基于基因組學(xué)及乳清蛋白水解特性的德式乳桿菌保加利亞亞種差異性分析
發(fā)布時間:2023-02-25 21:26
德式乳桿菌保加利亞亞種是廣泛應(yīng)用于發(fā)酵乳制品生產(chǎn)的乳酸菌之一,具有高效的蛋白水解系統(tǒng)。研究表明德式乳桿菌保加利亞亞種的蛋白水解特性存在差異性,但是德式乳桿菌保加利亞亞種菌株的蛋白水解基因型差異性、乳清蛋白的利用能力仍有待進(jìn)一步研究。本文以采集自青海、四川和新疆的發(fā)酵牦牛乳和曲拉等樣品的24株德式乳桿菌保加利亞亞種菌株為研究對象,進(jìn)行了基因草圖測序;結(jié)合NCBI公布全基因組、染色體組及基因草圖測序的39株德式乳桿菌的基因序列,進(jìn)行包括同源進(jìn)化分析、核心基因與泛基因分析和蛋白水解體系關(guān)鍵基因的分布等比較基因組學(xué)的研究。結(jié)果表明德式乳桿菌的泛基因組呈現(xiàn)開放型,仍在進(jìn)行菌株的進(jìn)化。COG功能注釋結(jié)果表明菌株的附屬&特有基因組與核心基因組相比具有更多的功能基因,蛋白水解體系關(guān)鍵基因分析結(jié)果表明菌株編碼寡肽轉(zhuǎn)運系統(tǒng)的OppA最具菌株多樣性,編碼部分肽酶的PepD、PepQ、PepO和PepI在菌株之間存在多樣性,而編碼胞壁蛋白酶的基因高度保守。依據(jù)基因組學(xué)的分析結(jié)果,選擇了處于不同進(jìn)化分支且蛋白水解相關(guān)基因差異較大的8株德式乳桿菌保加利亞亞種菌株,對其在乳清蛋白培養(yǎng)基中的肽酶活力和主要乳清...
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 德式乳桿菌概述
1.2 德式乳桿菌基因組學(xué)概述
1.3 德式乳桿菌蛋白水解體系概述
1.3.1 胞壁蛋白酶
1.3.2 肽轉(zhuǎn)運系統(tǒng)
1.3.3 胞內(nèi)肽酶
1.3.4 蛋白水解體系研究現(xiàn)狀
1.4 乳清蛋白肽及其制備概述
1.4.1 乳清蛋白的組成和性質(zhì)
1.4.2 乳清蛋白肽研究進(jìn)展
1.4.3 乳酸菌發(fā)酵乳清蛋白研究現(xiàn)狀
1.5 本課題研究意義及主要內(nèi)容
1.5.1 立題背景及意義
1.5.2 本課題的主要內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 實驗材料和試劑
2.1.1 實驗樣品
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 實驗菌株
2.2 實驗儀器和設(shè)備
2.3 實驗方法
2.3.1 德式乳桿菌保加利亞亞種分離純化與鑒定
2.3.2 基因組測序及分析方法
2.3.3 乳清蛋白培養(yǎng)基中生長特性評價
2.3.4 乳清蛋白培養(yǎng)基中蛋白酶活力的測定
2.3.5 乳清蛋白培養(yǎng)基中乳清蛋白利用情況的測定
2.3.6 乳清蛋白-乳糖體系中的生長特性評價
2.3.7 乳清蛋白-乳糖體系中的肽含量的測定
2.3.8 乳清蛋白-乳糖體系中菌株蛋白酶活力的測定
2.3.9 乳清蛋白水解產(chǎn)物肽譜的測定
2.3.10 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析
3 結(jié)果與討論
3.1 德式乳桿菌保加利亞亞種的分離、純化與鑒定結(jié)果
3.2 德式乳桿菌的基因組分析
3.2.1 德式乳桿菌基因組基本特征
3.2.2 德式乳桿菌基因組同源進(jìn)化分析
3.2.3 德式乳桿菌泛基因組和核心基因組分析
3.2.4 德式乳桿菌功能基因分析
3.3 德式乳桿菌保加利亞亞種乳清蛋白利用特性分析
3.3.1 生長特性分析
3.3.2 產(chǎn)酸特性分析
3.3.3 三種胞內(nèi)肽酶的活力分析
3.3.4 芳族轉(zhuǎn)氨酶的活力分析
3.3.5 乳清蛋白利用能力分析
3.4 德式乳桿菌保加利亞亞種在乳清蛋白-乳糖體系的應(yīng)用
3.4.1 發(fā)酵特性分析
3.4.2 多肽產(chǎn)量分析
3.4.3 不同初始pH下菌株的發(fā)酵特性分析
3.4.4 不同初始pH下菌株的多肽產(chǎn)量分析
3.4.5 不同初始pH下的蛋白酶活力特性分析
3.4.6 不同菌株的多肽鑒定結(jié)果分析
主要結(jié)論與展望
主要結(jié)論
展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 :作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
本文編號:3749224
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
1 緒論
1.1 德式乳桿菌概述
1.2 德式乳桿菌基因組學(xué)概述
1.3 德式乳桿菌蛋白水解體系概述
1.3.1 胞壁蛋白酶
1.3.2 肽轉(zhuǎn)運系統(tǒng)
1.3.3 胞內(nèi)肽酶
1.3.4 蛋白水解體系研究現(xiàn)狀
1.4 乳清蛋白肽及其制備概述
1.4.1 乳清蛋白的組成和性質(zhì)
1.4.2 乳清蛋白肽研究進(jìn)展
1.4.3 乳酸菌發(fā)酵乳清蛋白研究現(xiàn)狀
1.5 本課題研究意義及主要內(nèi)容
1.5.1 立題背景及意義
1.5.2 本課題的主要內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 實驗材料和試劑
2.1.1 實驗樣品
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基
2.1.4 實驗菌株
2.2 實驗儀器和設(shè)備
2.3 實驗方法
2.3.1 德式乳桿菌保加利亞亞種分離純化與鑒定
2.3.2 基因組測序及分析方法
2.3.3 乳清蛋白培養(yǎng)基中生長特性評價
2.3.4 乳清蛋白培養(yǎng)基中蛋白酶活力的測定
2.3.5 乳清蛋白培養(yǎng)基中乳清蛋白利用情況的測定
2.3.6 乳清蛋白-乳糖體系中的生長特性評價
2.3.7 乳清蛋白-乳糖體系中的肽含量的測定
2.3.8 乳清蛋白-乳糖體系中菌株蛋白酶活力的測定
2.3.9 乳清蛋白水解產(chǎn)物肽譜的測定
2.3.10 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析
3 結(jié)果與討論
3.1 德式乳桿菌保加利亞亞種的分離、純化與鑒定結(jié)果
3.2 德式乳桿菌的基因組分析
3.2.1 德式乳桿菌基因組基本特征
3.2.2 德式乳桿菌基因組同源進(jìn)化分析
3.2.3 德式乳桿菌泛基因組和核心基因組分析
3.2.4 德式乳桿菌功能基因分析
3.3 德式乳桿菌保加利亞亞種乳清蛋白利用特性分析
3.3.1 生長特性分析
3.3.2 產(chǎn)酸特性分析
3.3.3 三種胞內(nèi)肽酶的活力分析
3.3.4 芳族轉(zhuǎn)氨酶的活力分析
3.3.5 乳清蛋白利用能力分析
3.4 德式乳桿菌保加利亞亞種在乳清蛋白-乳糖體系的應(yīng)用
3.4.1 發(fā)酵特性分析
3.4.2 多肽產(chǎn)量分析
3.4.3 不同初始pH下菌株的發(fā)酵特性分析
3.4.4 不同初始pH下菌株的多肽產(chǎn)量分析
3.4.5 不同初始pH下的蛋白酶活力特性分析
3.4.6 不同菌株的多肽鑒定結(jié)果分析
主要結(jié)論與展望
主要結(jié)論
展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 :作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
本文編號:3749224
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