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出芽短梗霉糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因的預(yù)測(cè)、克隆及敲除

發(fā)布時(shí)間:2021-10-19 03:35
  出芽短梗霉(Aureobasidiumpullulans)又稱黑酵母,是一種類酵母樣真菌,在其發(fā)酵過程中會(huì)產(chǎn)生普魯蘭。普魯蘭是具有良好生物活性的大分子聚合物,在食品、醫(yī)藥、環(huán)保以及化妝品等眾多領(lǐng)域都具有重要的應(yīng)用價(jià)值。它的前體物質(zhì)在細(xì)胞體內(nèi)產(chǎn)生,在糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的幫助下分泌至胞外參與普魯蘭的合成。糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在微生物發(fā)酵過程中起著重要作用,不僅是參與細(xì)胞外糖分的吸收,還包括協(xié)助細(xì)胞中糖類代謝物的釋放。本論文以出芽短梗霉(A.pullulans CCTCC M 2012259)為出發(fā)菌株,對(duì)其細(xì)胞中的糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行了研究。我們預(yù)測(cè)其編碼糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白相關(guān)的基因信息,對(duì)這些基因進(jìn)行敲除改造,篩選突變菌株,并從發(fā)酵過程、普魯蘭產(chǎn)量等方面與出發(fā)菌株進(jìn)行比較,探究糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在出芽短梗霉合成胞外多糖過程中的作用。主要的研究?jī)?nèi)容及結(jié)果如下:1.在對(duì)本實(shí)驗(yàn)室一株出芽短梗霉進(jìn)行全基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,利用三種不同的生物信息學(xué)方法,即同源預(yù)測(cè)、從頭預(yù)測(cè)以及基于RNA-seq的數(shù)據(jù)分析,將基因組信息與數(shù)據(jù)庫中所有真菌已知的糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白信息進(jìn)行比對(duì)研究,初步篩選得到出芽短梗霉中可能的糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因。接著采用GENSCA... 

【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:103 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

出芽短梗霉糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因的預(yù)測(cè)、克隆及敲除


圖1-2普魯蘭的分子結(jié)構(gòu)??Fig.?1?-2?Molecular?structure?of?pullulan??

出芽短梗霉糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因的預(yù)測(cè)、克隆及敲除


圖1-3普魯蘭的合成及分泌??Fig.?1-3?Synthesis?and?secretion?of?extracellular?polysaccharides??

流程圖,流程圖,同源重組,干重


出芽短梗霉糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因的預(yù)測(cè)、克隆及敲除?第一章??C::.二二二一?a??.4?puUidamCvicC?M?2012259?j??聾基因組?'…j??斗..彳-m??;?.?-:.?......??辱?廠---->?同源預(yù)側(cè)??-[■----->?基于《1^-5叫數(shù)據(jù)分析??染一?L_—從頭麵??1-——->?ta?克隆??▼?r?PtrpC-hyg-TtrpC??篩選兀#的構(gòu)建??|?L同源重組敲除載體的構(gòu)建??|?f■昔魯蘭產(chǎn)量??y?1L細(xì)胞干重??圖1-4本論文的流程圖??Fig.?1-4?Flow?chart?of?this?thesis??11??


本文編號(hào):3444075

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