數(shù)據(jù)庫的發(fā)展極大地促進(jìn)了科學(xué)研究,整合特定研究領(lǐng)域多種數(shù)據(jù)庫的信息,獲得全面的信息,便于在研究中做出科學(xué)的決策。在過去的40年里,人們建立了幾十個(gè)與農(nóng)藥相關(guān)的開放訪問數(shù)據(jù)庫,這些數(shù)據(jù)庫收集了農(nóng)藥的活性、毒性、作用機(jī)制和環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)等信息。但,這些數(shù)據(jù)分散在不同的農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫中,而且數(shù)據(jù)內(nèi)容重疊且格式不一,不利于創(chuàng)新農(nóng)藥的研究。系統(tǒng)地分析現(xiàn)有開放訪問農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)容,提取有用信息,并將其整合,有助于在農(nóng)藥研發(fā)的過程中做出正確的決策。本研究收集和梳理了現(xiàn)有的開放訪問農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫中的具體內(nèi)容,并根據(jù)現(xiàn)代農(nóng)藥研究需要的具體信息,將多個(gè)農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)容整合到一站式的農(nóng)藥信息資源網(wǎng)站Pesticide Information Center（PIC,weilab.hzau.edu.cn）中,為用戶提供全面、非冗余的農(nóng)藥信息資源�；谛》肿咏Y(jié)構(gòu)的相似性,PIC可用于預(yù)測(cè)新農(nóng)藥分子的可能的靶點(diǎn)。并且,基于PIC中的農(nóng)藥分子與G-四鏈體配體分子的相似性,本研究發(fā)現(xiàn)了具有抗腫瘤活性的、靶向G-四鏈體的農(nóng)藥小分子類似物。本論文的主要研究如下:1.梳理和整理了25個(gè)農(nóng)藥相關(guān)的開放訪問數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)容,并將這些數(shù)據(jù)歸屬... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：84 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

農(nóng)藥研究的創(chuàng)新和優(yōu)化過程(Lamberthetal2013)

圖 1.2 農(nóng)藥研發(fā)的三個(gè)階段和時(shí)間軸Fig. 1.2 Three stages and timelines for pesticide development2.2 開放訪問農(nóng)藥數(shù)據(jù)庫在農(nóng)藥研發(fā)過程中的作用在 2.1 中介紹的每一個(gè)農(nóng)藥研發(fā)階段，都會(huì)產(chǎn)生海量的數(shù)據(jù)和信息，這些數(shù)有利于在農(nóng)藥研發(fā)的過程中做出決策，具有非常重要的參考價(jià)值。開放訪問的農(nóng)數(shù)據(jù)庫則存儲(chǔ)了這些數(shù)據(jù)，并允許用戶免費(fèi)地讀取、復(fù)制、下載、打印或在其它律允許范圍內(nèi)使用(Williams 2008)，在靶標(biāo)選擇、先導(dǎo)識(shí)別、先導(dǎo)優(yōu)化和候選化合選擇等方面發(fā)揮著重要作用(Gaulton et al 2010)。在合理的農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)初期，分析與病蟲害相關(guān)的基因組信息，了解涉及到蛋白序列和核酸序列的信息，確定與病蟲害相關(guān)的靶標(biāo)，并分析靶標(biāo)分子的結(jié)構(gòu)

農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫的信息整合及穩(wěn)定 G-四鏈體的農(nóng)藥小分子類似物發(fā)掘醫(yī)藥的相似性子與醫(yī)藥分子結(jié)構(gòu)相似性以及其作用靶點(diǎn)的相似一詞在公眾的心目中往往是劇毒、高污染的代名詞。然而部分新型農(nóng)藥具有較高的選擇性，因此在安全性方面得到藥具有很多相似的特征，包括結(jié)構(gòu)、物理化學(xué)性質(zhì)和靶點(diǎn)on et al 2011, Jampilek 2016)�？蒲腥藛T在生物活性測(cè)試時(shí)合物具有農(nóng)藥活性，反之亦然。農(nóng)藥分子和醫(yī)藥分子在結(jié)藥分子中最常見的 20 種化學(xué)側(cè)鏈與醫(yī)藥分子的相同。圖農(nóng)藥分子和醫(yī)藥分子。

【參考文獻(xiàn)】：
碩士論文
[1]分子對(duì)接程序重構(gòu)G-四鏈體—配體小分子復(fù)合物的能力評(píng)價(jià)[D]. 侯海濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3421994