利用分子改造技術(shù)提高富馬酸酶的熱穩(wěn)定性
發(fā)布時(shí)間:2021-07-14 18:22
富馬酸酶(fumarase,EC4.2.1.2)是三羧酸循環(huán)中的關(guān)鍵酶之一,催化富馬酸轉(zhuǎn)化為L(zhǎng)-蘋(píng)果酸這一可逆反應(yīng)。由于具有相對(duì)較好的熱穩(wěn)定性且反應(yīng)不依賴(lài)于鐵離子,其中的富馬酸酶C(FumC)被應(yīng)用于L-蘋(píng)果酸的工業(yè)生產(chǎn)。隨著國(guó)家對(duì)環(huán)保的日益重視和環(huán)保稅的開(kāi)征,企業(yè)在節(jié)能降耗減排方面的需求也與日俱增。進(jìn)一步提高FumC的穩(wěn)定性,不但可以降低固定化酶在工業(yè)使用環(huán)境下的失活速率,延長(zhǎng)其使用壽命,而且有利于降低單位產(chǎn)品的原料和能源消耗,減少污染物排放,具有重要的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益。本論文在調(diào)研國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上,選取了五種不同來(lái)源的FumC基因,在大腸桿菌BL21(DE3)中進(jìn)行克隆表達(dá),基于單位發(fā)酵液體積的酶活與純酶比酶活的測(cè)定和比較,選取了來(lái)源于大腸桿菌的FumC(EEF)和來(lái)源于谷氨酸棒狀桿菌的FumC(EGF)進(jìn)行轉(zhuǎn)化率和穩(wěn)定性的研究。將含這兩種酶的重組菌全細(xì)胞固定化,考察其催化富馬酸產(chǎn)L-蘋(píng)果酸的反應(yīng),結(jié)果表明,兩者對(duì)底物的轉(zhuǎn)化率都能達(dá)到80%左右,且在持續(xù)22個(gè)反應(yīng)批次間轉(zhuǎn)化率都沒(méi)有明顯下降,均具有工業(yè)應(yīng)用的潛力。所以,選擇這兩種FumC同時(shí)進(jìn)行熱穩(wěn)定性的改造。首先,以EGF為親本,...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:111 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.3?II類(lèi)富馬酸酶單體的結(jié)構(gòu)示意圖??Fig.?1.3?Structure?diagram?of?class?II?fumarase?monomer??
II類(lèi)富馬酸酶四聚體的每個(gè)亞基都是由Dl,D2和D3這三個(gè)結(jié)構(gòu)域形成的??啞鈐狀的單體結(jié)構(gòu)。D1始于N末端,D3位于多肽鏈的C末端,中心域D2由一??個(gè)獨(dú)特的五螺旋束組成。II類(lèi)富馬酸酶單體的結(jié)構(gòu)示意圖見(jiàn)圖1.3[M],圖中的紅??色、綠色和紫色三部分代表了超家族內(nèi)并置的三個(gè)高度保守區(qū)域,分別為區(qū)域一、??區(qū)域二和區(qū)域三。II類(lèi)富馬酸酶四聚體的結(jié)構(gòu)示意圖見(jiàn)圖1.4[23】,在四聚體結(jié)構(gòu)??中,四個(gè)D2結(jié)構(gòu)域的結(jié)合形成了含有20個(gè)幾乎平行的a-螺旋的核心。另外兩個(gè)??結(jié)構(gòu)域D1和D3拓展了核心單元的頂部,底部和兩側(cè),并在四聚體的上下兩端??蓋住了螺旋束。II類(lèi)富馬酸酶中的三個(gè)保守區(qū)域在單體結(jié)構(gòu)上是互不相鄰的,圖??中的紅色就表示了在同一個(gè)亞基內(nèi)的三個(gè)保守區(qū)域。但來(lái)自三個(gè)不同亞基的三個(gè)??保守區(qū)域在四聚體中卻是以并列的方式排列在一起,區(qū)域中的氨基酸側(cè)鏈聚合形??成了酶的活性位點(diǎn),活性位點(diǎn)位于D1和D2結(jié)構(gòu)域之間。圖1.4中活性位點(diǎn)的??紫色
浙江大學(xué)碩士論文?玄獻(xiàn)綜詁??圖1.4?II類(lèi)富馬酸酶四聚體的結(jié)構(gòu)示意圖??Fig.?1.4?Structure?diagram?of?class?II?fumarase?tetramer??在大腸桿菌FumC和酵母fumarase的中均發(fā)現(xiàn)了與活性位點(diǎn)上的氨基酸殘??基形成了氫鍵的水分子,說(shuō)明水分子在酶的催化過(guò)程中起到了重要的作用。有些??II類(lèi)富馬酸酶還能被底物或其它二羧酸及陰離子在活性位點(diǎn)之外的第二結(jié)合位??點(diǎn)激活。例如大腸桿菌的FumC不但能因檸檬酸與活性位點(diǎn)(siteA)的結(jié)合而??被激活,也能因L-蘋(píng)果酸結(jié)合到活性位點(diǎn)附近約12?A的二羧酸結(jié)合位點(diǎn)(site?B)??后被激活。由于L-蘋(píng)果酸在該反應(yīng)中起到了激活劑的作用,因此認(rèn)為該第二結(jié)??合位點(diǎn)是激活因子的激活位點(diǎn)(activatorsite);钚晕稽c(diǎn)是由來(lái)自三個(gè)亞基的??三個(gè)保守區(qū)域共同形成的結(jié)構(gòu),而激活位點(diǎn)是由一個(gè)亞基單獨(dú)形成[3()]。??1.2.3富馬酸酶熱穩(wěn)定性的研究現(xiàn)狀??由于富馬酸酶應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸時(shí)具有工藝簡(jiǎn)單,轉(zhuǎn)化率高的優(yōu)點(diǎn),??故受到生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸的廠家的重視?紤]到生產(chǎn)過(guò)程中的操作便捷性和生產(chǎn)的??成本,工業(yè)上基本采用全細(xì)胞來(lái)催化富馬酸生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸。但是在反應(yīng)溫度不??高的條件下,細(xì)胞中的琥珀酸脫氫酶和其他雜酶會(huì)催化富馬酸生成琥珀酸等副產(chǎn)??物
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蛋白質(zhì)定向進(jìn)化技術(shù)概述[J]. 王松明,顧招兵,朱雅新,冷靜,馮勵(lì),李清,楊舒黎. 中國(guó)飼料. 2017(14)
[2]兩種不同來(lái)源富馬酸酶酶學(xué)性質(zhì)比較[J]. 吳四平,陸陽(yáng),劉均忠,劉茜,焦慶才. 發(fā)酵科技通訊. 2016(01)
[3]酶定向進(jìn)化方法的研究進(jìn)展[J]. 張林,朱小翌,江明鋒. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2013(08)
[4]L-蘋(píng)果酸生物合成研究進(jìn)展[J]. 吳軍林,吳清平,張菊梅,張文,莫樹(shù)平,柏建玲. 食品科學(xué). 2014(03)
[5]易錯(cuò)PCR研究進(jìn)展及應(yīng)用[J]. 高義平,趙和,呂孟雨,楊學(xué)舉,王海波. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(05)
[6]蛋白質(zhì)體外定向進(jìn)化策略研究進(jìn)展[J]. 付暢,林海龍,李,,王得江. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(07)
[7]S-2-氯丙酸脫鹵酶的定向進(jìn)化及其應(yīng)用[J]. 劉鵬,林春嬌,楊立榮,徐剛,吳堅(jiān)平. 中國(guó)生物工程雜志. 2012(05)
[8]全生物法生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸的研究進(jìn)展[J]. 林海龍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(03)
[9]L-蘋(píng)果酸的生理功能研究進(jìn)展[J]. 吳軍林,吳清平,張菊梅. 食品科學(xué). 2008(11)
[10]甘油脫水酶的理性設(shè)計(jì):基因雜合改善酶的性質(zhì)[J]. 齊向輝,羅兆飛,吳杰群,孟曉蕾,唐悅,韋宇拓,黃日波. 科學(xué)通報(bào). 2006(20)
本文編號(hào):3284651
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:111 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.3?II類(lèi)富馬酸酶單體的結(jié)構(gòu)示意圖??Fig.?1.3?Structure?diagram?of?class?II?fumarase?monomer??
II類(lèi)富馬酸酶四聚體的每個(gè)亞基都是由Dl,D2和D3這三個(gè)結(jié)構(gòu)域形成的??啞鈐狀的單體結(jié)構(gòu)。D1始于N末端,D3位于多肽鏈的C末端,中心域D2由一??個(gè)獨(dú)特的五螺旋束組成。II類(lèi)富馬酸酶單體的結(jié)構(gòu)示意圖見(jiàn)圖1.3[M],圖中的紅??色、綠色和紫色三部分代表了超家族內(nèi)并置的三個(gè)高度保守區(qū)域,分別為區(qū)域一、??區(qū)域二和區(qū)域三。II類(lèi)富馬酸酶四聚體的結(jié)構(gòu)示意圖見(jiàn)圖1.4[23】,在四聚體結(jié)構(gòu)??中,四個(gè)D2結(jié)構(gòu)域的結(jié)合形成了含有20個(gè)幾乎平行的a-螺旋的核心。另外兩個(gè)??結(jié)構(gòu)域D1和D3拓展了核心單元的頂部,底部和兩側(cè),并在四聚體的上下兩端??蓋住了螺旋束。II類(lèi)富馬酸酶中的三個(gè)保守區(qū)域在單體結(jié)構(gòu)上是互不相鄰的,圖??中的紅色就表示了在同一個(gè)亞基內(nèi)的三個(gè)保守區(qū)域。但來(lái)自三個(gè)不同亞基的三個(gè)??保守區(qū)域在四聚體中卻是以并列的方式排列在一起,區(qū)域中的氨基酸側(cè)鏈聚合形??成了酶的活性位點(diǎn),活性位點(diǎn)位于D1和D2結(jié)構(gòu)域之間。圖1.4中活性位點(diǎn)的??紫色
浙江大學(xué)碩士論文?玄獻(xiàn)綜詁??圖1.4?II類(lèi)富馬酸酶四聚體的結(jié)構(gòu)示意圖??Fig.?1.4?Structure?diagram?of?class?II?fumarase?tetramer??在大腸桿菌FumC和酵母fumarase的中均發(fā)現(xiàn)了與活性位點(diǎn)上的氨基酸殘??基形成了氫鍵的水分子,說(shuō)明水分子在酶的催化過(guò)程中起到了重要的作用。有些??II類(lèi)富馬酸酶還能被底物或其它二羧酸及陰離子在活性位點(diǎn)之外的第二結(jié)合位??點(diǎn)激活。例如大腸桿菌的FumC不但能因檸檬酸與活性位點(diǎn)(siteA)的結(jié)合而??被激活,也能因L-蘋(píng)果酸結(jié)合到活性位點(diǎn)附近約12?A的二羧酸結(jié)合位點(diǎn)(site?B)??后被激活。由于L-蘋(píng)果酸在該反應(yīng)中起到了激活劑的作用,因此認(rèn)為該第二結(jié)??合位點(diǎn)是激活因子的激活位點(diǎn)(activatorsite);钚晕稽c(diǎn)是由來(lái)自三個(gè)亞基的??三個(gè)保守區(qū)域共同形成的結(jié)構(gòu),而激活位點(diǎn)是由一個(gè)亞基單獨(dú)形成[3()]。??1.2.3富馬酸酶熱穩(wěn)定性的研究現(xiàn)狀??由于富馬酸酶應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸時(shí)具有工藝簡(jiǎn)單,轉(zhuǎn)化率高的優(yōu)點(diǎn),??故受到生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸的廠家的重視?紤]到生產(chǎn)過(guò)程中的操作便捷性和生產(chǎn)的??成本,工業(yè)上基本采用全細(xì)胞來(lái)催化富馬酸生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸。但是在反應(yīng)溫度不??高的條件下,細(xì)胞中的琥珀酸脫氫酶和其他雜酶會(huì)催化富馬酸生成琥珀酸等副產(chǎn)??物
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蛋白質(zhì)定向進(jìn)化技術(shù)概述[J]. 王松明,顧招兵,朱雅新,冷靜,馮勵(lì),李清,楊舒黎. 中國(guó)飼料. 2017(14)
[2]兩種不同來(lái)源富馬酸酶酶學(xué)性質(zhì)比較[J]. 吳四平,陸陽(yáng),劉均忠,劉茜,焦慶才. 發(fā)酵科技通訊. 2016(01)
[3]酶定向進(jìn)化方法的研究進(jìn)展[J]. 張林,朱小翌,江明鋒. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2013(08)
[4]L-蘋(píng)果酸生物合成研究進(jìn)展[J]. 吳軍林,吳清平,張菊梅,張文,莫樹(shù)平,柏建玲. 食品科學(xué). 2014(03)
[5]易錯(cuò)PCR研究進(jìn)展及應(yīng)用[J]. 高義平,趙和,呂孟雨,楊學(xué)舉,王海波. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(05)
[6]蛋白質(zhì)體外定向進(jìn)化策略研究進(jìn)展[J]. 付暢,林海龍,李,,王得江. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(07)
[7]S-2-氯丙酸脫鹵酶的定向進(jìn)化及其應(yīng)用[J]. 劉鵬,林春嬌,楊立榮,徐剛,吳堅(jiān)平. 中國(guó)生物工程雜志. 2012(05)
[8]全生物法生產(chǎn)L-蘋(píng)果酸的研究進(jìn)展[J]. 林海龍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(03)
[9]L-蘋(píng)果酸的生理功能研究進(jìn)展[J]. 吳軍林,吳清平,張菊梅. 食品科學(xué). 2008(11)
[10]甘油脫水酶的理性設(shè)計(jì):基因雜合改善酶的性質(zhì)[J]. 齊向輝,羅兆飛,吳杰群,孟曉蕾,唐悅,韋宇拓,黃日波. 科學(xué)通報(bào). 2006(20)
本文編號(hào):3284651
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/hxgylw/3284651.html
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