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伊氏錐蟲(Trypanosoma evansi)全基因組的深入分析及抑制劑靶向關鍵酶的初步研究

發(fā)布時間:2021-07-02 20:58
  伊氏錐蟲(Trypanosoma evansi)是一種真核的單細胞血液鞭毛蟲,寄生于幾乎所有的脊椎動物體內(nèi),能通過蠅、虻作為媒介(vector)在動物之間傳播,也可通過生食感染動物的肉和血經(jīng)破損的黏膜組織直接傳播。伊氏錐蟲感染野生動物和家畜引起動物錐蟲病,又稱蘇拉。⊿urra),該病廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)。近年來,也有伊氏錐蟲感染人的報道,提示伊氏錐蟲具有成為人獸共患寄生蟲病病原的可能性。目前對該病的有效防治手段較少,其對畜牧業(yè)和野生動物的危害仍然嚴重。伊氏錐蟲利用其體表變異的表面糖蛋白(VSG)逃避宿主的免疫識別,深入解析該病原的分子生物學特性是建立有效防治措施的理論依據(jù)。伊氏錐蟲的近緣物種布氏錐蟲(Trypanosoma brucei)的基因組數(shù)據(jù)為伊氏錐蟲和布氏錐蟲的比較基因組學研究提供了良好的基礎。伊氏錐蟲的20 S蛋白酶體(20 S Proteasome)和磷酯酰肌醇3-激酶(PI3K)參與蛋白質(zhì)降解途徑和PI3K-AKT信號通路,抑制這兩種酶的活性能夠影響蟲體生長發(fā)育和凋亡,二者有望成為潛在的新藥靶標。本研究利用三代PacBio SMART測序平臺,構建伊氏錐蟲的27... 

【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省

【文章頁數(shù)】:137 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

伊氏錐蟲(Trypanosoma evansi)全基因組的深入分析及抑制劑靶向關鍵酶的初步研究


伊氏錐蟲的形態(tài)結構

序列,真核生物


沈陽農(nóng)業(yè)大學博士學位論文11末端外顯子(alternativepolyAsiteandterminalexon)。其中,內(nèi)含子保留和外顯子跳躍是哺乳動物最常見的AS方式,至少占已知所有AS的三分之一(Sammethetal,2008)。可變的5"或3"剪接點AS也很常見,共同占已知AS事件的四分之一,這種類型的AS能夠在編碼序列中引入極細微的變化,差異僅為單個密碼子,例如人基因組中約30%的基因包含NAGNAG序列,這些序列有可能充當串聯(lián)剪接位點的受體(Michaeletal,2004)。圖1-2真核生物轉(zhuǎn)錄的可變剪接(Michaeletal,2004)圖中左側(cè)為真核生物的七種類型可變剪接,右側(cè)為這七種可變剪接形成的不同轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。Figure1-2ASeventsineukaryotetranscripts(original)TheleftcolumisseventypesofASineukaryotes,whiletherightcolumistheirdifferenttranscriptionproducts.

真核生物,機制,外顯子,受體


第一章文獻綜述14圖1-3真核生物的剪接機制(ZefengandBurge,2008)(A)剪接體組裝的復合體示意圖,SR蛋白與剪接增強子位點結合,U1snRNP和U2AF分別與供體位點和受體位點結合。U2snRNP與分支點結合(Matlinetal,2005b);(B)剪接抑制的廣義模型。剪接抑制蛋白(多數(shù)為hnRNPs)與外顯子(ESS)和內(nèi)含子(ISS)中的剪接沉默子結合。它們抑制U1snRNP與供體位點的結合,抑制U2AFS和U2snRNP與受體位點和分支點的結合。這個過程導致跳過外顯子(黃色)形成剪接抑制(ZefengandBurge,2008);(C)剪接活化的廣義模型。ESE為外顯子,ISE為內(nèi)含子。U1snRNP和U2AFS、U2snRNP分別與受體和供體位點結合(ZefengandBurge,2008)。Figure1-3Mechanismofsplicingineukaryotes(A)Complexofspliceosomeassembly.SRbindstothespliceenhanersiteandassistsU1snRNPtobindtothedonorsite,andU2AFbindstoacceptorsiteandthepolypyrimidinebundle.U2snRNPbindswithbranchpoint;(B)Generalizedmodelofspliceinhibition.Splicinginhibitoryproteins(mostlyhnRNPs)bindtosplicesilencersinexons(ESS)andintrons(ISS).TheyinhibitthebindingofU1snRNPtothedonorsiteandthebindingofU2AFSandU2snRNPtotheacceptorsiteandthebranchsite.Thisprocesscausesskippingexons(yellow)toformsplicesuppression;(C)GeneralizedModelofSplicingActivation.Splicingactivatingproteins(mainlySRproteins)bindtosplicingenhancersinexons(ESE)andintrons(ISE).TheyfacilitatethebindingofU1snRNPtothedonorsiteandthebindingofU2AFSandU2snRNPtotheacceptorsiteandthepivot.1.2.1.5可變剪接的分析方法對全基因組范圍內(nèi)的AS分析有很多種方法。對大量EST測序,通過比較序列差異尋找AS轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的方法具

【參考文獻】:
期刊論文
[1]26S蛋白酶體的結構生物學研究進展[J]. 王豐,施一公.  中國科學:生命科學. 2014(10)



本文編號:3261217

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