本文以大西洋鮭魚、鯽魚、鳀魚、日本鰻鱺和鯉魚的魚籽蛋白為主要原料,通過(guò)在線數(shù)據(jù)庫(kù)虛擬酶解,對(duì)酶解產(chǎn)物活性肽的生物活性、水溶性和毒性等性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè),并結(jié)合分子對(duì)接技術(shù)篩選出具有乙酰膽堿酯酶（AChE）、丁酰膽堿酯酶（BChE）和β-淀粉樣前體蛋白裂解酶1（BACE1）抑制活性的二肽和三肽。通過(guò)分子對(duì)接技術(shù)對(duì)其分子結(jié)合機(jī)制進(jìn)行研究,并進(jìn)行工廠設(shè)計(jì),旨在為魚籽蛋白資源的利用以及活性肽的開發(fā)提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.通過(guò)在線工具ExPASy PeptideCutter對(duì)大西洋鮭魚魚籽蛋白、鯽魚魚籽蛋白、鳀魚魚籽蛋白、鯉魚魚籽蛋白和日本鰻鱺魚籽蛋白進(jìn)行虛擬水解,利用PeptideRanker、Innovagen、ToxinPred程序?qū)Λ@得的102個(gè)二肽和三肽的生物活性、水溶性、毒性等性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè),并結(jié)合分子對(duì)接篩選得到4個(gè)具有阿爾茲海默癥（AD）抑制活性的三肽WIR、MIR、FQK和YPR,其中WIR的AD抑制活性最高,其對(duì)AChE和BACE1抑制的IC₅₀值分別為43.32±1.22μM和2.27±0.35 mM,對(duì)BChE在1.06±0.87 mM濃度時(shí)抑制... 

【文章來(lái)源】：渤海大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：74 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

技術(shù)路線圖

魚籽蛋白抗老年癡呆活性肽的高效篩選與工廠設(shè)計(jì)18(c)圖2AChE(a)、BChE(b)和BACE1(c)蛋白結(jié)構(gòu)圖Fig.2CrystalstructureofAChE、BChEandBACE13.2.2.3抑制肽與AChE、BChE和BACE1的分子對(duì)接使用DiscoveryStudio2017R2Client（DS）軟件的CDOCKER模塊將AChE、BChE和BACE1與活性肽分別進(jìn)行半柔性對(duì)接，對(duì)預(yù)測(cè)的AChE、BChE和BACE1-肽相互作用位點(diǎn)及結(jié)合模式進(jìn)行分析。每個(gè)分子生成的對(duì)接構(gòu)像數(shù)目設(shè)置為10，其它參數(shù)為軟件系統(tǒng)的默認(rèn)值。根據(jù)軟件中“-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY”和“-CDOCKER_ENERGY”打分函數(shù)的打分?jǐn)?shù)值，獲得AChE、BChE和BACE1-肽復(fù)合物的最佳結(jié)合構(gòu)象，并分析其結(jié)合位點(diǎn)與相互作用機(jī)制。3.3結(jié)果與討論3.3.1AD抑制肽與AChE互作機(jī)制分析CDOCKER使用的打分函數(shù)為“-CDOCKER_ENERGY”，三肽WIR、YPR、MIR和FQK與AChE的對(duì)接打分值分別為76.5174、59.4246、69.7102和88.7739kcal/mol。在DS軟件中將三肽WIR、YPR、MIR和FQK與AChE蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行分子對(duì)接，并從復(fù)合物產(chǎn)生的10種構(gòu)像中選擇最緊密結(jié)合的一種復(fù)合物（通常選擇列表第一位的復(fù)合物結(jié)構(gòu)），即AChE-WIR（圖3）、AChE-YPR（圖4）、AChE-MIR（圖5）、AChE-FQK（圖6）。

渤海大學(xué)碩士學(xué)位論文19在DS視圖框中，可以通過(guò)改變受體和配體的可見性與其分子結(jié)構(gòu)的方向，來(lái)觀察其相互作用關(guān)系。左圖是對(duì)接復(fù)合物的3D結(jié)構(gòu)模型圖，右圖是對(duì)接復(fù)合物氨基酸殘基分子間相互作用的2D模型圖。圖3AChE-WIR分子對(duì)接3D及2D模型圖Fig.3BindingconformationsofAChE-WIR圖4AChE-YPR分子對(duì)接3D及2D模型圖Fig.4BindingconformationsofAChE-YPR

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]絲膠蛋白源ACE抑制多肽的篩選及其抑制機(jī)理研究[D]. 孫華菊.廣西大學(xué) 2018
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本文編號(hào)：3414115