谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶(Glutathione S-transferases, GSTs)是一組廣泛存在于動物、植物和微生物等各種生物體內(nèi)的多功能同工酶，其主要功能是催化生物體內(nèi)的谷胱甘肽與外源化合物如有毒異源物或氧化產(chǎn)物的結合，從而發(fā)揮其解毒及抗氧化作用，由此來保護生物體免受損害。條斑紫菜是我國大面積養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟海藻之一，對其基因克隆、遺傳變異、抗逆性的分子機制及進化分析等方面的研究具有代表性意義。 為了更深入的了解藻類對于有毒物質(zhì)等的抗性原理，為進一步了解GST在藻類等低等植物中的功能及抗逆的分子機制，本實驗首先在KDRI的DNA數(shù)據(jù)庫中查找到條斑紫菜GST的63條EST序列，采用DNAMAN軟件和NCBI中的BLAST拼接所獲得的EST序列，最終得到三條拼接的EST序列。經(jīng)BLAST比對后，將其中一條在NCBI數(shù)據(jù)庫中找不到同源序列的EST片段確定為研究對象，命名為PyGST。通過設計引物并利用3’RACE-PCR技術擴增PyGST基因，最終得到含有完整ORF的PyGST序列。此序列長度為915bp。運用MEGA4.0程序、Protparam、ProtScal、TMpred Ser...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
引言
第一章 概述
    1.1 紫菜的生物學特性
        1.1.1 名稱及分類地位
        1.1.2 形態(tài)結構及生活史
        1.1.3 應用價值和研究價值
    1.2 谷胱甘肽 S-轉(zhuǎn)移酶基因的研究概述
        1.2.1 分類
        1.2.2 結構
        1.2.3 功能
    1.3 生物信息學
    1.4 系統(tǒng)進化樹
    1.5 本實驗研究目的、內(nèi)容及意義
第二章 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 實驗材料的來源與處理
        2.1.2 實驗主要儀器及試劑來源
        2.1.3 相關溶液及培養(yǎng)基的配制
    2.2 實驗方法
        2.2.1 條斑紫菜 RNA 的提取與純化
        2.2.2 PyGST 基因 cDNA 的 3’ RACE-PCR 擴增
        2.2.3 生物信息學分析方法
        2.2.4 系統(tǒng)進化樹的構建
第三章 結果與討論
    3.1 實驗結果與分析
        3.1.1 條斑紫菜的 RNA 電泳檢測
        3.1.2 PyGST 基因的 3′RACE-PCR 擴增電泳檢測
        3.1.3 菌液 PCR 電泳檢測
        3.1.4 序列分析
    3.2 生物信息學分析
        3.2.1 蛋白質(zhì)序列的理化性質(zhì)分析
        3.2.2 疏水性分析
        3.2.3 跨膜結構預測
        3.2.4 信號肽預測
        3.2.5 亞細胞定位
        3.2.6 蛋白質(zhì)卷曲螺旋結構的預測
        3.2.7 磷酸化位點的預測
        3.2.8 蛋白質(zhì)二級結構預測
        3.2.9 結構域分析
        3.2.10 蛋白質(zhì)三級結構預測
    3.3 系統(tǒng)進化樹的構建
    3.4 討論
第四章 結論
參考文獻
攻讀碩士學位期間發(fā)表學術論文情況
致謝



本文編號：3852202