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自然發(fā)酵乳中乳酸乳球菌乳酸亞種群體遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-01 21:34
  乳酸乳球菌乳酸亞種(Lactococcus lactissubsp.lactis,L.lactissubsp.lactis)是乳球菌屬的模式種,既是自然發(fā)酵乳中常見(jiàn)乳酸菌,也是生產(chǎn)奶酪和低溫發(fā)酵乳等發(fā)酵乳制品常用的發(fā)酵劑菌種之一。L.lactis subsp.lactis具有廣泛的應(yīng)用前景和較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。系統(tǒng)解析L.lactis subsp.lactis的遺傳背景、進(jìn)化歷程和功能特征對(duì)開(kāi)發(fā)利用L.lactis subsp.lactis有著極為重要的意義。但從群體基因組水平解析L.lactis subsp.lactis遺傳背景和功能特征的研究鮮有報(bào)道。本研究采用Illumina Hiseq高通量測(cè)序平臺(tái)完成了 227株分離自自然發(fā)酵乳制品中的L.lactis subsp.lactis基因組重測(cè)序技術(shù),結(jié)合NCBI已公布的89株全基因組序列,利用群體遺傳學(xué)手段解析了L.lactis subsp.lactis群體的遺傳背景、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和種群結(jié)構(gòu),揭示了不同遺傳譜系菌株的功能特征,利用全基因關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association analysis,GWAS)在基因組中對(duì)與... 

【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:87 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

自然發(fā)酵乳中乳酸乳球菌乳酸亞種群體遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究


圖2?227株菌株所有變異位點(diǎn)在基因組上的分布圖??

自然發(fā)酵乳中乳酸乳球菌乳酸亞種群體遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究


翻P分布規(guī)律直方圈

自然發(fā)酵乳中乳酸乳球菌乳酸亞種群體遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究


圖6?227株菌株群體的lg(Ka/Ks)值和Tajima’s?D值在基因組上的分布??Figure.6.?The?distribution?of?lg(Ka/Ks)?and?Tajima's?D?values?on?the?genome?of?227?strains??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]細(xì)菌全基因組關(guān)聯(lián)研究的方法與應(yīng)用[J]. 楊超,楊瑞馥,崔玉軍.  遺傳. 2018(01)
[2]群體基因組學(xué)在乳酸菌研究中的應(yīng)用[J]. 孫志宏.  中國(guó)食品學(xué)報(bào). 2017(08)
[3]傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中微生物多樣性研究[J]. 李偉程,侯強(qiáng)川,于潔,孫志宏,孫天松.  食品工業(yè)科技. 2018(01)
[4]自然發(fā)酵乳制品中乳酸菌的生物多樣性[J]. 張和平.  生命科學(xué). 2015(07)

博士論文
[1]德氏乳桿菌保加利亞亞種的群體遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究[D]. 宋宇琴.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]自然發(fā)酵乳中嗜熱鏈球菌群體遺傳學(xué)和功能基因組學(xué)研究[D]. 趙潔.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]高黏附力重組乳酸乳球菌靶向投遞KiSS1蛋白對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞的抑制作用研究[D]. 張博.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017



本文編號(hào):3316285

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