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三疣梭子蟹分子標(biāo)記與生長性狀相關(guān)性分析

發(fā)布時間:2025-01-11 02:36
  為了改進三疣梭子蟹人工養(yǎng)殖及遺傳育種工作,本文利用公共數(shù)據(jù)庫法開發(fā)了三疣梭子蟹多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記,并通過這些微衛(wèi)星標(biāo)記及AFLP技術(shù)對其生長性狀進行相關(guān)性分析,利用分子標(biāo)記輔助選育提高三疣梭子蟹養(yǎng)殖產(chǎn)量。 本研究通過公共數(shù)據(jù)庫法篩選三疣梭子蟹多態(tài)性微衛(wèi)星位點,首先通過軟件SRHUNTER13.0查找含有微衛(wèi)星的序列,最終得到1578條含有微衛(wèi)星的EST序列。選取150條EST序列使用Primer5.0設(shè)計微衛(wèi)星引物,其中27個微衛(wèi)星位點具有豐富的多態(tài)性。遺傳多樣性分析結(jié)果表明每個微衛(wèi)星位點的等位基因數(shù)目從3-14個不等,等位基因平均數(shù)目為6.8個,觀測雜合度(Ho)的范圍從0.233-1.000,期望雜合度(He)的范圍從0.160-0.789,PIC值的范圍為0.222-0.875。 利用本研究開發(fā)的微衛(wèi)星位點以及AFLP技術(shù),對三疣梭子蟹Y1單對家系的F1代進行生長性狀進行相關(guān)性分析。經(jīng)過多態(tài)性檢測,有10個微衛(wèi)星位點在F1代中表現(xiàn)出多態(tài)性,AFLP技術(shù)中篩選出13對多態(tài)性位點清晰的引物組合,并得到85個多態(tài)性位點。采用軟件SPSS19.0分析10個SSR位點及85個AFLP位...

【文章頁數(shù)】:55 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2.1三疣梭子蟹基因組DNA電泳結(jié)果

圖2.1三疣梭子蟹基因組DNA電泳結(jié)果

放入上述三洗的蒸餾水中洗5m干燥后,用掃描儀進行掃描并統(tǒng)計數(shù)據(jù)。胺凝膠電泳(PAGE)條帶擴增的情況,以下實驗結(jié)果。先將實驗結(jié)果分別轉(zhuǎn)化格式,分別進行每個SSR位點的等位基因PIC值以及HEW(Hardy-Weinbergequilibrium取結(jié)果DNA的提取是....


圖2.234號引物PCR瓊脂糖擴增產(chǎn)物Fig.2.2Theagarosepictureofprimersscreeningof34

圖2.234號引物PCR瓊脂糖擴增產(chǎn)物Fig.2.2Theagarosepictureofprimersscreeningof34

物PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果驗以篩選的含有微衛(wèi)星的EST序列,共249條,其中150條適于用來設(shè)用Primer5.0(http://www.premierbiosoft.com/)對這150條EST序列分別設(shè)計衛(wèi)星引物。首先以8個三疣梭子蟹的D....


圖2.3130號引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測Fig.2.3ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof130

圖2.3130號引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測Fig.2.3ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof130

錄每個位點的多態(tài)性,經(jīng)過GENEPOP4.0和CERVERS3.0處理計算遺傳參數(shù)(表2.2)遺傳多樣性分析結(jié)果表明每個微衛(wèi)星位點的等位基因數(shù)目從3-14個不等,平均等位基因數(shù)為6.8個,觀測雜合度(Ho)的范圍從0.233-1.000,期望雜合度(He)的范圍從....


圖2.589號引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測Fig.2.5ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof89

圖2.589號引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測Fig.2.5ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof89

錄每個位點的多態(tài)性,經(jīng)過GENEPOP4.0和CERVERS3.0處理計算遺傳參數(shù)(表2.2)遺傳多樣性分析結(jié)果表明每個微衛(wèi)星位點的等位基因數(shù)目從3-14個不等,平均等位基因數(shù)為6.8個,觀測雜合度(Ho)的范圍從0.233-1.000,期望雜合度(He)的范圍從....



本文編號:4025805

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