獲得性免疫缺陷綜合癥(AIDS)是一種致命疾病且由人類免疫缺陷病毒(HIV)而引起的。HIV可分為I型(HIV-1)和II型(HIV-2),兩者之間存在一定的免疫交叉反應(yīng)。據(jù)報道HIV-1是人類最容易傳播和感染的病毒之一,所以絕大多數(shù)艾滋病都是由HIV-1而引起的。逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)在HIV-1的復(fù)制循環(huán)中起著關(guān)鍵性的作用。因而,HIV-1逆轉(zhuǎn)錄酶一直以來都是抗艾滋病藥物發(fā)展中主要的生物靶點。本文以易位體比較分子場(Topomer CoMFA)為主要的三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)研究方法,分別對S-烷氧芐基嘧啶二酮(S-DABO)類衍生物、硫代氨基甲酸酯(TCS)衍生物、二芳基嘧啶(DAPY)類衍生物、1,3-噻唑烷-4-酮衍生物和二芳基三嗪(DATA)類衍生物5個NNRTI體系進(jìn)行細(xì)致研究。主要工作如下:1.采用易位體比較分子場(Topomer CoMFA)方法對21個6-(1-萘甲基)取代S-DABO類化合物進(jìn)行3D-QSAR研究,建立了3D-QSAR模型,所得的主要參數(shù)分別為N=3,q²=0.659,r²=0.917,F=44.41...

【文章頁數(shù)】：99 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 緒論
    1.1 艾滋病簡介及國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.2 HIV-1 的結(jié)構(gòu)、生命周期及抗HIV藥物的作用靶點
    1.3 HIV-1 RT的概述和分類
    1.4 NNRTIs的作用機制及抗耐藥性
    1.5 課題研究的目的與意義
2 計算機輔助藥物設(shè)計
    2.1 計算機輔助藥物設(shè)計簡介
    2.2 研究方法概述
        2.2.1 間接藥物設(shè)計
        2.2.2 直接藥物設(shè)計
        2.2.3 易位體比較分子場
        2.2.4 分子的虛擬篩選
        2.2.5 分子全息定量構(gòu)效關(guān)系
        2.2.6 分子對接
        2.2.7 建模方法及評價
3 S-DABO類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑的Topomer CoMFA及分子對接
    3.1 數(shù)據(jù)集選擇與劃分
    3.2 化合物結(jié)構(gòu)的構(gòu)建與優(yōu)化
    3.3 實驗過程及結(jié)果分析
        3.3.1 Topomer CoMFA建模與評價
        3.3.2 模型的三維等勢圖
        3.3.3 分子設(shè)計
        3.3.4 分子對接
    3.4 小結(jié)
4 R基團(tuán)搜索技術(shù)用于硫代氨基甲酸酯類非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑的分子設(shè)計
    4.1 數(shù)據(jù)集選擇與劃分
    4.2 化合物結(jié)構(gòu)的構(gòu)建與優(yōu)化
    4.3 實驗過程及結(jié)果分析
        4.3.1 Topomer CoMFA建模與評價
        4.3.2 模型的三維等勢圖
        4.3.3 分子設(shè)計
    4.4 小結(jié)
5 DAPY類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑的Topomer CoMFA及分子對接
    5.1 數(shù)據(jù)集選擇與劃分
    5.2 化合物結(jié)構(gòu)的構(gòu)建與優(yōu)化
    5.3 實驗過程及結(jié)果分析
        5.3.1 Topomer CoMFA建模與評價
        5.3.2 模型的三維等勢圖
        5.3.3 分子設(shè)計
        5.3.4 分子對接
    5.4 小結(jié)
6 1,3-噻唑烷-4-酮衍生物的Topomer CoMFA及分子對接
    6.1 數(shù)據(jù)集選擇與劃分
    6.2 化合物結(jié)構(gòu)的構(gòu)建與優(yōu)化
    6.3 實驗過程及結(jié)果分析
        6.3.1 Topomer CoMFA建模與評價
        6.3.2 模型的三維等勢圖
        6.3.3 分子設(shè)計
        6.3.4 分子對接
    6.4 小結(jié)
7 DATA類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑的Topomer CoMFA、HQSAR及分子對接
    7.1 數(shù)據(jù)集選擇與劃分
    7.2 化合物結(jié)構(gòu)的構(gòu)建與優(yōu)化
    7.3 實驗過程及結(jié)果分析
        7.3.1 HQSAR建模及評價
        7.3.2 Topomer CoMFA建模與評價
        7.3.3 HQSAR色碼圖與Topomer CoMFA三維等勢圖
        7.3.4 分子設(shè)計
        7.3.5 分子對接
    7.4 小結(jié)
8 結(jié)論、創(chuàng)新點與展望
    8.1 結(jié)論
    8.2 創(chuàng)新點
    8.3 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位論文期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文



本文編號：3736830