天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

當(dāng)前位置:主頁(yè) > 理工論文 > 生物學(xué)論文 >

水稻OPRs家族基因的mGWAS定位及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-03-31 14:11
【摘要】:茉莉素(jasmonates,JAs)作為一種重要的植物激素,在植物生長(zhǎng)發(fā)育和抵抗逆境等生理過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。12-氧-植物二烯酸還原酶(12-oxophytodienoate reductase,OPR)是JAs合成途徑的關(guān)鍵酶,可以將12-氧-植物二烯酸(12-xox-phytodienoic acid,OPDA)還原為8-(3-氧代-2-(戊-2-烯基)環(huán)戊基)辛酸(OPC-8:0),經(jīng)過(guò)β-氧化生成JAs。在植物體內(nèi)都存在多個(gè)OPRs,因其氨基酸序列存在差異從而對(duì)幾種不同結(jié)構(gòu)的OPDA表現(xiàn)不同的親和性和催化活性。目前,研究人員已經(jīng)在水稻、番茄、擬南芥等物種中鑒定了參與JAs生物合成的OPRs,并且發(fā)現(xiàn)OPRs響應(yīng)機(jī)械損傷、鹽離子、植物信號(hào)分子、病原菌感染等多種生物和非生物脅迫。水稻基因組中共有13個(gè)OPRs,其中,OsOPR7和OsOPR1已經(jīng)被鑒定,其不僅參與水稻中JA生物合成,也參與了水稻防御和脅迫應(yīng)答等生理過(guò)程,但大部分的OsOPRs在水稻體內(nèi)的生理功能仍然不清楚。本研究以445份水稻種質(zhì)資源為材料,測(cè)定了葉片中JA合成途徑中代謝物的含量,通過(guò)JAs合成途徑中代謝物含量的mGWAS(metabolome Genome-Wide Association Study)定位到了位于水稻6號(hào)染色體上包括OsOPR1在內(nèi)的6個(gè)OsOPRs基因。本文對(duì)水稻中被注釋的10個(gè)OPRs進(jìn)行了DNA、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)以及進(jìn)化樹(shù)分析,并通過(guò)生物信息學(xué)手段對(duì)它們進(jìn)行了亞細(xì)胞定位和底物特異性的預(yù)測(cè)。發(fā)現(xiàn)OsOPRs在基因的結(jié)構(gòu)和蛋白結(jié)構(gòu)上存在一定的差異,OsOPRs與番茄中OPRs相似度最高。根據(jù)水稻、番茄、擬南芥中OPRs的底物活性已有的研究,對(duì)其它OsOPRs的底物活性進(jìn)行了預(yù)測(cè):OsOPR5、OsOPR10接受cis(-)-OPDA,cis(+)-OPDA作為底物,但是優(yōu)先選擇cis(-)-OPDA,OsOPR2、OsOPR4、OsOPR6選擇cis(-)-OPDA為底物,而OsOPR8、OsOPR9可能只能分別催化cis(-)-OPDA、cis(+)-OPDA。此外,本研究利用JAs合成途徑代謝物含量進(jìn)行mGWAS分析時(shí)還定位到了一個(gè)bHLH基因。通過(guò)遺傳互作分析發(fā)現(xiàn),bHLH和OsOPR6之間存在遺傳互作,在OsOPRs啟動(dòng)子區(qū)域也發(fā)現(xiàn)了bHLH結(jié)合的順式元件E-BOX。本研究通過(guò)對(duì)JAs合成途徑中候選基因在抗逆等生理過(guò)程中的分析,對(duì)之后的育種工作具有重要意義。
【圖文】:

定點(diǎn)突變體,底物特異性


定點(diǎn)突變體的底物特異性。PR3 和定點(diǎn)突變體對(duì) cis(+)-OPDA 的還原。WT(■),,His244Tyr(+)和 Phe74Tyr(◆44Tyr 雙突(▲)。(b)OPR3 野生型和定點(diǎn)突變體的立體選擇性。用 GC-MS 在反應(yīng) 30A(灰色)和 cis(-)-OPDA(黑色)的消耗量。rate specificity of site-directed OPR3 mutants.of cis(+)-OPDA by OPR3 wildtype enzyme and site-directed mutants. OPR3 wild-type enzymeected mutants His244Tyr (+) and Phe74Tyr (◆) and the double mutant Phe74Tyr/His244Tyr (▲ty of OPR3 wild-type enzyme and site-directed mutants. The relative consumption of cis(+)-O cis(-)-OPDA (black bars) was analyzed after 30 min by GC MS (Breithaupt et al 2009). 微陣列分析和植株損傷實(shí)驗(yàn)后 OPR 基因 Southern 雜交分析顯示,3 個(gè) OPRs 基因只有 LeOPR3 在損傷葉片中表達(dá)量有相對(duì)快速eOPR1、LeOPR2 表達(dá)量不受影響,LeOPR3 底物 OPDA 和下游產(chǎn)

雄性不育突變體,互補(bǔ)試驗(yàn),水稻,擬南芥


水稻 OPRs 家族基因的 mGWAS 定位及生物信息學(xué)分析參考文獻(xiàn)中命名為 OsOPR3)和 AOC 基因能夠正調(diào)控水稻植株對(duì)咀嚼式昆蟲(chóng),但并不參與對(duì)水稻稻瘟病的調(diào)控(Yara et al 2008,Guo et al 2014)。 但大 OsOPRs 基因在水稻體內(nèi)行使的功能和參與的生理過(guò)程依然不清楚。
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:Q943.2;S511

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 ;中外科學(xué)家為水稻降砷“解毒”[J];江西飼料;2018年03期

2 ;中外科學(xué)家為水稻降砷“解毒”[J];科學(xué)種養(yǎng);2018年08期

3 段艷芳;;水稻“防癌”新招——堿基天然變異[J];知識(shí)就是力量;2017年09期

4 ;水稻基因資源從6方面創(chuàng)新[J];北京農(nóng)業(yè);2008年08期

5 周艷紅;朱建麗;馬闖;程遙;;水稻基因結(jié)構(gòu)分析與預(yù)測(cè)建模[J];華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2008年04期

6 ;種控制硅積累的水稻基因被發(fā)現(xiàn)[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技;2006年05期

7 ;我國(guó)科學(xué)家“解讀”水稻基因[J];發(fā)明與革新;2002年06期

8 錢前,滕勝,曾大力,華志華,黃大年;21世紀(jì)我國(guó)水稻基因工程的發(fā)展策略與重點(diǎn)領(lǐng)域[J];中國(guó)稻米;2001年05期

9 馮孝忠;;日本耗巨資研究水稻基因圖[J];種子世界;1991年12期

10 凌忠專;;水稻基因分析的現(xiàn)狀[J];福建稻麥科技;1987年01期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 任斌;嚴(yán)芳;曠永潔;張大偉;林宏輝;周煥斌;;植物基因組單堿基替換技術(shù)在水稻上的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用[A];2018全國(guó)植物生物學(xué)大會(huì)論文集[C];2018年

2 謝聯(lián)輝;;植病科學(xué)與人類未來(lái)——有關(guān)基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性的若干問(wèn)題[A];農(nóng)業(yè)生物災(zāi)害預(yù)防與控制研究[C];2005年

3 陳志軍;李輝;李陽(yáng)生;朱英國(guó);;一個(gè)新的水稻基因RWP34的克隆和初步分析[A];湖北省遺傳學(xué)會(huì)第七次代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要集[C];2004年

4 楊芳;孫毅;黃壽光;陳旭君;;CRISPR/Cas9系統(tǒng)敲除水稻基因的研究[A];植物病理學(xué)研究進(jìn)展——中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)第十二屆青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文選編[C];2015年

5 陳石燕;王宗陽(yáng);;T-DNA介導(dǎo)的promoter trap系統(tǒng)[A];中國(guó)植物生理學(xué)會(huì)第九次全國(guó)會(huì)議論文摘要匯編[C];2004年

6 趙基洪;;水稻與菰屬間性狀轉(zhuǎn)移研究[A];新世紀(jì) 新機(jī)遇 新挑戰(zhàn)——知識(shí)創(chuàng)新和高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展(下冊(cè))[C];2001年

7 王景余;孫海波;李艷萍;鄒美智;;水稻遺傳轉(zhuǎn)化研究及應(yīng)用進(jìn)展[A];中國(guó)農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)會(huì)第三屆會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要集[C];2006年

8 李磊;李廣旭;吳茂森;陳華民;何晨陽(yáng);;受Xoo抑制的水稻基因OsCtBP-A的分子克隆及其表達(dá)分析[A];第四屆中國(guó)植物細(xì)菌病害學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

9 郭龍彪;曾大力;董國(guó)軍;葫時(shí)開(kāi);錢前;;超級(jí)稻產(chǎn)量的分子設(shè)計(jì)育種[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)植物遺傳和基因組學(xué)專業(yè)委員會(huì)2009年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2009年

10 李仁忠;李建業(yè);;用Gumbel分布推算南方水稻基因隔離距離極值[A];糧食安全與現(xiàn)代農(nóng)業(yè)氣象業(yè)務(wù)發(fā)展——2008年全國(guó)農(nóng)業(yè)氣象學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2008年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 記者 肖潔;水稻復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)研究獲突破[N];科學(xué)時(shí)報(bào);2011年

2 丁佳;水稻全基因組關(guān)聯(lián)分析時(shí)代來(lái)臨[N];科學(xué)時(shí)報(bào);2010年

3 記者 馬愛(ài)平;高產(chǎn)又高抗的水稻基因發(fā)現(xiàn)[N];科技日?qǐng)?bào);2019年

4 史俊庭;周口師院 克隆出水稻抗旱抗鹽基因[N];中國(guó)科學(xué)報(bào);2019年

5 本報(bào)記者 王晶;“海水稻”迎來(lái)關(guān)鍵年份[N];中國(guó)海洋報(bào);2019年

6 趙熙熙;全球最大水稻基因庫(kù)獲長(zhǎng)期資助[N];中國(guó)科學(xué)報(bào);2018年

7 記者 李晨;中國(guó)科學(xué)家主導(dǎo)國(guó)際大協(xié)作助力水稻精準(zhǔn)育種[N];中國(guó)科學(xué)報(bào);2018年

8 本報(bào)記者 李晨;國(guó)際大協(xié)作,推動(dòng)水稻精準(zhǔn)育種[N];中國(guó)科學(xué)報(bào);2018年

9 本報(bào)記者 馬愛(ài)平;破解水稻高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)“密碼”[N];科技日?qǐng)?bào);2018年

10 長(zhǎng)沙晚報(bào)記者 周和平 通訊員 何靜;重組基因,“設(shè)計(jì)”最好的水稻品種[N];長(zhǎng)沙晚報(bào);2018年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 陳慧茹;鎘在水稻亞種間的吸收轉(zhuǎn)運(yùn)和積累差異及其低積累突變種質(zhì)的創(chuàng)建[D];中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué);2019年

2 陳能剛;水稻黃化轉(zhuǎn)綠突變基因gry340的圖位克隆與功能研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

3 張玉霞;水稻胞質(zhì)類受體激酶基因OsRLK和OsNRRB在水稻與細(xì)菌性條斑病菌互作及水稻抗旱中的作用[D];廈門大學(xué);2015年

4 張昭陽(yáng);GWAS定位水稻成熟種子組培力相關(guān)基因及功能分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

5 楊俊;OsCaM1-1和OsCML16調(diào)控水稻耐逆性機(jī)制的研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

6 鄧先俊;水稻磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C4(OsPLC4)調(diào)節(jié)水稻滲透脅迫響應(yīng)及生長(zhǎng)發(fā)育[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

7 蔡維;一氧化氮在水稻開(kāi)花及非生物脅迫應(yīng)答中的功能研究[D];武漢大學(xué);2015年

8 高峰;miR396調(diào)控水稻產(chǎn)量的分子機(jī)理研究[D];武漢大學(xué);2015年

9 章佳;水稻CCT家族基因的功能研究和Hd1的重新克隆[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年

10 孫文強(qiáng);水稻長(zhǎng)葉毛基因Hairy Leaf 6的圖位克隆與功能分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 曹欣欣;水稻miRNA對(duì)立枯絲核菌侵染的應(yīng)答反應(yīng)及紋枯病的早期快速檢測(cè)[D];揚(yáng)州大學(xué);2019年

2 余佳雯;過(guò)表達(dá)OsDWF4和OsBZR1基因?qū)λ井a(chǎn)量和品質(zhì)的影響[D];揚(yáng)州大學(xué);2019年

3 計(jì)文;水稻染色體結(jié)構(gòu)維持蛋白SMC1及SMC3在DSB修復(fù)中的功能研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2019年

4 丁旭;脫落酸、茉莉酸處理的水稻轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及其抗褐飛虱機(jī)制研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2019年

5 吳宏玉;過(guò)表達(dá)修飾的水稻AK和DHPS基因?qū)ε呷橘嚢彼岱e累的影響[D];揚(yáng)州大學(xué);2019年

6 潘龍玉;水稻抗病相關(guān)基因OsBR1順式調(diào)控序列的基因組編輯研究[D];浙江師范大學(xué);2019年

7 文藝;兩個(gè)水稻葉形材料的遺傳分析與精細(xì)定位[D];浙江師范大學(xué);2019年

8 孔珍珍;水稻PP2C基因在耐汞性中的功能分析[D];浙江師范大學(xué);2019年

9 王德鴻;水稻OPRs家族基因的mGWAS定位及生物信息學(xué)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2019年

10 鐘華華;水稻苗期高溫脅迫相關(guān)的編碼基因與長(zhǎng)鏈非編碼RNA解析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2019年



本文編號(hào):2609179

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/2609179.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶430e8***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com