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羅氏沼蝦SNP標(biāo)記篩選及不同群體的遺傳多樣性

發(fā)布時(shí)間:2025-04-11 03:51
   羅氏沼蝦因其自身的生長優(yōu)勢,已成為我國重要的養(yǎng)殖蝦類,為保證其養(yǎng)殖的持續(xù)健康發(fā)展,對其進(jìn)行遺傳多樣性分析。利用羅氏沼蝦性腺組織轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,參考NCBI數(shù)據(jù)庫,選取60個(gè)SNP位點(diǎn),以馬來西亞野生群體(MW)為樣本,采用直接測序技術(shù)進(jìn)行位點(diǎn)多態(tài)性檢測,得到25個(gè)(41.7%)具有二態(tài)性等位基因位點(diǎn)。并對羅氏沼蝦上海(SH)、浙江(ZJ)、馬來西亞養(yǎng)殖群體(MF)、生長快速品系選育群體(BG)及MW群體5個(gè)群體的150尾個(gè)體進(jìn)行遺傳多樣性分析,其觀測雜合度Ho和期望雜合度He的分布范圍分別為0.18~0.30和0.28~0.37,平均多態(tài)性信息含量依次為0.29、0.24、0.21、0.26和0.33,表現(xiàn)為中低等多態(tài)水平;群體間的遺傳相似性系數(shù)和遺傳距離變化范圍分別為0.659~0.968和0.032~0.417,MF群體和BG群體遺傳相似系數(shù)最小、遺傳距離最大,SH群體和ZJ群體遺傳相似系數(shù)最大、遺傳距離最小;遺傳分化指數(shù)和基因流的范圍分別為0.045~0.363和0.440~5.293,MF群體和MW群體之間出現(xiàn)最高值,SH群體和ZJ群體出現(xiàn)最低值,SH群體和ZJ群體基因流最高,...

【文章頁數(shù)】:15 頁


本文編號:4039462

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