肉類食品中沙門氏菌耐藥性與代謝特征關系的研究
發(fā)布時間：2021-11-15 05:24
沙門氏菌（Salmonella）是一種典型的食源性致病菌,其污染對國民健康構成了嚴重的威脅。隨著抗生素的廣泛使用,沙門氏菌的耐藥性也日益嚴重,其在食品生產鏈的各個環(huán)節(jié)都可能存在,并通過食品對人類健康造成嚴重的危害。耐藥沙門氏菌在食品鏈的分布情況與傳播機制已經成為當前研究熱點,亟需開展不同食品鏈環(huán)節(jié)的沙門氏菌耐藥性相關研究。本論文以肉類食品在養(yǎng)殖、屠宰和零售三個食品鏈環(huán)節(jié)的181株沙門氏菌為研究對象,研究食源性沙門氏菌耐藥性的空間分布,并基于代謝組學分析耐藥性與代謝特征之間的關系,為耐藥機制研究和干預防控提供新的思路與方法,主要內容如下:1.研究肉類食品中沙門氏菌耐藥性的空間分布特征。通過食品鏈各環(huán)節(jié)樣品采集發(fā)現,養(yǎng)殖環(huán)節(jié)沙門氏菌污染最為嚴重（74.18%）,且血清型相對單一。零售環(huán)節(jié)污染率為16.68%,但血清型種類豐富;屠宰環(huán)節(jié)污染則相對較低（7.14%）。所有分離菌株對環(huán)丙沙星、左氧氟沙星和甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲噁唑均呈現耐藥性。養(yǎng)殖環(huán)節(jié)中對1015種抗生素耐藥的沙門氏菌占56.72%,對超過15種抗生素耐藥的沙門氏菌占20.90%;零售環(huán)節(jié)對51
【文章來源】：江南大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】：73 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
沙門氏菌致病機理[10]
第一章緒論3門氏菌中都至少對一種及以上的抗生素呈現出耐藥性，其中四環(huán)素（68%）、鏈霉素（61%）等抗生素的耐藥情況較為嚴重[30]。同樣，我國食源性沙門氏菌耐藥情況也非常嚴峻，60年代對兩種及以上抗生素耐藥的沙門氏菌僅占37%[31]，而如今對8~9種抗生素耐藥的沙門氏菌已成為了普遍現象，可占到80%~85%[32,33]。2012年至2016年期間，我國各地區(qū)在對肉類食品沙門氏菌的檢測中發(fā)現，分離鑒定得到的沙門氏菌中平均90%都具有耐藥情況，其中75%左右的沙門氏菌還呈現出多重耐藥性，主要對萘啶酸、氨芐西林、四環(huán)素、環(huán)丙沙星以及頭孢類抗生素的耐藥性較高[34-36]。這一類抗生素藥物常被用于治療沙門氏菌感染，因此在環(huán)境選擇壓力下，沙門氏菌對這幾類抗生素的耐藥性逐漸強化且逐步呈現多重耐藥，這對于人體感染后的治療是非常不利的。圖1-2我國抗生素用量及人源分離菌耐藥性[37]Figure.1-2ConsumptionofantimicrobialsandantimicrobialresistanceofhumanisolatesinChina1.1.4食源性沙門氏菌不同血清型的耐藥性分布眾多調查研究表明，沙門氏菌的耐藥性和血清型呈現出一定的相關性。腸炎和傷寒
江南大學碩士學位論文6圖1-3基因水平的抗生素耐藥生態(tài)體系[57]Figure.1-3Gene-levelantibioticsuspicionecosystem1.2.3水解或修飾抗生素細菌可以通過水解或修飾作用破壞抗生素的結構，使其失去活性從而獲得耐藥性。目前細菌體內發(fā)現的抗生素滅活酶主要分為兩種，水解酶和鈍化酶。β內酰胺酶（BLA）是一種革蘭氏陰性菌常用于水解β-內酰胺類抗生素的酶，其通過破壞β內酰胺單環(huán)，改變抗生素構象，使之失活，導致細菌對青霉素等β-內酰胺類抗生素耐藥[58]。常見的水解酶有超廣譜β-內酰胺酶（ESBLs），金屬β-內酰胺酶（MBLs）和頭孢菌素類β-內酰胺酶等[59]。Luke等人[60]通過對環(huán)境和肉類等多種來源沙門氏菌進行基因測序，發(fā)現40%的沙門氏菌株都具有BLA相關或同源基因，且在耐藥性檢測中，對四環(huán)素、鏈霉素和磺酰胺類等抗生素均呈現出耐藥性。氨基糖苷類抗生素具有較多暴露的羥基和酰胺基團的大分子，因此菌體內的修飾酶更容易修飾該類抗生素而獲得高水平的抗性。目前研究中常見的氨基糖苷修飾酶有乙酰轉移酶、磷酸轉移酶和核苷酸轉移酶[61]。乙酰轉移酶通過破壞氨基糖苷類抗生素的羥基或酰胺基，從而影響了其與菌體rRNA的結合，引發(fā)相關抗生素的耐藥性[62]；磷酸轉移酶則是通過使抗生素發(fā)生磷酸化，影響其與核糖體A位點的結合能力，從而導致耐藥性的產生。核苷酸轉移酶利用三磷酸腺苷（ATP）作為第二底物，轉移ATP部分的單磷酸核苷到抗生素的羥基基團上，從而進行抗生素的修飾，使其失活[63]。1.3代謝組學及其在微生物中的研究1.3.1代謝組學概述在后基因組時代，代謝組學，轉錄組學和蛋白質組學已經成為系統(tǒng)生物學研究中的重要研究工具[64]。代謝組學作為一種研究生物系統(tǒng)中所有代謝物的綜合分析方法，通過
【參考文獻】：
期刊論文
[1]中國2010—2016年家庭食源性疾病暴發(fā)事件流行特征分析[J]. 張晶,李薇薇,楊淑香,郭云昌,付萍. 中國公共衛(wèi)生. 2019(10)
[2]湖南地區(qū)豬源和雞源沙門氏菌的分離鑒定與耐藥性分析[J]. 夏宇飛,周汝順,黎滿香. 湖南農業(yè)科學. 2019(07)
[3]雞沙門氏菌耐藥性研究進展[J]. 李鳳玲,秦俊,呂宗德,劉婷婷,黃鑫. 農業(yè)開發(fā)與裝備. 2019(05)
[4]關于畜牧業(yè)生產中獸用抗菌藥減量化使用問題[J]. 萬遂如. 養(yǎng)豬. 2019(02)
[5]沙門氏菌中與萘啶酮酸和環(huán)丙沙星抗性相關基因及突變的檢測分析[J]. 黃巾凌,王嘉煒,牛沁雅,廉魯昕,尹明遠,武運,楊保偉. 食品科學. 2019(22)
[6]食品中耐藥細菌風險評估的研究進展[J]. 姜竹茂,艾春梅,王曄茹,董慶利,劉東紅,丁甜. 食品科學. 2019(05)
[7]沙門氏菌對常用抗菌藥物的耐藥機制研究進展[J]. 鄧飛,陳斌,邵靚,李麗,邱明雙,周莉媛. 畜禽業(yè). 2018(11)
[8]河南省臨床鼠傷寒沙門氏菌的耐藥性分析[J]. 李永瑞,李艷. 河南科技大學學報(醫(yī)學版). 2018(03)
[9]肉雞生產中如何規(guī)范、減量使用抗菌素[J]. 王建. 獸醫(yī)導刊. 2018(11)
[10]1996—2015年間沙門氏菌食物中毒事件特征分析[J]. 李光輝,高雪麗,郭衛(wèi)蕓,王永輝,孫思勝. 食品工業(yè). 2018(05)
碩士論文
[1]大腸桿菌脂多糖影響HeLa細胞胞內ATP能量的傳感檢測及代謝機制研究[D]. 張入元.江南大學 2019
[2]南寧市售鮮肉中四種食源菌的監(jiān)測及沙門氏菌致病性和耐藥性的研究[D]. 吳科敏.廣西大學 2017
[3]新疆動物源沙門氏菌耐藥性及MLST分析[D]. 江萍.新疆農業(yè)大學 2017
[4]河北省雞沙門氏菌的分離鑒定及耐藥性分析[D]. 劉新靜.山東農業(yè)大學 2015
[5]2012-2013四川部分地區(qū)市售雞肉中沙門氏菌污染及耐藥性分析[D]. 韋婷.四川農業(yè)大學 2015
本文編號：3496122
【文章來源】：江南大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】：73 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
沙門氏菌致病機理[10]
第一章緒論3門氏菌中都至少對一種及以上的抗生素呈現出耐藥性，其中四環(huán)素（68%）、鏈霉素（61%）等抗生素的耐藥情況較為嚴重[30]。同樣，我國食源性沙門氏菌耐藥情況也非常嚴峻，60年代對兩種及以上抗生素耐藥的沙門氏菌僅占37%[31]，而如今對8~9種抗生素耐藥的沙門氏菌已成為了普遍現象，可占到80%~85%[32,33]。2012年至2016年期間，我國各地區(qū)在對肉類食品沙門氏菌的檢測中發(fā)現，分離鑒定得到的沙門氏菌中平均90%都具有耐藥情況，其中75%左右的沙門氏菌還呈現出多重耐藥性，主要對萘啶酸、氨芐西林、四環(huán)素、環(huán)丙沙星以及頭孢類抗生素的耐藥性較高[34-36]。這一類抗生素藥物常被用于治療沙門氏菌感染，因此在環(huán)境選擇壓力下，沙門氏菌對這幾類抗生素的耐藥性逐漸強化且逐步呈現多重耐藥，這對于人體感染后的治療是非常不利的。圖1-2我國抗生素用量及人源分離菌耐藥性[37]Figure.1-2ConsumptionofantimicrobialsandantimicrobialresistanceofhumanisolatesinChina1.1.4食源性沙門氏菌不同血清型的耐藥性分布眾多調查研究表明，沙門氏菌的耐藥性和血清型呈現出一定的相關性。腸炎和傷寒
江南大學碩士學位論文6圖1-3基因水平的抗生素耐藥生態(tài)體系[57]Figure.1-3Gene-levelantibioticsuspicionecosystem1.2.3水解或修飾抗生素細菌可以通過水解或修飾作用破壞抗生素的結構，使其失去活性從而獲得耐藥性。目前細菌體內發(fā)現的抗生素滅活酶主要分為兩種，水解酶和鈍化酶。β內酰胺酶（BLA）是一種革蘭氏陰性菌常用于水解β-內酰胺類抗生素的酶，其通過破壞β內酰胺單環(huán)，改變抗生素構象，使之失活，導致細菌對青霉素等β-內酰胺類抗生素耐藥[58]。常見的水解酶有超廣譜β-內酰胺酶（ESBLs），金屬β-內酰胺酶（MBLs）和頭孢菌素類β-內酰胺酶等[59]。Luke等人[60]通過對環(huán)境和肉類等多種來源沙門氏菌進行基因測序，發(fā)現40%的沙門氏菌株都具有BLA相關或同源基因，且在耐藥性檢測中，對四環(huán)素、鏈霉素和磺酰胺類等抗生素均呈現出耐藥性。氨基糖苷類抗生素具有較多暴露的羥基和酰胺基團的大分子，因此菌體內的修飾酶更容易修飾該類抗生素而獲得高水平的抗性。目前研究中常見的氨基糖苷修飾酶有乙酰轉移酶、磷酸轉移酶和核苷酸轉移酶[61]。乙酰轉移酶通過破壞氨基糖苷類抗生素的羥基或酰胺基，從而影響了其與菌體rRNA的結合，引發(fā)相關抗生素的耐藥性[62]；磷酸轉移酶則是通過使抗生素發(fā)生磷酸化，影響其與核糖體A位點的結合能力，從而導致耐藥性的產生。核苷酸轉移酶利用三磷酸腺苷（ATP）作為第二底物，轉移ATP部分的單磷酸核苷到抗生素的羥基基團上，從而進行抗生素的修飾，使其失活[63]。1.3代謝組學及其在微生物中的研究1.3.1代謝組學概述在后基因組時代，代謝組學，轉錄組學和蛋白質組學已經成為系統(tǒng)生物學研究中的重要研究工具[64]。代謝組學作為一種研究生物系統(tǒng)中所有代謝物的綜合分析方法，通過
【參考文獻】：
期刊論文
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[2]湖南地區(qū)豬源和雞源沙門氏菌的分離鑒定與耐藥性分析[J]. 夏宇飛,周汝順,黎滿香. 湖南農業(yè)科學. 2019(07)
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[5]沙門氏菌中與萘啶酮酸和環(huán)丙沙星抗性相關基因及突變的檢測分析[J]. 黃巾凌,王嘉煒,牛沁雅,廉魯昕,尹明遠,武運,楊保偉. 食品科學. 2019(22)
[6]食品中耐藥細菌風險評估的研究進展[J]. 姜竹茂,艾春梅,王曄茹,董慶利,劉東紅,丁甜. 食品科學. 2019(05)
[7]沙門氏菌對常用抗菌藥物的耐藥機制研究進展[J]. 鄧飛,陳斌,邵靚,李麗,邱明雙,周莉媛. 畜禽業(yè). 2018(11)
[8]河南省臨床鼠傷寒沙門氏菌的耐藥性分析[J]. 李永瑞,李艷. 河南科技大學學報(醫(yī)學版). 2018(03)
[9]肉雞生產中如何規(guī)范、減量使用抗菌素[J]. 王建. 獸醫(yī)導刊. 2018(11)
[10]1996—2015年間沙門氏菌食物中毒事件特征分析[J]. 李光輝,高雪麗,郭衛(wèi)蕓,王永輝,孫思勝. 食品工業(yè). 2018(05)
碩士論文
[1]大腸桿菌脂多糖影響HeLa細胞胞內ATP能量的傳感檢測及代謝機制研究[D]. 張入元.江南大學 2019
[2]南寧市售鮮肉中四種食源菌的監(jiān)測及沙門氏菌致病性和耐藥性的研究[D]. 吳科敏.廣西大學 2017
[3]新疆動物源沙門氏菌耐藥性及MLST分析[D]. 江萍.新疆農業(yè)大學 2017
[4]河北省雞沙門氏菌的分離鑒定及耐藥性分析[D]. 劉新靜.山東農業(yè)大學 2015
[5]2012-2013四川部分地區(qū)市售雞肉中沙門氏菌污染及耐藥性分析[D]. 韋婷.四川農業(yè)大學 2015
本文編號：3496122
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