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馬纓杜鵑基因表達內(nèi)參的篩選

發(fā)布時間:2020-10-16 06:41
   馬纓杜鵑(Rhododendrondelavayi Franch.)是杜胃鵑屬(Rhododendron)常綠杜鵑亞屬(Subgen.Hymenanthes)的多年生高山木本花卉,具有較高的觀賞和藥用價值,同時作為重要的原始育種親本,具有重要科學(xué)研究與開發(fā)利用價值。迄今,馬纓杜鵑的全基因組序列已經(jīng)發(fā)布,勢必助推杜鵑屬植物在分子生物學(xué)研究領(lǐng)域的快速發(fā)展。然而,有關(guān)基因表達內(nèi)參基因的篩選研究較少,有待進一步充實完善。本研究以馬纓杜鵑為研究對象,選取了 11個在木本植物中的常用候選內(nèi)參基因(GAPDH、Actin、、EF1a、、Tubulina-5、、Ubiquitin、、UEP、、UEC11、UEC2、、TIP41-LIKE FAMILYPROTEIN、Tubulin beta、TATAbindingprotein),采用實時熒光定 PCR技術(shù)分析了這11個候選內(nèi)參基因在馬纓杜鵑成年及幼年植株的不同發(fā)育時期及受干旱脅迫條件下葉片樣品中的表達穩(wěn)定性。綜合內(nèi)參基因穩(wěn)定性評價軟件qBASE和NormFinde的分析結(jié)果,為不同試驗樣品集篩選最佳內(nèi)參基因或組合,研究結(jié)果如下:1.本研究選取設(shè)計的11個常用候選內(nèi)參基因的引物,經(jīng)實時熒光定量PCR檢測,均能在馬纓杜鵑基因組中擴增出相應(yīng)的目的片段,且擴增特異性和擴增效率(94%-106%)均滿足本研究中內(nèi)參基因篩選的要求。2.本研究通過qBASE與NormFinder兩種內(nèi)參基因穩(wěn)定性評價軟件綜合分析11個常用候選內(nèi)參基因在馬纓杜鵑成年植株(成熟葉、花芽、雌蕊、雄蕊及花瓣)與幼年植株樣品集中的表達穩(wěn)定性。研究發(fā)現(xiàn)在成熟葉樣品集中,最適內(nèi)參基因組合為GAPDH+Actin;在花芽樣品集中,最適內(nèi)參基因組合為Tubulin-β+UEC1;在不同花組織器官樣品集中,最適內(nèi)參基因組合為EF1a+Tubulin-β;在馬纓杜鵑成年植株不同組織部位樣品集中,最適內(nèi)參基因組合為UEC1+ GAPDH+ TIP41+UEP 在馬纓杜鵑幼年植株不同組織部位樣品集中,最適內(nèi)參基因組合為GAPDH+ UEC1;在成年與幼年植株所有樣品集中,最適內(nèi)參基因組合為GAPDH+Actin。3.選擇表達穩(wěn)定性較好的內(nèi)參基因GAPDH檢測干旱響應(yīng)基因NCED1在不同干旱脅迫處理時間下的表達情況,發(fā)現(xiàn)NCED1在第9-13天中的表達符合預(yù)期趨勢。在此基礎(chǔ)上,篩選出表達穩(wěn)定性較好的內(nèi)參基因組合為Actin+UEC1表達穩(wěn)定性較差的內(nèi)參基因組合TIP41+UEC2 通過比較兩個內(nèi)參組合在干旱響應(yīng)基因NCED1的表達模式,研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)Actin、UEC1是無論是作為組合還是單個內(nèi)參,NCED1的表達豐度都較高,且符合預(yù)期表達趨勢。以上研究結(jié)果促進馬纓杜鵑關(guān)于內(nèi)參基因研究方面的研究進展,也為其他杜昌鵑屬植物基因表達內(nèi)參基因篩選方面研究提供一定的技術(shù)參考。
【學(xué)位單位】:云南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S685.21
【部分圖文】:

馬纓杜鵑,幼株


試驗所用馬纓杜鵑成年植株材料采集于金殿風(fēng)景名勝區(qū)生長狀態(tài)良好、花芽??發(fā)育正常的,樹齡達50年的馬纓杜鵑植株(圖1);馬纓杜鵑幼株材料取材于云南??省農(nóng)業(yè)科學(xué)研宄院晉寧大春禾試驗基地栽培的3年生盆栽馬纓杜鵑植株(圖2)。??麵??圖1.馬纓杜鵑成年植株??Figure?1.?Adult?plants?of?R.delavayi??嘗??圖2.馬纓杜鵑盆栽幼株??Figure?2.?Young?potted?plants?of?R.delavayi??10??

馬纓杜鵑,植株


2.1.1植物材料??試驗所用馬纓杜鵑成年植株材料采集于金殿風(fēng)景名勝區(qū)生長狀態(tài)良好、花芽??發(fā)育正常的,樹齡達50年的馬纓杜鵑植株(圖1);馬纓杜鵑幼株材料取材于云南??省農(nóng)業(yè)科學(xué)研宄院晉寧大春禾試驗基地栽培的3年生盆栽馬纓杜鵑植株(圖2)。??麵??圖1.馬纓杜鵑成年植株??Figure?1.?Adult?plants?of?R.delavayi??嘗??圖2.馬纓杜鵑盆栽幼株??Figure?2.?Young?potted?plants?of?R.delavayi??10??

瓊脂糖凝膠電泳,馬纓杜鵑


第三章結(jié)果分析??3.1馬纓杜鵑總RNA的提取??從RNA條帶的完整性來看,1%瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示(圖3):所提取馬??纓杜鵑總RNA的18S與28S兩條帶明亮清晰,無彌散、拖尾現(xiàn)象,且28S條帶的??亮度是18S條帶亮度的兩倍,說明所提。遥危镣暾暂^好,無降解;從RNA的??純度與濃度來看,經(jīng)超微量紫外分光光度計ND2000檢測結(jié)果顯示,馬纓杜鵑總??RNA的濃度均在400?900ng/nL之間,OD26?0/280的比值在1.8?2.0之間,說明??RNA沒有蛋白質(zhì)、DNA等污染。綜合RNA的完整性與純、濃度結(jié)果來看,所提??。遥危量捎糜诤罄m(xù)的檢測。??M?1?2??1000?bp?—^??750?bp???500?bp????圖3.?KNA瓊脂糖凝膠電泳圖??(注:M:OD20(>0?DINA?Marker;丨 ̄2?為部分馬纓杜鵑?RNA)??Figure?3.?Agarose?gel?electrophoresis?for?RNA??Note:?M:?OD2000?DNA?Marker;?1??2?is?RNA?of?V?.辦/av,“j,/??3.2引物擴增效率及擴增特異性檢測??3.2.1候選內(nèi)參基因與干旱響應(yīng)基因引物的擴增效率檢測??經(jīng)實時熒光定量PCR檢測后,如表3所示:各候選內(nèi)參基因的擴增效率均在??94?%? ̄?106?%之間
【參考文獻】

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本文編號:2842914

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