【目的】挖掘七彩神仙魚(yú)(Symphysodon haraldi)腦組織性別差異基因,為揭示腦組織性別相關(guān)基因調(diào)控繁殖生理機(jī)制打下基礎(chǔ)�！痉椒ā坷肐llumina HiSeq 6000測(cè)序平臺(tái)對(duì)七彩神仙魚(yú)雌、雄腦組織樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,經(jīng)過(guò)濾和Trinity組裝獲得基因,采用DIAMOND進(jìn)行功能注釋;并選取NR、GO、KEGG、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG等數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),篩選出差異表達(dá)候選基因;隨機(jī)選取6個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證�！窘Y(jié)果】從構(gòu)建的七彩神仙魚(yú)腦組織cDNA文庫(kù)測(cè)序獲得337190200條原始數(shù)據(jù)(Raw reads),經(jīng)質(zhì)量篩選后獲得34109個(gè)基因(平均長(zhǎng)度1007.00 bp)和67488個(gè)轉(zhuǎn)錄本(平均長(zhǎng)度694.00 bp)。經(jīng)生物信息學(xué)分析方法篩選,最終獲得85個(gè)差異表達(dá)基因(61個(gè)在雄魚(yú)腦組織中高表達(dá),24個(gè)在雌魚(yú)腦組織中高表達(dá)),包括黑色素濃集激素(MCH)、催乳素釋放激素(Prlh)、垂體同源結(jié)構(gòu)域轉(zhuǎn)錄因子2(pitx2)、免疫球蛋白家族成員(DSCAM和IGDCC3)、溶質(zhì)載體(UNC93B1)及醛糖還原酶(AKR1...

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圖1七彩神仙魚(yú)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得基因在GO數(shù)據(jù)庫(kù)中的功能注釋結(jié)果

2.2七彩神仙魚(yú)雌、雄魚(yú)腦組織間的差異表達(dá)基因圖2七彩神仙魚(yú)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得基因的KEGG信號(hào)通路富集分析結(jié)果

圖2七彩神仙魚(yú)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得基因的KEGG信號(hào)通路富集分析結(jié)果

圖1七彩神仙魚(yú)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得基因在GO數(shù)據(jù)庫(kù)中的功能注釋結(jié)果依據(jù)雌、雄魚(yú)腦組織表達(dá)量差異倍數(shù)（log2絕對(duì)值）≥1且P≤0.05的標(biāo)準(zhǔn)，篩選七彩神仙魚(yú)雌、雄魚(yú)腦組織間的差異表達(dá)基因，結(jié)果獲得85個(gè)差異表達(dá)基因。85個(gè)差異表達(dá)基因在6個(gè)樣品中的具體表達(dá)情況詳見(jiàn)圖3。與雌魚(yú)相比，有....

圖3七彩神仙魚(yú)雌、雄魚(yú)腦組織間差異表達(dá)基因的聚類熱圖

隨機(jī)選取6個(gè)差異表達(dá)基因（Prlh、pitx2、MCH、LMX1A、KBP和CRP），采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)其在七彩神仙魚(yú)雌、雄魚(yú)腦組織中的表達(dá)情況，結(jié)果（圖4）顯示，Prlh、pitx2、MCH、LMX1A和KBP基因在雌魚(yú)腦組織中的相對(duì)表達(dá)量較高，而CRP基因在雄魚(yú)腦組織....

圖4部分差異表達(dá)基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證結(jié)果

在七彩神仙魚(yú)雄魚(yú)腦組織中也存在一些高表達(dá)的差異表達(dá)基因，包括DSCAM、IGDCC3、UNC93B1、AKR1B1和Nid1等基因。DSCAM是細(xì)胞答黏附分子（Ig-CAM）免疫球蛋白家族的成員之一，在果蠅、小鼠及人類的神經(jīng)系統(tǒng)中廣泛表達(dá)，具有較高的表達(dá)水平，可能在神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育....

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