為了研究不同魚類胰α-淀粉酶基因5’端調(diào)控序列轉(zhuǎn)錄因子差異與魚類食性分化之間的關(guān)系。通過PCR克隆測序和查詢NCBI數(shù)據(jù)庫,獲得32種魚類胰α淀粉酶基因5’端824 bp序列,并對(duì)魚類胰α淀粉酶基因5’端序列進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子和系統(tǒng)發(fā)育分析。按不同的營養(yǎng)類型將魚類分為雜食性、植食性和肉食性,通過百分比相似性分析不同食性魚類的胰α淀粉酶基因轉(zhuǎn)錄因子的組成差異以及轉(zhuǎn)錄因子與魚類食性的關(guān)系。結(jié)果顯示:不同食性魚類的胰α-淀粉酶基因5’端序列存在轉(zhuǎn)錄因子種類差異,植食性-肉食性魚類差異主要體現(xiàn)在E47、C/EBPalpha、NF-Y和Pax-2,植食性-雜食性差異主要體現(xiàn)在deltaEF1、MyoD、NF-Y、AREB6和Pax-2,雜食性-肉食性差異主要體現(xiàn)在GATA-1、SRY、MyoD、HFH-8、AREB6、Pax-2、STAT5A和AP-1。系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果與傳統(tǒng)形態(tài)分類學(xué)大體相符,相同食性的魚類并沒有聚為一類。魚類胰α-淀粉酶基因5’端調(diào)控序列中與食性分化相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子有E47、C/EBPalpha、NF-Y、Pax-2、deltaEF1、MyoD、AREB6、GATA-1、SRY、HFH-...

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【部分圖文】：

圖1克隆獲得序列的部分片段

利用在線軟件NNPP分析了這5種魚類α-淀粉酶基因5?端序列的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)TSS(+1),(圖1)。在α-淀粉酶基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-17(-19)處存在TATA-box,但是鳤的TATA-box序列“GG-ATATAAACTGCAC”和其他4種魚類“GTATATA-AACTGC....

圖232種魚類轉(zhuǎn)錄因子類型的數(shù)量

本文研究的32種魚類隸屬12目、19科(表1)。利用胰α-淀粉酶基因?qū)?2種魚類進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,根據(jù)胰α-淀粉酶基因啟動(dòng)子序列構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果顯示,鱸形目魚類深裂眶鋸雀鯛、堇菜色猿線鳚、攀鱸、眼斑雙鋸魚、大彈涂魚、尖吻鱸和大黃魚聚為一類;鯉形目魚類草魚、鳤、青魚、鯪、鳙、....

圖3淀粉酶基因5?側(cè)翼序列的系統(tǒng)發(fā)育樹分析

圖232種魚類轉(zhuǎn)錄因子類型的數(shù)量3討論

本文編號(hào)：3898619