番茄漸滲系IL9-1耐旱基因的定位和候選
發(fā)布時(shí)間:2021-10-17 20:36
干旱是三大自然災(zāi)害之一,在全球頻繁發(fā)生,嚴(yán)重影響農(nóng)作物的產(chǎn)量和品質(zhì)。番茄(Solanum lycopersicum)是重要的果菜,種植面積廣,生產(chǎn)總量高。番茄同時(shí)還是科學(xué)研究的重要模式植物,但栽培番茄一般對(duì)干旱等逆境脅迫較敏感。傳統(tǒng)育種能夠提高番茄的抗旱性,但篩選復(fù)雜、成本高、效率低下。由于對(duì)番茄的干旱應(yīng)答和耐旱機(jī)制的研究不夠深入,極大地限制了番茄耐早遺傳改良的進(jìn)程。因此,發(fā)掘耐旱基因成為番茄乃至所有農(nóng)作物研究的熱點(diǎn)和重要發(fā)展戰(zhàn)略。本研究以課題組前期干旱篩選得到的番茄抗旱漸滲系IL9-1為基礎(chǔ),開展耐早基因的定位和候選研究。取得的主要研究結(jié)果如下:1 針對(duì)野生潘那利番茄和栽培番茄位于IL9-1區(qū)段的可能插入/缺失(InDe1)序列設(shè)計(jì)引物,通過PCR驗(yàn)證獲得19對(duì)多態(tài)性InDe1標(biāo)記。2 通過IL9-1與輪回親本M82雜交和進(jìn)一步自交,結(jié)合分子標(biāo)記篩選,構(gòu)建了該漸滲系的亞系群體,共含50個(gè)株系。3 通過對(duì)亞系基因型分析和耐旱性鑒定篩選,發(fā)現(xiàn)IL9-1的滲入片段可能含有一個(gè)或多個(gè)耐旱相關(guān)的QTL位點(diǎn)。初步定位到兩個(gè)耐旱區(qū)段,大小分別為708 kb和131 kb,區(qū)段內(nèi)含有抗壞血酸過氧化氫...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1部分多態(tài)性標(biāo)記在不同材料中的電泳條帶??-
?lnDeiy4?lnDel306??圖1.1部分多態(tài)性標(biāo)記在不同材料中的電泳條帶??(M:?Marker,?M82:輪回親本?M82、P:潘那利,F1:?M?和?P?的雜交?Fp?IL9-1)??Figure?1.1?Electrophoresis?bands?of?some?polymorphic?markers?among?different??materials??(M:?Marker,?M82:?recurrent?parent?M82;?P:?S.?pennellii?LA0716,?Fi:?Fi?derived?from?M82??andP,IL9-l)??2.2重組單株的篩選和基因型分析??2.2.1分離群體重組單株的篩選??本次亞系群體的構(gòu)建分為兩次,選取了上端標(biāo)記InDely4和下端標(biāo)記??InDelx2c對(duì)2050棵F2進(jìn)行分析,篩選重組單株(圖1.2),得到60個(gè)系,經(jīng)過??繁種最終得到50個(gè)重組單株。重組單株F3代經(jīng)過篩選得到純合亞系(圖1.5),??進(jìn)一步繁種最終得到50個(gè)亞系,各系編號(hào)分別為:12、387、284、121、1075、??6、?480、?X2、?221、?360、?468、?944、?52、?558、?1
利用開發(fā)的19對(duì)分子標(biāo)記以及CAPS標(biāo)記GP39,?RFLP標(biāo)記TG9和??CtoB-l-K3?(來源于番前在線數(shù)據(jù)庫(https://solgenomics.net/)),對(duì)上述50個(gè)亞??系以及漸滲系IL9-1-2、IL9-2-5的基因型進(jìn)行了分析(圖1.3),確定了各個(gè)株系??的交換位點(diǎn),共找到13個(gè)交換位點(diǎn)。對(duì)這些交換位點(diǎn)進(jìn)行簡單計(jì)算,發(fā)現(xiàn)最小??的片段只有0.16?Mb左右,最大片段幾乎覆蓋整個(gè)IL9-1滲入?yún)^(qū)段,其他亞系滲??入的片段大小不等,具有較好的多態(tài)性(圖1.4)。???2:工之?CLLl-T-c〇C〇t-C〇TtCNJ?奪?T-寸寸寸寸??lnDel140??lnDel306?I??lnDelx2c?I??圖1.3部分亞系基因型分析??(M:?Marker,?M82:輪回親本M82,?P:潘那利,Fp?M和P的雜交??Fig.?1.3?Genotyping?analysis?of?some?sub-ILs??(M:?Marker,?M82:?the?recurrent?parent?M82;?P:?S.?pennellii?LA0716,?Fi:?F
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]三七病程相關(guān)蛋白PR10-1基因克隆及功能初步分析[J]. 唐美瓊,閔丹丹,李剛,蔣妮,葉云峰. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2015(02)
[2]作物滲透調(diào)節(jié)及抗?jié)B透脅迫基因工程研究進(jìn)展[J]. 楊德光,劉永璽,張倩,姜籽竹,宋北光. 作物雜志. 2015(01)
[3]蠟梅胚胎晚期豐富蛋白基因CpLEA的克隆及表達(dá)分析[J]. 馬婧,孫文婷,王晶,眭順照,李名揚(yáng). 園藝學(xué)報(bào). 2014(08)
[4]番茄耐旱和耐鹽遺傳改良的研究進(jìn)展及展望[J]. 孫玉燕,劉磊,鄭崢,張春芝,周龍溪,宗園園,李濤,李君明. 園藝學(xué)報(bào). 2012(10)
[5]利用漸滲系群體初步定位番茄苗期耐旱QTL[J]. 劉磊,宋燕,李君明. 園藝學(xué)報(bào). 2011(10)
[6]中國作物新基因發(fā)掘:現(xiàn)狀、挑戰(zhàn)與展望[J]. 邱麗娟,郭勇,黎裕,王曉波,周國安,劉章雄,周時(shí)榮,李新海,馬有志,王建康,萬建民. 作物學(xué)報(bào). 2011(01)
[7]利用Solanum pennellii LA716漸滲系群體對(duì)番茄苗期耐鹽QTLs進(jìn)行定位及QTL效應(yīng)的初步分析[J]. 余慶輝,劉磊,王柏柯,楊生保,楊濤,李君明,侯喜林. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(04)
[8]生物自由基與植物膜傷害[J]. 王寶山. 植物生理學(xué)通訊. 1988(02)
博士論文
[1]基于潘那利番茄漸滲系發(fā)掘干旱脅迫響應(yīng)基因及功能分析[D]. 弓鵬娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]番茄MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及其表達(dá)分析[D]. 劉淑君.浙江師范大學(xué) 2012
本文編號(hào):3442380
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1部分多態(tài)性標(biāo)記在不同材料中的電泳條帶??-
?lnDeiy4?lnDel306??圖1.1部分多態(tài)性標(biāo)記在不同材料中的電泳條帶??(M:?Marker,?M82:輪回親本?M82、P:潘那利,F1:?M?和?P?的雜交?Fp?IL9-1)??Figure?1.1?Electrophoresis?bands?of?some?polymorphic?markers?among?different??materials??(M:?Marker,?M82:?recurrent?parent?M82;?P:?S.?pennellii?LA0716,?Fi:?Fi?derived?from?M82??andP,IL9-l)??2.2重組單株的篩選和基因型分析??2.2.1分離群體重組單株的篩選??本次亞系群體的構(gòu)建分為兩次,選取了上端標(biāo)記InDely4和下端標(biāo)記??InDelx2c對(duì)2050棵F2進(jìn)行分析,篩選重組單株(圖1.2),得到60個(gè)系,經(jīng)過??繁種最終得到50個(gè)重組單株。重組單株F3代經(jīng)過篩選得到純合亞系(圖1.5),??進(jìn)一步繁種最終得到50個(gè)亞系,各系編號(hào)分別為:12、387、284、121、1075、??6、?480、?X2、?221、?360、?468、?944、?52、?558、?1
利用開發(fā)的19對(duì)分子標(biāo)記以及CAPS標(biāo)記GP39,?RFLP標(biāo)記TG9和??CtoB-l-K3?(來源于番前在線數(shù)據(jù)庫(https://solgenomics.net/)),對(duì)上述50個(gè)亞??系以及漸滲系IL9-1-2、IL9-2-5的基因型進(jìn)行了分析(圖1.3),確定了各個(gè)株系??的交換位點(diǎn),共找到13個(gè)交換位點(diǎn)。對(duì)這些交換位點(diǎn)進(jìn)行簡單計(jì)算,發(fā)現(xiàn)最小??的片段只有0.16?Mb左右,最大片段幾乎覆蓋整個(gè)IL9-1滲入?yún)^(qū)段,其他亞系滲??入的片段大小不等,具有較好的多態(tài)性(圖1.4)。???2:工之?CLLl-T-c〇C〇t-C〇TtCNJ?奪?T-寸寸寸寸??lnDel140??lnDel306?I??lnDelx2c?I??圖1.3部分亞系基因型分析??(M:?Marker,?M82:輪回親本M82,?P:潘那利,Fp?M和P的雜交??Fig.?1.3?Genotyping?analysis?of?some?sub-ILs??(M:?Marker,?M82:?the?recurrent?parent?M82;?P:?S.?pennellii?LA0716,?Fi:?F
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]作物滲透調(diào)節(jié)及抗?jié)B透脅迫基因工程研究進(jìn)展[J]. 楊德光,劉永璽,張倩,姜籽竹,宋北光. 作物雜志. 2015(01)
[3]蠟梅胚胎晚期豐富蛋白基因CpLEA的克隆及表達(dá)分析[J]. 馬婧,孫文婷,王晶,眭順照,李名揚(yáng). 園藝學(xué)報(bào). 2014(08)
[4]番茄耐旱和耐鹽遺傳改良的研究進(jìn)展及展望[J]. 孫玉燕,劉磊,鄭崢,張春芝,周龍溪,宗園園,李濤,李君明. 園藝學(xué)報(bào). 2012(10)
[5]利用漸滲系群體初步定位番茄苗期耐旱QTL[J]. 劉磊,宋燕,李君明. 園藝學(xué)報(bào). 2011(10)
[6]中國作物新基因發(fā)掘:現(xiàn)狀、挑戰(zhàn)與展望[J]. 邱麗娟,郭勇,黎裕,王曉波,周國安,劉章雄,周時(shí)榮,李新海,馬有志,王建康,萬建民. 作物學(xué)報(bào). 2011(01)
[7]利用Solanum pennellii LA716漸滲系群體對(duì)番茄苗期耐鹽QTLs進(jìn)行定位及QTL效應(yīng)的初步分析[J]. 余慶輝,劉磊,王柏柯,楊生保,楊濤,李君明,侯喜林. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(04)
[8]生物自由基與植物膜傷害[J]. 王寶山. 植物生理學(xué)通訊. 1988(02)
博士論文
[1]基于潘那利番茄漸滲系發(fā)掘干旱脅迫響應(yīng)基因及功能分析[D]. 弓鵬娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]番茄MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及其表達(dá)分析[D]. 劉淑君.浙江師范大學(xué) 2012
本文編號(hào):3442380
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