河川沙塘鱧MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2024-02-27 05:42
河川沙塘鱧(Odontobutis potamophila)為我國(guó)特有的小型淡水底棲肉食性經(jīng)濟(jì)魚類,目前對(duì)河川沙塘鱧的研究主要集中在選育種和養(yǎng)殖等方面,對(duì)其免疫相關(guān)基因和抗病因子研究未見報(bào)道。因此,開展河川沙塘鱧的免疫相關(guān)基因(因子)研究,初步了解其免疫應(yīng)答機(jī)制,對(duì)河川沙塘鱧病害防治和開辟河川沙塘鱧抗病育種新途徑具有重要意義。本研究以河川沙塘鱧為研究對(duì)象,采用RACE、實(shí)時(shí)熒光定量PCR等技術(shù),對(duì)該魚的MHCⅡA、MHCⅡB、MyD88和TLR2 4個(gè)基因進(jìn)行了克隆和表達(dá)模式分析。主要研究結(jié)果如下:1、獲得了河川沙塘鱧MHCⅡA、MHCⅡB、MyD88和TLR2基因的全長(zhǎng)cDNA序列,分別為884bp、896bp、1445bp和3473bp;預(yù)測(cè)其包括開放閱讀框(ORF)分別為 711bp、726bp、726bp 和 2631bp,分別編碼 236、241、288 和 876 個(gè)氨基酸;其 5’UTR分別為 19bp、20bp、31bp 和 75bp,3’UTR 分別為 154bp、150bp、557bp 和 767bp。4個(gè)基因的3’UTR均有脊椎動(dòng)物典型的加尾信號(hào)AATAAA,以及...
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 河川沙塘鱧研究進(jìn)展
1.2 魚類的免疫(抗病)基因的研究進(jìn)展
1.2.1 魚類免疫系統(tǒng)
1.2.2 MHC基因研究進(jìn)展
1.2.3 TLR2和MyD88基因研究進(jìn)展
1.3 本研究的主要內(nèi)容和目的意義
第二章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因的克隆與序列分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 主要儀器設(shè)備
2.1.3 主要試劑
2.1.4 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA全長(zhǎng)的獲得
2.1.5 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因序列生物信息學(xué)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA全長(zhǎng)序列特征
2.2.2 信號(hào)肽預(yù)測(cè)
2.2.3 蛋白結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)
2.2.4 同源性和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 討論
第三章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因的組織表達(dá)特異性分析
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 主要儀器設(shè)備
3.1.3 主要試劑
3.1.4 健康河川沙塘鱧不同組織表達(dá)特異性分析
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3 討論
第四章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因應(yīng)對(duì)嗜水氣單胞菌感染下的mRNA水平表達(dá)
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 主要儀器設(shè)備
4.1.3 主要試劑
4.1.4 菌液制備
4.1.5 人工感染后不同時(shí)期不同組織表達(dá)水平變化的分析
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.2.1 嗜水氣單胞菌感染后MHCⅡA基因表達(dá)變化
4.2.2 嗜水氣單胞菌感染后MHCⅡB基因表達(dá)變化
4.2.3 嗜水氣單胞菌感染后MyD88基因表達(dá)變化
4.2.4 嗜水氣單胞菌感染后TLR2基因表達(dá)變化
4.3 討論
第五章 全文小結(jié)與展望
5.1 全文小結(jié)
5.2 展望
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
本文編號(hào):3912456
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 河川沙塘鱧研究進(jìn)展
1.2 魚類的免疫(抗病)基因的研究進(jìn)展
1.2.1 魚類免疫系統(tǒng)
1.2.2 MHC基因研究進(jìn)展
1.2.3 TLR2和MyD88基因研究進(jìn)展
1.3 本研究的主要內(nèi)容和目的意義
第二章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因的克隆與序列分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 主要儀器設(shè)備
2.1.3 主要試劑
2.1.4 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA全長(zhǎng)的獲得
2.1.5 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因序列生物信息學(xué)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA全長(zhǎng)序列特征
2.2.2 信號(hào)肽預(yù)測(cè)
2.2.3 蛋白結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)
2.2.4 同源性和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 討論
第三章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因的組織表達(dá)特異性分析
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 主要儀器設(shè)備
3.1.3 主要試劑
3.1.4 健康河川沙塘鱧不同組織表達(dá)特異性分析
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3 討論
第四章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因應(yīng)對(duì)嗜水氣單胞菌感染下的mRNA水平表達(dá)
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 主要儀器設(shè)備
4.1.3 主要試劑
4.1.4 菌液制備
4.1.5 人工感染后不同時(shí)期不同組織表達(dá)水平變化的分析
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.2.1 嗜水氣單胞菌感染后MHCⅡA基因表達(dá)變化
4.2.2 嗜水氣單胞菌感染后MHCⅡB基因表達(dá)變化
4.2.3 嗜水氣單胞菌感染后MyD88基因表達(dá)變化
4.2.4 嗜水氣單胞菌感染后TLR2基因表達(dá)變化
4.3 討論
第五章 全文小結(jié)與展望
5.1 全文小結(jié)
5.2 展望
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
本文編號(hào):3912456
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3912456.html
最近更新
教材專著