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恩拉霉素高產(chǎn)菌株的定向選育

發(fā)布時間:2020-06-11 15:23
【摘要】:恩拉霉素是一種多肽類抗生素,是殺真菌素鏈霉菌(Streptomycesfungicidicus)經(jīng)過發(fā)酵獲得的次級代謝產(chǎn)物,可抑制革蘭氏陽性菌生長。恩拉霉素多用于飼料中,可有效提高飼料的利用率,有利于動物的增重。恩拉霉素作為飼料添加劑,不易被腸道吸收,可直接排出體外,不會造成動物體內(nèi)抗生素殘留問題;長期使用不易產(chǎn)生耐藥性,也不會與其它臨床應(yīng)用的抗生素產(chǎn)生交叉耐藥性。因此恩拉霉素是目前僅有的幾種可用于飼料添加劑的抗生素之一,近年來,國內(nèi)外需求有明顯上升趨勢。目前恩拉霉素的生產(chǎn)方式為微生物發(fā)酵法,但其生產(chǎn)過程中普遍存在恩拉霉素產(chǎn)量低、菌株生產(chǎn)穩(wěn)定性差,生產(chǎn)菌種退化嚴重等問題,因此導(dǎo)致目前國內(nèi)恩拉霉素生產(chǎn)成本一直居高不下。本研究針對恩拉霉素生產(chǎn)菌產(chǎn)素水平低、退化現(xiàn)象嚴重等問題,通過分子生物學等手段將一個硫鏈絲菌素抗性標記基因(tsr ORF)整合至恩拉霉素生物合成基因簇中,使硫鏈絲菌素抗性基因的表達與恩拉霉素生物合成基因簇中某些關(guān)鍵基因的表達相連鎖,并通過硫鏈絲菌素高抗性篩選,獲得恩拉霉素生物合成基因穩(wěn)定表達(或高表達)菌株,即恩拉霉素高產(chǎn)菌株。根據(jù)對恩拉霉素生物合成基因簇的分析,其中endA、endB、endC、endD是恩拉霉素生物合成過程中負責編碼非核糖體多肽合成酶的關(guān)鍵基因。將硫鏈絲菌素抗性基因分別對齊部分替換這4個非核糖體多肽聚合酶NRPS基因,通過硫鏈絲菌素抗性篩選獲取菌株具備較大的產(chǎn)素潛力的菌株;最后通過基因回補實驗,去除tsr標記基因,恢復(fù)原有基因結(jié)構(gòu),從而獲得恩拉霉素高產(chǎn)菌株。但由于該方法需要基因回補實驗較為繁瑣,于是對此方法進行了進一步改進,將tsr基因插入到nrps基因后,不影響恩拉霉素基因簇的表達,使硫鏈絲菌素抗性基因(tsr)串聯(lián)在nrps基因后使得與恩拉霉素生物合成基因表達相關(guān)聯(lián)。該方法為恩拉霉素高產(chǎn)菌株的選育提供了一個篩選標記,通過抗性篩選標記篩選退化菌株中強壯菌株,解決了傳代過程中造成的菌株不斷退化問題,以及通過抗性篩選獲得高產(chǎn)菌株,此方法大大提高了恩拉霉素高產(chǎn)菌株的篩選效率,該方法是用于恩拉霉素高產(chǎn)菌株定向選育的一個新方法。本實驗還通過對恩拉霉素生物合成過程中的調(diào)控基因進行研究,通過基因敲除方法分析調(diào)控基因?qū)Χ骼顾睾铣傻挠绊?通過對正調(diào)控基因過表達的方法達到提高恩拉霉素的產(chǎn)量。構(gòu)建的過表達菌株平均效價為4380 U/mL,出發(fā)菌株S.fun TCCC F110發(fā)酵液的效價為3868 U/mL,過表達菌株產(chǎn)恩拉霉素能力比S.fun TCCC F110株提高了 13.24%。
【圖文】:

恩拉霉素,生物合成基因簇


手段對恩拉霉素生產(chǎn)菌株進行改造提供了依據(jù)。恩拉霉素生物合成基因簇長84邋kb左逡逑右,25個開放閱讀框,,其中w;/36、37、38、40四個開放閱讀框是四個NRPS基因,逡逑負責生物合成大環(huán)骨架[28]。恩拉霉素生物合成基因簇如圖1-3所示。該圖源于The逡逑enduracidin邋biosynthetic邋gene邋cluster邋from邋Streptomyces邋fungicidicus邋41邋0逡逑0rf1邋2邐3邐4邋S邐6邐7邐8邐9邐10邐11邐12邐13邐14邐15邋1S邋17邐18邋19逡逑C=C>C=C>Cc£C><=3邋[==士ZZ=C><=^t==C>t==><C===3C=3<^3<C:^==^t====>CZ^C=><^ZK><===l逡逑20邋21邐22邐23邋24邋25邋mndR邋?ndQ邋?n<iP邋29邐30邋31邋32邋33邋34邋35邐?ndA逡逑c==^c===C>邋t邋邋邐邐邋i邋<l_ll邋?■■?邋?-邐>邋I邋?丨丨丨丨1丨邋<邋III邋_邋III邋II.丨丨丨丨|丨?。剑场辏螅螅螅恚螅剑海海螅螅螅蓿掊义希澹睿迹樱洛义?m/C逡逑39邋?ndO邐41邐42邐43邐44邐4S邐46邋47邋48邐?..逡逑—二—^4—_1邋 ̄ ̄ ̄邐)逡逑圖1-3恩拉霉素生物合成基因簇逡逑Fig.邋1-3邋the邋enduracidin邋biosynthetic邋gene邋cluster逡逑4逡逑

過濾器圖,孢子,過濾器,片段


pMD19(Simple),將連接正確的質(zhì)粒分別用///mimAWwI和五⑶RIAYk/I酶切,回收目逡逑的片段;將酶切后回收得到的左右同源臂片段同時連入經(jīng)反oRI和扣Mill酶切后的逡逑pKCl邋139載體片段,質(zhì)粒的構(gòu)建如圖2-2所示。逡逑廠///"dm逡逑£a)Ri逡逑iacZ邋a邐//md。欤欤钸娯w邐廠邋EcoRl逡逑y邐-i-j;'■邋■■邋-:'"■邋■邋?逡逑U邋RK2邐aacpj/V'邐L邋■邋R逡逑Apramycin邋■邐^逡逑\邐pKC1139邐I邐:邐rEcM逡逑\zy邋22逡逑psG5邋曬逡逑—川 ̄\邋l邐”逡逑foriT逡逑r邋j逡逑\邐pKC1139-22邐1逡逑\邐aac(3)IVM逡逑0n邐Apramycir^F逡逑圖2-2重組質(zhì)粒pKCl邋139-22逡逑Fig.邋2-2邋Construction邋of邋the邋recombinant邋plasmid邋pKCl邋139-22逡逑2.2.7邐ET12567邋^邋Streptomyces邋fungicidicus逡逑2.2.7.1鏈霉菌孢子懸液制}備逡逑將57re/?/ow>re5/w?g/cWcws接種于MS固體培養(yǎng)基,28°C培養(yǎng)5-7d。待孢子成逡逑熟后,用2xYT液體培養(yǎng)基洗下孢子,用玻璃珠打散孢子,用過濾器除去雜質(zhì)和菌絲逡逑體
【學位授予單位】:天津科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:TQ927

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本文編號:2708097

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