由于海洋環(huán)境的特殊性,海洋放線菌可能具有獨(dú)特的代謝特征,其合成的次生代謝物是多種新天然產(chǎn)物和活性物質(zhì)的重要來源,因此,利用海洋放線菌生產(chǎn)次生代謝物得到了國內(nèi)外研究者的廣泛關(guān)注。已知多種環(huán)境條件可影響放線菌合成次生代謝物,但是光照的作用到目前為止研究很有限�；诜肿泳W(wǎng)絡(luò)策略的質(zhì)譜分析平臺GNPS（Global Natural Product Social Molecular Networking）可用于在高效液相質(zhì)譜檢測大量樣品后快速篩選到目標(biāo)產(chǎn)物或排除重復(fù)發(fā)現(xiàn)的物質(zhì),并且有助于發(fā)現(xiàn)并鑒定已知化合物的新穎類似物。另一方面,利用基因組挖掘可加速新天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn),但目前對海洋放線菌基因組挖掘的研究還比較有限�；蚪M測序技術(shù)的快速發(fā)展使微生物天然產(chǎn)物的生物合成基因信息更易獲得,并深入開發(fā)微生物的生物合成潛力,但是利用基因信息快速確定和分離鑒定預(yù)測的化合物仍然存在挑戰(zhàn)。因此,結(jié)合GNPS平臺和基因組挖掘技術(shù)可有助于加速研究和開發(fā)海洋放線菌天然產(chǎn)物的生物合成潛力。本文首先利用高效液相質(zhì)譜技術(shù)結(jié)合GNPS分子網(wǎng)絡(luò)分析平臺,研究了光照和黑暗條件下63株海洋放線菌次生代謝物的合成情況。結(jié)果表明,光照對放... 

【文章來源】：大連理工大學(xué)遼寧省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：176 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

GNPS數(shù)據(jù)比對的原理及過程p71

?大連理工大學(xué)博士學(xué)位論文???菌和微球菌（Ｍ／ｃｒｏｃｏｃｃｉｗ）１？１。放線菌包含了很廣泛的形態(tài)，從球菌（例??如微球菌）或桿菌（例如節(jié)桿菌〇４ｒ／／？ｒｏＺｗｃ＾ｒ））至片段化菌絲形式（例如諾卡氏菌屬??或永久性的高度分化的支鏈菌絲體（例如鏈霉菌）。它們同樣有著多樣化的??生理和代謝特性，如胞外酶和多樣化的次生代謝產(chǎn)物１＂１。值得注意的是，許多次級代謝??產(chǎn)物是有效的抗生素這將鏈霉菌屬變?yōu)橹扑幑I(yè)的主要抗生素生產(chǎn)生物［１（）１】。??

Ｓ由一系列的模塊順次排列組成，大多數(shù)ＮＲＰＳ的模塊數(shù)為４？１０個，但個的，每個組件又由不同的結(jié)構(gòu)域構(gòu)成。模塊的特異結(jié)構(gòu)域具有特定的酶單體結(jié)合到新生鏈肽中。這其中主要包括識別、激活氨基酸的腺苷�；Y(jié)ｉｏｎ／Ａ－ｄｏｍａｉｎ），將氨基酸通過硫醋鍵連接在酶分子的疏基結(jié)構(gòu)域（ｔｈｉｏｌａｔｉｏ通過肽鍵將氨基酸連接在肽鏈上的縮合結(jié)構(gòu)域（ｃｏｎｄｅｎｓａｔｉｏｎ／Ｃ－ｄｏｍａｉｎ）。責(zé)氧基酸修飾的差相異構(gòu)化結(jié)構(gòu)域（ｅｐ?ｉｍｅｒａｓｅ／Ｅ－ｄｏｍａｉｎ）、甲基化結(jié)ｉｏｎ／Ｍ－ｄｏｍａｉｎ）和負(fù)責(zé)解離終產(chǎn)物的硫醋結(jié)構(gòu)域（ｔｈｉｏｅｓｔｅｒａｓｅ／Ｔｅ－ｄｏｍａｉｎ）。Ｎ成是Ａ－ＰＣＰ－（Ｃ－ＡＰＣＰ）ｎ－Ｔｅ，其中一些模塊附加了定制域。在肽合成的每７）中，Ａ結(jié)構(gòu)域特異性結(jié)合其同源底物，并首先通過腺苷酸化活化，然后ＣＰ結(jié)構(gòu)域的４’－磷酸泛酰乙烯基（ＰＰＥ）臂上。當(dāng)前和以前模塊的ＰＣＰ結(jié)構(gòu)合的底物轉(zhuǎn)運(yùn)到Ｃ結(jié)構(gòu)域的活性位點(diǎn)。Ｃ結(jié)構(gòu)域催化兩個底物之間的肽鍵生長的肽鏈轉(zhuǎn)移到受體ＰＣＰ結(jié)構(gòu)域時延長生長的肽鏈。在該縮合反應(yīng)之后，連接到當(dāng)前模塊的ＰＣＰ結(jié)構(gòu)域的ＰＰＥ臂）攜帶到下一個模塊的Ｃ結(jié)構(gòu)域，的縮合反應(yīng)中進(jìn)行轉(zhuǎn)移。這兩者都釋放了?ＰＣＰ結(jié)構(gòu)域，以參與當(dāng)前模塊內(nèi)


本文編號：3063551