葡萄(Vitis Vniera)是葡萄科(Vitaceae)葡萄屬(Vitis)落葉果樹。在我國廣泛種植,具有較高的營養(yǎng)價(jià)值,也深受消費(fèi)者喜愛。隨著消費(fèi)水平的提高,一些常規(guī)品種已不能滿足消費(fèi)者的需求,人們開始追求新奇、特殊的高品質(zhì)果實(shí)。果實(shí)形狀作為重要的外觀品質(zhì),也越來越受到消費(fèi)者和生產(chǎn)者的關(guān)注,同樣也賦予了果形分子研究以意義。SUN基因是番茄中控制果形的主效QTL位點(diǎn),該基因的突變品種呈橢圓形。SUN基因?qū)儆贗QD基因家族一員,IQD蛋白是一類鈣調(diào)素結(jié)合蛋白,在擬南芥、水稻、番茄等植物中均有報(bào)道。該家族成員眾多,在多種植物中均有表達(dá),推測其具有廣泛功能。本研究對葡萄IQD基因家族進(jìn)行了全面的鑒定和生物信息學(xué)分析,并挑選VvSUN(VvIQD7)基因,從葡萄品種'天山'中克隆得到可能與果形相關(guān)的該基因,并將該基因轉(zhuǎn)化番茄進(jìn)行功能初步驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:1.對葡萄IQD基因家族進(jìn)行全面的鑒定并進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以期為該家族基因的功能研究奠定基礎(chǔ)。本研究共鑒定出16個(gè)IQD基因,命名為VvIQDs,不均勻地分布在19條染色體中的10條上,編碼137-634個(gè)氨基酸,等電點(diǎn)在9.63-1...

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１?Ｆｖ／０Ｄ基因的染色體定位??Ｆｉｇ．?２－１?Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ＶｖＩＱＤ?ｇｅｎｅｓ??

２．２?Ｆｖ／以＾基因染色體定位??染色體定位結(jié)果（表２－１）表明，１６條ＦＶ／０Ｚ）基因共位于１０條染色體上。用??Ｍａｐｌｎｓｐｅｃｔ軟件繪制基因在染色體上的物理位置，如圖２－１。其中和作／＾＞４，??Ｆｖ／以）７和和Ｋｖ／０Ｄ／５的物理位置較近，位于同一條??染色體上。Ｆｖ....

圖２－２?ＶｖｌＱＤ蛋白的保守結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列??Ｆｉｇ．?２－２?Ａｍｉｎｏ?ａｃｉｄ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｃｏｎｓｅｒ?

２．４?ＶｖＩＱＤｓ蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析??利用ＣｌｕｓｔａｌＸ軟件對１６條ＶｖｌＱＤ蛋白序列進(jìn)行比對，根據(jù)ＩＱ６７結(jié)構(gòu)域特點(diǎn)，??查找到ＩＱ６７保守結(jié)構(gòu)域（圖２－２）。結(jié)果顯示，ＩＱ６７結(jié)構(gòu)域較保守。第一個(gè)和第：個(gè)，??第二個(gè)和第三個(gè)ＩＱ基序分別間隔１１、１５個(gè)氨基酸。第一個(gè)和第....

圖2-3腳IQD基因的系統(tǒng)進(jìn)化和基因結(jié)構(gòu)分析

使用鄰接算法（Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－Ｊｏｉｎｉｎｇ），根據(jù)ＶｖＩＱＤ全長氨基酸序列進(jìn)行比對分析，構(gòu)??建葡萄ＩＱＤｓ系統(tǒng)進(jìn)化樹（圖２－３）。根據(jù)擬南芥１ＱＤ蛋白家族分類，可將ＶｖＩＱＤ家族??蛋白分為四大類Ｉ－ＩＶ。其中ＩＩＩ類包含的基因較少，只含有２個(gè)基因，說明該分支內(nèi)??基因進(jìn)化....

圖３－１?Ｋｖ．ｗ／Ｖ基因擴(kuò)增結(jié)果??Ｍ：?ＤＮＡ２０００?ｍａｒｋｅｒ；丨：ＦｖＳＷＶ基因片段擴(kuò)增產(chǎn)物??

２結(jié)果與分析??２．１葡萄ＫｖＳＯＴＶ基因的克隆??以‘天山’葡萄花期為材料，擴(kuò)增出一條１０００?ｂｐ左右的片段（圖３－１）。測序并在??ＮＣＢＩ上比對分析表明，該片段包含完整的開放閱讀框，長度為１２７８?ｂｐ（圖３－２）。起??始密碼子為ＡＴＧ，終止密碼子為ＴＧＡ。??ｒｎａｍ....

本文編號：4013781