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