中華鱉是我國(guó)淡水名特養(yǎng)殖對(duì)象,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。在其養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展過(guò)程中因缺乏有效的品種選育,不同地理群體無(wú)序流動(dòng)及國(guó)外群體的引入,導(dǎo)致當(dāng)前中華鱉種質(zhì)混雜,有關(guān)中華鱉遺傳基礎(chǔ)研究薄弱,遺傳育種工作才剛剛起步。本研究利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)雌雄中華鱉進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,通過(guò)序列的拼接和注釋,發(fā)掘與生長(zhǎng)、性別等主要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的候選基因,為中華鱉功能基因研究和分子育種工作提供有價(jià)值的信息。從轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的Unigenes中篩選并驗(yàn)證了微衛(wèi)星(SSR)標(biāo)記,結(jié)合擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)標(biāo)記分析了中華鱉四個(gè)主要養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性,并利用RT-PCR技術(shù),對(duì)中華鱉生長(zhǎng)激素受體(GHR)和生長(zhǎng)激素誘導(dǎo)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(GHITM)基因進(jìn)行了基因克隆和表達(dá)分析。為中華鱉遺傳分析、遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及生長(zhǎng)相關(guān)QTLs等工作提供了有力工具。主要結(jié)果如下：1.研究不同生長(zhǎng)階段中華鱉形態(tài)特征差異及雌雄中華鱉體重與形態(tài)特征差異,采用相關(guān)分析計(jì)算了形態(tài)特征與體重的關(guān)系,通徑分析計(jì)算表型特征對(duì)體重的通徑系數(shù)、決定系數(shù),探討各形態(tài)特征的對(duì)體重的影響程度。100日齡中華鱉腹甲長(zhǎng)對(duì)體重影響最大,300日齡中華鱉體高對(duì)體重影響...

【文章頁(yè)數(shù)】：115 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 中華鱉種質(zhì)資源現(xiàn)狀
        1.1 中華鱉分布及種群
        1.2 種質(zhì)資源研究
    2 水產(chǎn)動(dòng)物分子標(biāo)記輔助育種研究現(xiàn)狀
        2.1 AFLP技術(shù)
        2.2 微衛(wèi)星技術(shù)
    3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
        3.1 高通量測(cè)序技術(shù)發(fā)展概況
        3.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)
        3.3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用
        3.4 有無(wú)參考基因組的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究
    4 水產(chǎn)動(dòng)物生長(zhǎng)相關(guān)基因研究現(xiàn)狀
        4.1 生長(zhǎng)激素受體基因研究進(jìn)展
        4.2 生長(zhǎng)激素誘導(dǎo)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展
    5 本文研究目的與意義
第二章 雌雄中華鱉轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析
    1 試驗(yàn)材料與方法
        1.1 試驗(yàn)材料
        1.2 主要試劑與儀器
        1.3 試驗(yàn)方法
        1.4 數(shù)據(jù)處理
    2 結(jié)果與分析
        2.1 RNA提取和轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)的構(gòu)建
        2.2 序列分析和拼接組裝
        2.3 Unigene功能注釋、GO分類(lèi)和代謝途徑分析
        2.4 差異基因表達(dá)分析
        2.5 微衛(wèi)星標(biāo)記分析
        2.6 生長(zhǎng)相關(guān)基因與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
        2.7 性別相關(guān)基因
    3 討論
        3.1 中華鱉轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)總體評(píng)價(jià)
        3.2 生長(zhǎng)相關(guān)基因篩選
        3.3 性別相關(guān)基因篩選
        3.4 SSR在中華鱉轉(zhuǎn)錄中的分布特點(diǎn)
    4 小結(jié)
第三章 中華鱉形態(tài)及群體遺傳多樣性分析
    1 中華鱉體重與形態(tài)特征的關(guān)聯(lián)分析
        1.1 材料與方法
        1.2 結(jié)果與分析
        1.3 討論
        1.4 小結(jié)
    2 雌雄中華鱉表型性狀對(duì)體重的影響效果
        2.1 材料與方法
        2.2 結(jié)果與分析
        2.3 討論
        2.4 小結(jié)
    3 遺傳多樣性微衛(wèi)星分析
        3.1 材料和方法
        3.2 結(jié)果與分析
        3.3 討論
    4 遺傳多樣性AFLP分析
        4.1 材料和方法
        4.2 結(jié)果與分析
        4.3 討論
        4.4 小結(jié)
第四章 中華鱉GHR和GHITM基因克隆及表達(dá)
    1 試驗(yàn)材料和方法
        1.1 試驗(yàn)用魚(yú)
        1.2 主要藥品與試劑
        1.3 引物
        1.4 試驗(yàn)方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 中華鱉GHR及GHTIM cDNA克隆及序列分析
        2.2 基因編碼氨基酸序列功能域分析
        2.3 蛋白質(zhì)信號(hào)肽和蛋白跨膜區(qū)域預(yù)測(cè)
        2.4 氨基酸序列親/疏水性分析
        2.5 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.6 蛋白的高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.7 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
        2.8 組織表達(dá)特性及發(fā)育階段變化
    3 討論
        3.1 GHR基因
        3.2 GHITM基因
        3.3 GHR和GHITM在不同日齡雌雄中華鱉中的表達(dá)變化
結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)及研究展望
    1. 研究結(jié)論
    2. 研究創(chuàng)新
    3. 展望
參考文獻(xiàn)
縮略語(yǔ)
致謝
作者簡(jiǎn)歷



本文編號(hào)：3867229