發(fā)布時間：2021-07-03 01:17

　　鈣依賴蛋白激酶（calcium-dependent protein kinase,CDPK）為Ca²⁺傳感蛋白,在植物生長發(fā)育和逆境響應中起著重要作用。在克隆青花菜BoCDPK1基因的基礎上,開展序列分析、系統(tǒng)發(fā)育分析和表達分析,為后續(xù)的基因功能鑒定和抗逆育種奠定基礎。該研究以青花菜為材料,利用PCR法克隆1個CDPK基因,利用生物信息學對序列進行分析,并采用qRT-PCR研究該基因在霜霉菌和核盤菌侵染下的表達模式。測序結果表明,BoCDPK1的基因組DNA全長為2 414 bp,具6個內含子,編碼區(qū)全長為1 647 bp,編碼548個氨基酸;BoCDPK1有1個S_TKc和4個EF手性結構域。多序列比對結果表明,BoCDPK1與蕓薹屬植物同源序列的相似性最高,僅個別氨基酸殘基存在差異,它們在系統(tǒng)發(fā)育樹上聚于一組。qRT-PCR結果表明,BoCDPK1的表達受霜霉菌和核盤菌的誘導,表達量均呈現(xiàn)先上升后下降的規(guī)律。在霜霉菌的誘導下,BoCDPK1的表達量在72 h達最大值,為對照的3.4倍;而在核盤菌侵染下,BoCDPK1的表達量在36 h達最大... 

【文章來源】：浙江農(nóng)業(yè)學報. 2020,32(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

BoCDPK1基因的克隆

BoCDPK1基因的結構

系統(tǒng)發(fā)育分析結果表明,青花菜BoCDPK1與3種蕓薹屬植物的CDPK處于同一分支,支持率達100%,它們再與山崳菜(Eutrema salsugineum, XP_024016164)聚于一組,支持率較小,僅為53%;3種棉屬植物聚于同一分支,支持率達100%,它們與大戟科(Euphorbiaceae)的麻風樹(Jatropha curcas, XP_020535061)和蓖麻(Ricinus communis, NP_001310655)聚于一組;十字花科的亞麻薺(Camelina sativa, XP_010467489)和薺(Capsella rubella, XP_006297360)聚于一組,支持率為89%;而山柑科(Capparaceae)的醉蝶花(Tarenaya hassleriana, XP_010548179)與豆科(Leguminosae)的大豆(Glycine max, XP_003519696)單獨成組(圖5)。圖4 BoCDPK1部分序列及其同源蛋白的比較

【參考文獻】：
期刊論文
[1]鹽藻CDPK基因的克隆與生物信息學分析[J]. 張曉琳,柴曉杰,張婷,余祝君,薛飛.  核農(nóng)學報. 2013(04)
[2]普通煙草CDPK基因家族的克隆及表達分析[J]. 太帥帥,劉貫山,孫玉合,陳珈.  中國農(nóng)業(yè)科學. 2009(10)



本文編號：3261565