冬瓜（Benincasa hispida Cogn.）,別稱寒瓜、枕瓜,屬于葫蘆科冬瓜屬一年生攀緣植物,具有豐富的營養(yǎng)價值和藥用價值,是我國南菜北運,周年供應的特色蔬菜。冬瓜果皮顏色是重要的商品品質之一,鮮艷的果皮顏色能提高商品價值,滿足人們對蔬菜品種更新?lián)Q代的要求。而遺傳圖譜構建、QTL定位及候選基因預測等基礎研究,可以深入了解冬瓜生物學功能,為定向分子輔助育種提供重要的理論指導與技術方法。本研究利用果皮墨綠色父本（kx-2）和果皮黃白色母本（yo-16）為材料構建F₂作圖群體,對冬瓜群體進行全基因組重測序,基于測序結果開發(fā)SNP標記并構建冬瓜高密度遺傳圖譜;將圖譜與F₂子代表型數(shù)據(jù)相結合完成QTL定位;最后利用參考基因組注釋信息對定位區(qū)間內的基因進行注釋并預測控制冬瓜果皮顏色的候選基因。本研究的主要結果如下:1.根據(jù)父本、母本和F₁代果皮顏色以及葉綠素含量對比發(fā)現(xiàn),冬瓜果皮墨綠色對黃白色不完全顯性,F₁果皮顏色為親本的中間色-淡綠色;統(tǒng)計和分析F₂子代的表型數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)F

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【學位級別】：碩士

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廣西大學碩士學位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構建及果皮顏色QTL定位12第二章基于全基因組重測序的冬瓜高密度遺傳圖譜構建2.1試驗材料2.1.1親本及作圖群體由南寧科農(nóng)種苗有限責任公司提供的冬瓜高世代自交系kx-2和yo-16為親本（圖2-1），兩品種的多對果實性狀具有顯著差異。kx-....

廣西大學碩士學位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構建及果皮顏色QTL定位14圖2-2WGS文庫構建流程Fig.2-2FlowchartofWGSlibraryconstruction2.2.3重測序數(shù)據(jù)質量評估通過IlluminaHiSeq測序后得到原始數(shù)據(jù)（即Rawdata或Rawrea....

廣西大學碩士學位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構建及果皮顏色QTL定位18圖2-3SNP標記基因分型分布圖Fig.2-3mapofSNPmarkersgenotyping2.3.3高密度遺傳圖譜的構建通過篩選獲得了426654個SNP標記，對所有標記進行重組斷點檢測、孟德爾分離比例的檢驗....

廣西大學碩士學位論文冬瓜高密度遺傳圖譜構建及果皮顏色QTL定位19的占比在85.29%-99.37%之間，第7條連鎖群占比最大為99.37%，第9和第10條連鎖群的占比其次為98.7%，占比最小的是第8條連鎖群為85.29%。由此可發(fā)現(xiàn)，所有連鎖群中除了個別的連鎖群標記較稀疏外，....

本文編號：4008212