大別山特有植物都支杜鵑(Rhododendron shanii)的群體遺傳學(xué)研究
發(fā)布時間:2020-05-01 22:47
【摘要】:都支杜鵑作為杜鵑屬的一種,主要分布在我國的安徽與湖北的交界處,其生長環(huán)境相對特殊,這也導(dǎo)致了目前我國自然生長的都支杜鵑的居群面積較小,不利于都支杜鵑的發(fā)展,對此應(yīng)當(dāng)加強對都支杜鵑的研究和培育,這樣才能有效的開發(fā)并保護都支杜鵑。目前對頻臨滅絕的物種的研究方面很多,最主要的就是對其遺傳多樣性的研究和分析,這不僅能夠了解瀕危物種的遺傳情況,同時還能夠提出科學(xué)的保護建議。本研究選用了 illuminaHiseq測序平臺的雙端測序模式進行都支杜鵑cDNA均一化處理的高通量測序,通過軟件進行大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組簡單重復(fù)序列的標(biāo)記的發(fā)掘,同時對其組成、分布及特征進行分析。通過研究,我們一共篩選出了 24個微衛(wèi)星位點,包含291個等位基因,各個位點的等位基因數(shù)(Na)的取值為3~21,所得到的多態(tài)性信息含量PIC計算結(jié)果為(mean ± SD)0.677 ± 0.212,其期望雜合度(HE)的最終計算結(jié)果為0.705 ±0.206,而觀測雜合度(Ho)的最終計算結(jié)果為0.704± 0.273,以上數(shù)據(jù)可以說明所篩選的位點具有較高的多態(tài)性,作為研究的分子遺傳標(biāo)記是可靠的。而24個位點中有9個明顯偏離哈溫平衡,其他未發(fā)現(xiàn)偏離現(xiàn)象。本研究使用以上篩選的24個位點對采集自5個地理居群的都支杜鵑進行群體遺傳學(xué)分析。主要從三個方面來分析都支杜鵑的遺傳特性,即其遺傳的多樣性、結(jié)構(gòu)性以及群體動態(tài),最終得出如下結(jié)論:1)都支杜鵑大別山區(qū)的5個自然居群的研究結(jié)果為:期望雜合度取值范圍0.589~0.700、觀測雜合度取值范圍0.649~0.759,由此可以得出都支杜鵑居群的遺傳多樣性較高。2)對于都支杜鵑的5個群體我們分別做了遺傳距離分析、聚類分析,結(jié)果顯示:居群之間具有較大的遺傳差異。3)通過Msvar居群動態(tài)分析發(fā)現(xiàn):各居群保持了一個相對比較穩(wěn)定狀態(tài),未經(jīng)歷居群的波動。
【學(xué)位授予單位】:安徽大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S685.21
本文編號:2647148
【學(xué)位授予單位】:安徽大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S685.21
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1 裴亞莉;大別山特有植物都支杜鵑(Rhododendron shanii)的群體遺傳學(xué)研究[D];安徽大學(xué);2018年
,本文編號:2647148
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