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河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性比較研究

發(fā)布時(shí)間:2023-10-02 06:52
  本文通過線粒體DNA控制區(qū)全長序列和細(xì)胞色素b基因部分片段遺傳標(biāo)記輔以簡單形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)測量,分析比較了分布在新疆北屯、烏倫古湖、博斯騰湖的3個(gè)河鱸野生群體和北湖、五家渠的2個(gè)河鱸養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性。為河鱸的野生群體種質(zhì)資源的復(fù)壯及可持續(xù)開發(fā)利用和人工養(yǎng)殖群體優(yōu)良種質(zhì)資源的培育提供一定的理論參考基礎(chǔ),結(jié)果如下:1.在歐洲河鱸已識別部分保守序列基礎(chǔ)上,對新疆河鱸線粒體DNA控制區(qū)全序列測定后進(jìn)一步識別了中央保守區(qū)的CSB-F、CSB-E、CSB-C和CSB-B的序列。劃分出河鱸線粒體DNA控制區(qū)的終止序列區(qū)(TAS)、中央保守區(qū)(CD)和保守序列區(qū)(CSB)的界限。對新疆河鱸、歐洲河鱸和黃金鱸三者間以及新疆河鱸的野生和養(yǎng)殖群體兩者間進(jìn)行了mt DNA控制區(qū)堿基結(jié)構(gòu)組成分析,發(fā)現(xiàn)在終止序列區(qū)(TAS)的堿基結(jié)構(gòu)組成上,新疆河鱸以4個(gè)重復(fù)序列為主,歐洲河鱸以3個(gè)重復(fù)序列為主,而黃金鱸只有4個(gè)重復(fù)序列,并且三者在控制區(qū)其它區(qū)域也存在差異,與歐洲河鱸相比,新疆河鱸和黃金鱸出現(xiàn)了部分堿基的缺失;新疆河鱸野生群體的重復(fù)序列堿基變異類型多于養(yǎng)殖群體。以圓斑星鰈為外群,用鄰接法(NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹表明,...

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
中英符號縮略詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 河鱸概述
        1.1 河鱸的分類地位及分布?xì)v史簡介
        1.2 河鱸形態(tài)特征
        1.3 河鱸生活環(huán)境及食性
        1.4 河鱸營養(yǎng)功效
        1.5 河鱸的國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    2 魚類遺傳多樣性研究概況
        2.1 魚類遺傳多樣性概述
        2.2 魚類遺傳多樣性的研究方法及應(yīng)用
    3 本研究的目的和意義
第二章 基于線粒體DNA控制區(qū)研究河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及差異
    前言
    1 實(shí)驗(yàn)材料與設(shè)備
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 主要儀器
        1.3 主要試劑
    2 研究方法
        2.1 河鱸基因組DNA的提取及檢測
        2.2 河鱸線粒體DNA控制區(qū)單倍型篩選
        2.3 河鱸線粒體DNA D-loop全長序列擴(kuò)增
        2.4 目的條帶的純化回收
        2.5 目的條帶的連接和轉(zhuǎn)化
        2.6 數(shù)據(jù)分析和處理
            2.6.1 河鱸線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析
            2.6.2 新疆河鱸野生與養(yǎng)殖群體mtDNA控制區(qū)遺傳多樣性比較分析
    3 結(jié)果分析
        3.1 河鱸總DNA提取
        3.2 河鱸線粒體DNA控制區(qū)單倍型篩選
        3.3 線粒體DNA D-loop區(qū)全序列擴(kuò)增
        3.4 河鱸線粒體DNA控制區(qū)堿基結(jié)構(gòu)分析
            3.4.1 新疆河鱸、歐洲河鱸和黃金鱸線粒體DNA控制區(qū)序列差異比較
            3.4.2 新疆河鱸、歐洲河鱸和黃金鱸線粒體DNA控制區(qū)序列比較分析
            3.4.3 新疆河鱸野生和養(yǎng)殖群體線粒體DNA控制區(qū)差異比較
            3.4.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.5 新疆河鱸野生與養(yǎng)殖群體線粒體DNA控制區(qū)遺傳多樣性比較分析
    4 討論
        4.1 河鱸線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析
        4.2 新疆河鱸野生與養(yǎng)殖群體線粒體DNA控制區(qū)遺傳多樣性比較分析
第三章 基于線粒體細(xì)胞色素b基因部分序列研究河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性
    前言
    1 實(shí)驗(yàn)材料和設(shè)備
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 主要儀器
        1.3 主要試劑
    2 研究方法
        2.1 基因組DNA提取及純度檢測
        2.2 PCR擴(kuò)增測序
        2.3 數(shù)據(jù)處理
    3 結(jié)果分析
        3.1 新疆河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體細(xì)胞色素b基因部分序列變異分析
        3.2 新疆河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體細(xì)胞色素b基因部分序列遺傳結(jié)構(gòu)分析
    4 討論
        4.1 河鱸野生和養(yǎng)殖群體的分子遺傳多樣性比較
        4.2 河鱸群體的遺傳分化
第四章 基于簡單形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)分析河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體的表型差異
    前言
    1 實(shí)驗(yàn)材料
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 河鱸年齡的鑒定及簡單形態(tài)學(xué)測量
        2.2 形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)處理
    3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1 年齡鑒定
        3.2 體長和體重的比較
    4 討論
第五章 河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及差異研究結(jié)論總述
第六章 創(chuàng)新點(diǎn)和展望
    1 創(chuàng)新點(diǎn)
    2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
    附錄一 實(shí)驗(yàn)所用試劑配方
    附錄二 新疆河鱸野生群體和養(yǎng)殖群體的體長、體重測量及年齡測定原始數(shù)據(jù)
致謝
作者簡介
石河子大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評閱表



本文編號:3850317

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