酸馬奶是盛行于我國內蒙古、新疆以及蒙古國和中亞地區(qū)的一種特種發(fā)酵乳制品。到目前為止,酸馬奶的制作仍然是采用自然發(fā)酵的傳統(tǒng)工藝。自然開放式的發(fā)酵過程造就了酸馬奶蘊藏著豐富的微生物資源,特別是乳酸菌資源。為了更詳細的解析馬奶在發(fā)酵和非發(fā)酵狀態(tài)下細菌群落結構,本研究采用純培養(yǎng)方法與PacBio SMRT測序技術結合對新疆伊犁地區(qū)鮮馬奶和酸馬奶細菌多樣性進行了分析。本次采集自新疆伊犁地區(qū)的鮮馬奶和酸馬奶樣品乳酸菌活菌數在6.00×104 CFU/mL～9.20×108 CFU/mL范圍之間。從42份樣品中分離到246株乳酸菌分離株,經16S rRNA基因序列比對,將所有分離株分別歸屬于乳酸菌的6個屬20個種及亞種。其中Lactobacillus helveticus為本次樣品分離到的優(yōu)勢菌種,所占比例達32%。鮮馬奶中以Lactococcus、Leuconostoc和Streptococcsu等球菌為優(yōu)勢菌群,占其分離株的86%;酸馬奶中以Lactobacillus為優(yōu)勢菌群,占其分離株的76%�？梢�,鮮馬奶和酸馬奶中分離的乳酸菌菌株組成有顯著差異�；赑acBio SMRT測序分析顯示,42... 

【文章來源】：內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)

【文章頁數】：54 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３部分球菌１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹??Ｆｉｇ．３?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ?ｏｆ?１６Ｓ?

．?－－４??ｒｒ，?’?？＇?－■?．?，?＇ｔ＾ｚ，?？?＾?…二產－�。�?＞：、ｙｗ－、??＾?：?３??－?Ｉ?ｆ?一二二二二——二二??＼?一?Ｇｒｏｕｐ?Ｇｒｏｕｐ??二：’’??—一一?：―?ＳＫ?ｊ?１?—訊??ＸＫ?！?ＸＫ??＾?’?｜?．?ｊ??％?＂?外神‘?３＆？一＿．洲＇＂…６＾〇＂．．＇…－？？—＇■＇?？???ｉｉｚｂｏｏ＂?ｒ?ｅｄｏｏ?＇＇１＞５〇６?ｌｉｉｉｗ＊—??測斤Ｍ：?測卬Ｍ：??圖４稀疏曲線和香農曲線??Ｆｉｇ．４?Ｔｈｅ?Ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅｓ?（ａ）?ａｎｄ?Ｓｈａｎｎｏｎ?ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?（ｂ）??注：ＳＫ：酸馬奶，ＸＫ：鮮馬奶??為了了解當前測序深度下能否準確反映樣品的物種信息，用稀疏曲線和香農曲??線對樣品物種多樣性進行評估。從圖４可以看出，當測序數量較少時，發(fā)現０ＴＵ??的數量和香農指數隨著測序量的增加而增加，但當測序量繼續(xù)增加時，圖２?（ａ）稀??疏曲線中新增０ＴＵ的數量逐漸變緩但最終仍沒有達到平衡狀態(tài)，說明繼續(xù)增加測??序量時有新的細菌物種可能會被發(fā)現。而圖２?（ｂ）香農曲線中測序量達到２０００時，??香農曲線已經趨于平緩，繼續(xù)增加測序量后樣品多樣性也無明顯變化，說明當前測??序數據量已達到飽和狀態(tài)，能夠反映出樣品中大部分細菌多樣性信息。因此當前測??序量足以滿足生物信息學分析的條件。??表７樣品測序序列信息和ａ多樣性指數??Ｔａｂｌｅ．７?Ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ａｎｄ?ａ－ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?ｉｎｄｉｃｅｓ?ｉｎ?ｓａｍｐｌｅｓ??樣品號序列數?ＯＴＵ數?Ｃｈａｏ

２６?新疆伊犁地區(qū)馬奶及其制品細菌多樣性分析???既有相似性，但也存在物種和含量的差異。??■Ｉｓ?ｆＬ??＆?：?ｍＡ￣??Ｉ?Ｉ??＾?Ｓ／ｆ＞ｔｆ〇６ａｏｅｒｔ＊／／ｒ＞??｜ｉ?１??ｉｌｌ?—??Ｉ?§?ｇ?ｇ?５?５?§?Ｉ?５?３?芒藝??圖５鮮馬奶和酸馬奶樣品細菌屬水平上菌群組成??Ｆｉｇ．５?Ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ?ｏｆ?ｆｒｅｓｈ?ｍａｒｅ＾?ｍｉｌｋ?ａｎｄ?ｋｏｕｍｉｓｓ?ａｔ?ｇｅｎｅｒａ?ｌｅｖｅｌ??注：ＳＫ．？酸馬奶，ＸＫ：鮮馬奶??＾?ｐＳｂ?Ｇｒｏｕｐ??１?Ｉ?ｓ＾ｋ?Ｉ??ＢＨｈ?ＩＰ］?１－??■■■■Ｉ?＼＼?＼Ｖ．＿，，＂，．．．７５?！??■?＾?；！?■????｜?＼＼?ｍ?ｒ?？＊?？?ｉ?＇??ｇ?Ｗｇｍ?＼?ｓ?？？?．?Ｉ??５０?＼?＼?＾ｊＣ／ｒｔｏ？ｏｃ〇ｃｃ〇？?二??爲?＜?！?＇?［二’ｊ?ｔｆｔｆＭｔｏｔ＞？ｃｆｒｋ．ｎｉ?＃??Ｓ?”？卿Ｂｗ?ｓｔｒ＾ｐｔｏｃｏｃｃｕｔ??ｈ?：．?ｋ?Ｂ＝：?ｍｒ?ｃ??０?．?：＇?Ｂｉ?Ｊｄ?心一一?＿ｊｅ＊ｉ?“?—?＊．??Ｈ?Ｈ??ＳＫ?ＸＫ??圖６細菌屬水平上主要菌群及相對含量分析??Ｆｉｇ．６?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｖｅ?ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ｏｆ?ｄｏｍｉｎａｎｔ?ｂａｃｔｅｒｉａ?ｉｎ?ｓａｍｐｌｅｓ?ａｔ?ｇｅｎｅｒａ?ｌｅｖｅｌ??注：ＳＫ：酸馬奶，ＸＫ：鮮馬奶??３．２．２．３在種水平上樣品細菌群落結構分析??在細菌種水平，４２份樣品中共鑒定到５５０個細菌種，平均相對含量大于１％的??

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]基于宏基因組技術對俄羅斯地區(qū)自然發(fā)酵酸牛乳中微生物多樣性的研究[D]. 劉紅新.內蒙古農業(yè)大學 2017
[2]應用焦磷酸測序技術對新疆地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中微生物多樣性的研究[D]. 張冬蕾.內蒙古農業(yè)大學 2016
[3]酸馬奶中優(yōu)勢乳酸菌的鑒定及其發(fā)酵特性研究[D]. 馬俊英.西北農林科技大學 2016
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本文編號：3061079