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草莓EST-SSR引物的開發(fā)及四季草莓成花機(jī)理的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2021-11-23 08:06
  草莓(Fragaria ananassa Duchesne)香氣濃郁,酸甜宜人,倍受廣大消費(fèi)者的喜愛(ài),是重要的經(jīng)濟(jì)果樹。由于草莓品種繁多且表型相似,難以靠肉眼區(qū)分,加大了培育優(yōu)質(zhì)草莓的難度,需借助分子輔助手段對(duì)草莓品種進(jìn)行鑒定。EST-SSR分子標(biāo)記因其高重復(fù)性、易操作的特性深受國(guó)內(nèi)外科研工作者的青睞,草莓EST-SSR引物也被陸續(xù)開發(fā)出來(lái),但相較于其他果樹而言,草莓的有效EST-SSR標(biāo)記數(shù)量仍然偏少。因此本研究利用公共數(shù)據(jù)庫(kù)公布的草莓EST序列搜索并篩選合適的SSR位點(diǎn),設(shè)計(jì)并合成草莓EST-SSR引物,在分子遺傳方面對(duì)25個(gè)草莓品種進(jìn)行鑒定及區(qū)分。此外,草莓有一季草莓與四季草莓之分,研究草莓周年成花機(jī)制以促進(jìn)草莓花芽分化具有較大的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。故本研究以四季草莓‘蒙特瑞’和一季草莓‘章姬’為材料,比較不同生長(zhǎng)發(fā)育階段中兩種草莓植株的碳氮比差異以及Fa LFY、Fa SOC1、Fa AP1、Fa FT、miR156和miR172基因的表達(dá)模式差異,以期初步探討四季草莓的成花機(jī)制,為其他農(nóng)作物培育四季品種提供理論依據(jù)。具體研究結(jié)果如下:1.從NCBI上搜索并下載59795條草莓EST... 

【文章來(lái)源】:杭州師范大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

草莓EST-SSR引物的開發(fā)及四季草莓成花機(jī)理的初步研究


二核苷酸重復(fù)類型中不同基元所占百分比Figure2-1Percentageofdifferentmotifsindinucleotide

指紋圖譜,核苷酸,百分比,類型


杭州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文草莓EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)及25個(gè)草莓品種指紋圖譜的構(gòu)建20圖2-1二核苷酸重復(fù)類型中不同基元所占百分比Figure2-1PercentageofdifferentmotifsindinucleotideSSR圖2-2三核苷酸重復(fù)類型中不同基元所占百分比Figure2-2PercentageofdifferentmotifsinTrinucleotideSSR從重復(fù)長(zhǎng)度角度分析,二核苷酸重復(fù)變化范圍最大,從10~130bp;其次為三核苷酸,從15~60bp;六核苷酸重復(fù)的平均長(zhǎng)度最大,達(dá)到31bp,而二核苷酸重復(fù)長(zhǎng)度僅15.56bp,是所有重復(fù)類型中最小的(表2-5)。

草莓,多態(tài),品種,指紋圖譜


杭州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文草莓EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)及25個(gè)草莓品種指紋圖譜的構(gòu)建231003CAACAGCATCCCAGAACTCACCACCACGAAAGCCAAATAC(CT)55822100.01822GCCGCATCCCTCTTTTCTATTGATTGGGTGAGACGGTGAC(TC)55822100.09140ACTCGCTTTCTGAATCTCCCCAGCACGATCCTCTGCACTA(CCT)75611100.0合計(jì)Summary584781.02.3.4草莓指紋圖譜的建立最終按照電泳圖結(jié)果,挑選出了7對(duì)擴(kuò)增效果好且多態(tài)性信息多樣的核心引物,引物編碼分別為:0573(A)、4494(B)、1245(C)、2863(D)、2828(E)、8149(F)和3378(G),再根據(jù)這7對(duì)核心引物的擴(kuò)增情況,分析它們?cè)?5個(gè)草莓品種中多態(tài)性擴(kuò)增的帶型,結(jié)果發(fā)現(xiàn)標(biāo)記A-G分別有4、3、7、5、5、6、5種帶型(圖2-3)。7對(duì)引物的擴(kuò)增結(jié)果如圖2-4、2-5、2-6、2-7、2-8、2-9、2-10所示。圖2-37個(gè)核心引物在25個(gè)草莓品種中擴(kuò)增的多態(tài)性帶型注:1-7:帶型數(shù)。Figure2-3Polymorphicbandtypesobtainedfromisolatesusing7coremarkersin25cultivarsNote:1-7:Numberofbelttype.圖2-4引物ASSR擴(kuò)增結(jié)果Figure2-4AmplificationresultsofAprimer

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào):3513467

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