發(fā)布時間：2020-08-13 15:22

【摘要】：西伯利亞杏是北方半干旱地區(qū)重要的生態(tài)經(jīng)濟型樹種,產(chǎn)量低而不穩(wěn)的問題為制約產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主要瓶頸,良種選育已成為當(dāng)務(wù)之急。本文以32個西伯利亞杏優(yōu)選無性系為研究對象,開展了主要經(jīng)濟性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析,研究了關(guān)聯(lián)位點等位基因的表型效應(yīng),在此基礎(chǔ)上進行了關(guān)聯(lián)位點基因的表達(dá)分析,主要研究結(jié)果如下:(1)從合成的600對SSR引物中篩選出155對擴增條帶清晰的引物用以進行關(guān)聯(lián)分析,每個位點平均等位基因數(shù)(N_A)為5.858,平均有效等位基因數(shù)(N_E)為3.412,多態(tài)性信息含量(PIC)平均值為0.622,多態(tài)性較高。32個供試無性系間遺傳相似系數(shù)變幅在0.620~0.907之間,平均為0.731,遺傳差異較小,親緣關(guān)系較近。(2)利用Structure分析軟件將32個西伯利亞杏無性系劃分為3個亞群。通過155對SSR引物與13個經(jīng)濟性狀間的關(guān)聯(lián)分析,得到了統(tǒng)計學(xué)意義上的與經(jīng)濟性狀顯著關(guān)聯(lián)的49個SSR位點。其中,同一性狀與多個位點相關(guān)聯(lián)的性狀有12個,表明這些性狀由多個基因位點共同調(diào)控;同一位點與多個性狀相關(guān)聯(lián)的情況有22組,表明這些性狀可能存在連鎖遺傳。(3)分析了49個SSR關(guān)聯(lián)位點等位基因的表型效應(yīng),初步明確了西伯利亞杏13個經(jīng)濟性狀對應(yīng)的增效與減效表型效應(yīng)最大的等位基因,確定了攜帶果實產(chǎn)量關(guān)聯(lián)位點優(yōu)異等位基因的典型載體材料為1號、28號和39號無性系,果性狀的典型載體材料為81號無性系,核性狀的典型載體材料為43號無性系,仁性狀的典型載體材料為21號無性系。(4)通過序列比對、PCR擴增檢測,共篩選出19個關(guān)聯(lián)位點基因用以進行實時熒光定量PCR;從4個候選內(nèi)參基因中篩選出18SrRNA作為西伯利亞杏實時熒光定量PCR的最佳內(nèi)參基因;將實時熒光定量PCR的反應(yīng)程序由原來的兩步反應(yīng)法改進為三步反應(yīng)法。(5)關(guān)聯(lián)位點基因表達(dá)分析表明,在果實發(fā)育過程中19個關(guān)聯(lián)位點基因表達(dá)情況可劃分為3種類型:總體呈上升趨勢,總體呈下降趨勢,無規(guī)律類型;在不同無性系果、核、仁中檢測到的關(guān)聯(lián)位點基因表達(dá)量變化規(guī)律不同,體現(xiàn)在不同無性系中與果、核、仁大小呈明顯正相關(guān)、負(fù)相關(guān)及相關(guān)性不明顯的位點不同。對于3個無性系,均有在果、核、仁中同時被檢測到的相關(guān)性明顯的關(guān)聯(lián)位點基因,其中X72在3個無性系的果、核、仁中均被檢測到。本文初步篩選了19個與果、核、仁性狀相關(guān)聯(lián)的位點,為該領(lǐng)域的深入研究奠定了一定基礎(chǔ),也為西伯利亞杏分子標(biāo)記輔助選擇育種提供了借鑒和參考。
【學(xué)位授予單位】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：S662.2
【圖文】：

沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文表 2-3 155 個 SSR 位點的遺傳多樣性信息（續(xù)表）Table 2-3 Genetic diversity information of 155 SSR loci（Continued）平均等位基因數(shù)目NA有效等位基因數(shù)目NE多態(tài)性信息含量PIC引物Primer平均等位基因數(shù)目NA有效等位基因數(shù)目NE5 3.298 0.64 X40 5 1.546 7 3.156 0.637 L47 5 1.391 6 3.156 0.636 X61 2 1.133 6 3.156 0.636平均 5.858 3.412 亞杏經(jīng)濟性狀與 SSR 標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析西伯利亞杏無性系群體結(jié)構(gòu)分析ructure 2.3 軟件對 32 個無性系進行群體結(jié)構(gòu)劃分，首先建立 K圖 2-1。當(dāng) K=3 時， K 達(dá)到第一個拐點，該拐點附近所對應(yīng)的群數(shù)的個數(shù)范圍，所以將西伯利亞杏無性系亞群體數(shù)量確定為

第二章 西伯利亞杏主要經(jīng)濟性狀與 SSR 標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析表 2-4 32 個西伯利亞杏無性系 Q 值矩陣（K=3）Table 2-4 The Q matrice of 32 Armeniaca sibirica clones（K=3）無性系Clone亞群 1Q1亞群 2Q2亞群 3Q3無性系Clone亞群 1Q1亞群 2Q2亞群 3Q31 0.019 0.003 0.978 31 0.001 0 0.9992 0.991 0.008 0.001 32 0.001 0 0.9986 0.998 0.002 0.001 33 0.001 0.001 0.9988 0.996 0.002 0.002 35 0.002 0.001 0.99810 0.999 0.001 0.001 39 0.009 0.005 0.98611 0.016 0.001 0.983 41 0.001 0.001 0.99813 0.993 0.006 0.001 43 0.001 0.001 0.99718 0.001 0 0.999 46 0.001 0.003 0.99619 0.001 0.001 0.999 48 0.333 0.665 0.00220 0.027 0.004 0.969 53 0.001 0.004 0.99521 0.001 0.001 0.997 55 0.95 0.049 0.00122 0.001 0 0.999 62 0.001 0.074 0.92523 0.993 0.006 0.001 72 0.867 0.132 0.00125 0.019 0.002 0.979 81 0.95 0.049 0.00127 0.004 0.002 0.994 87 0.037 0.963 0.00128 0.001 0 0.999 89 0.005 0.994 0

℃變性 10 s，56 ℃退火 20s，72 ℃延伸 30 s，共 4表 4-1 4 對內(nèi)參引物基本信息Table 4-1 Information of 4 pairs of reference primers正向引物序列Sequence of forward primers(5’—3’)反向引Sequence of reverGTTATTCTTCATCGTCGTCTTCG CTTCACCATTCCAAGTTCTCTTCCAACCATCAC CAGTAATCTCGGAAAAGTGCAGAGAGACACG TACAGTGTCTGAAACGGCTACCACATCCA CACCAGACTNA 為內(nèi)參，每個樣品第一個時期為對照組，檢測不同時期的表達(dá)情況。根據(jù)實時熒光定量 PCR 擴目標(biāo)基因與內(nèi)參基因的 Ct 值，采用 2- CT方法進行en，2001）。型性狀變化過程

【參考文獻】

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本文編號：2792179