蛤仔作為典型的灘涂埋棲型貝類,生活在海洋與陸地過渡的潮間帶區(qū)域。除每天在經歷數(shù)小時的干露脅迫下,需應對溫度、溶解氧、水中CO₂、鹽度及pH等環(huán)境條件的復雜變化。在蛤仔全基因組的基礎上,研究干露脅迫下蛤仔能量代謝相關的AMPKs、SIRTs、PPARs基因家族響應機制,對揭示蛤仔灘涂生活適應性具有重要意義,同時也為灘涂貝類抗逆研究提供重要參考。在蛤仔基因組中,選取能量代謝相關基因基因家族:AMPKs、PPARs和SIRTs作為研究對象。通過生物信息學方法分析表明,蛤仔AMPKs包含AMPKα、AMPKβ和AMPKγ三個亞基。開放閱讀框長度分別為1722、837和1137bp,編碼595、284和392個氨基酸,預測相對分子量范圍為30.83-64.55kDa,等電點范圍是6.28-8.69�；蚪Y構分析表明:AMPKα含21個外顯子,AMPKβ含8個外顯子,AMPKγ含12個外顯子。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,蛤仔和福壽螺AMPKα/β/γ親緣關系較近。蛤仔SIRT基因家族鑒定出五種亞型,分別命名為SIRT1、SIRT2、SIRT4、SIRT6和SIRT7,開放閱讀框長度分別為...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-2.蛤仔AMPKrandomcoil蛋白二級結構預測

注：圓柱形代表α螺旋，箭頭代表β折疊，橫線代表無規(guī)卷曲Note：Thecylindricalshapesindicateα-helix,thearrowsindicatetheβ-fold,andthehorizontallinesindicateth....

圖2-3.蛤仔AMPKtapes蛋白三級結構預測

注：圓柱形代表α螺旋，箭頭代表β折疊，橫線代表無規(guī)卷曲Note：Thecylindricalshapesindicateα-helix,thearrowsindicatetheβ-fold,andthehorizontallinesindicateth....

圖2-4.蛤仔與其他物種AMPK種The蛋白多序列比對及功能域Fig2-4.MultiplesequencealignmentandfunctionaldomainofAMPKα/β/γproteinbetweenRuditapesphilippinarumandotherspecies

19注：黑色部分為保守氨基酸，灰色部分為相似氨基酸Note:Theblackpartareconservedaminoacid,thegraypartaresimilaraminoacid圖2-4.蛤仔與其他物種AMPK種The蛋白多序列比....

圖2-6.蛤仔不同發(fā)育時期及不同組織中AMPKα/β/γ相對表達量Fig2-6.RelativeexpressionlevelsofAMPKα/β/γindifferentdevelopmentalstagesandtissuesof

肌）AMPK表達進行分析。AMPK在五種組織中均有一定表達，其中在性腺，鰓和腸組織中表達水平較高（圖6）。腸中AMPKα表達量最高，其次是性腺和鰓，在閉殼肌和外套膜中表達很低；AMPKβ和AMPKγ在五中組織中表達模式類似，均在鰓組織中表達量最高，其次是腸組織（圖....

本文編號：4006373