牙鲆三種免疫基因的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時間:2023-09-03 21:47
趨化因子是一類具有化學(xué)趨化功能的小分子分泌性蛋白(6-14 k Da)。研究者最初從哺乳動物中發(fā)現(xiàn)趨化因子,它能夠趨化白細(xì)胞到損傷或者感染的部位,參與免疫調(diào)節(jié)和病理反應(yīng)。趨化因子家族大都具有保守的半胱氨酸序列,基于前兩個半胱氨酸的排列,趨化因子被歸為四種類型:CXC、CC、C和CX3C。CXC趨化因子的前兩個半胱氨酸中間插入了一個其它的氨基酸。趨化因子的受體是具有七個跨膜區(qū)的G蛋白偶聯(lián)受體。趨化因子受體和它們的配體,是啟動和控制免疫細(xì)胞轉(zhuǎn)移模式的重要因子,在先天性和獲得性免疫系統(tǒng)的功能中發(fā)揮重要的作用。根據(jù)結(jié)合的趨化因子的不同,將趨化因子受體分為CXCR1-CXCR5(與CXC結(jié)合)、CCR1-CCR9(與CC結(jié)合)、XCR1(與C結(jié)合)、CX3CR(與CX3C結(jié)合)。牙鲆是一種很重要的海產(chǎn)魚類,具有較高的營養(yǎng)價值和經(jīng)濟(jì)價值,被廣泛養(yǎng)殖于中國、韓國和日本等亞洲國家。近年來隨著牙鲆高密度工廠化養(yǎng)殖的不斷發(fā)展和養(yǎng)殖環(huán)境的惡化,各種疾病也頻繁爆發(fā),對牙鲆養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。雖然采用了抗菌素等傳統(tǒng)的藥物治療取得了一定的效果,但隨著細(xì)菌耐藥性的增強(qiáng)以及藥物在魚體內(nèi)的殘留,給消費者的健康造...
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 趨化因子概況
1.1 趨化因子結(jié)構(gòu)及其分類
1.2 CXC趨化因子
2 趨化因子受體概況
2.1 趨化因子受體結(jié)構(gòu)及其分類
2.2 趨化因子受體的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制
2.3 趨化因子與趨化因子受體CCL20/CCR6的研究進(jìn)展
3 硬骨魚類中趨化因子及其受體的研究
3.1 魚類中CXC趨化因子的研究
3.2 魚類中CCR趨化因子受體的研究
4 趨化因子及其受體的功能
4.1 趨化因子及其受體在免疫中的作用
4.2 趨化因子及其受體在生理和病理反應(yīng)中的作用
4.2.1 趨化因子及其受體在淋巴細(xì)胞的生成及歸巢中的作用
4.2.2 趨化因子及其受體在抗原提呈與T、B淋巴細(xì)胞的活化中的作用
4.2.3 趨化因子及其受體促進(jìn)T細(xì)胞的極化
4.2.4 在損傷愈合中的作用
4.2.5 在炎癥反應(yīng)中的作用
4.2.6 在腫瘤中的作用
4.2.7 趨化因子及其受體在抗HIV感染中的作用
第二章 牙鲆CXCL9趨化因子的克隆、鑒定與表達(dá)分析
1 實驗材料
1.1 實驗用魚
1.2 主要試劑和儀器
2 實驗方法
2.1 組織樣本采集
2.2 牙鲆各組織RNA的提取
2.3 cDNA第一鏈的合成
2.4 CXCL9基因cDNA克隆驗證
2.4.1 中間序列驗證RCP引物和RACE引物合成
2.4.2 CXCL9中間序列驗證
2.4.3 PCR產(chǎn)物純化
2.4.4 目的片段的連接與轉(zhuǎn)化
2.4.5 陽性克隆的檢測與測序
2.4.6 3'RACE-ready cDNA和 5'RACE-ready cDNA的制備
2.4.7 大菱鲆趨化因子cDNA 5'和 3'末端的快速擴(kuò)增(RACE)
2.5 序列和進(jìn)化分析
2.6 實時熒光相對定量PCR
3 結(jié)果與分析
2.1 牙鲆CXCL9基因的克隆
2.2 牙鲆CXCL9基因的序列比對及同源性分析
2.3 實時熒光定量PCR檢測結(jié)果
4 討論
第三章 牙鲆兩種新型單外顯子PoCCR6A和PoCCR6B基因的克隆和表達(dá)分析
1 實驗材料
1.1 實驗用魚
1.2 總RNA的提取及cDNA的合成
1.3 總DNA的提取
1.4 牙鲆PoCCR6A和PoCCR6B的克隆
1.5 序列分析和進(jìn)化樹分析
1.6 PoCCR6A和PoCCR6B的組織表達(dá)
1.7 PoCCR6A和PoCCR6B在細(xì)菌感染后的表達(dá)
1.8 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 牙鲆PoCCR6A和PoCCR6B基因的克隆分析
2.2 序列分析和進(jìn)化樹分析
2.3 牙鲆PoCCR6A和PoCCR6B基因的組織表達(dá)分析
2.4 PoCCR6A和PoCCR6B趨化因子受體在鰻弧菌感染后組織中的表達(dá)分析
3 討論
總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
碩士期間科研成果
致謝
本文編號:3845831
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 趨化因子概況
1.1 趨化因子結(jié)構(gòu)及其分類
1.2 CXC趨化因子
2 趨化因子受體概況
2.1 趨化因子受體結(jié)構(gòu)及其分類
2.2 趨化因子受體的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制
2.3 趨化因子與趨化因子受體CCL20/CCR6的研究進(jìn)展
3 硬骨魚類中趨化因子及其受體的研究
3.1 魚類中CXC趨化因子的研究
3.2 魚類中CCR趨化因子受體的研究
4 趨化因子及其受體的功能
4.1 趨化因子及其受體在免疫中的作用
4.2 趨化因子及其受體在生理和病理反應(yīng)中的作用
4.2.1 趨化因子及其受體在淋巴細(xì)胞的生成及歸巢中的作用
4.2.2 趨化因子及其受體在抗原提呈與T、B淋巴細(xì)胞的活化中的作用
4.2.3 趨化因子及其受體促進(jìn)T細(xì)胞的極化
4.2.4 在損傷愈合中的作用
4.2.5 在炎癥反應(yīng)中的作用
4.2.6 在腫瘤中的作用
4.2.7 趨化因子及其受體在抗HIV感染中的作用
第二章 牙鲆CXCL9趨化因子的克隆、鑒定與表達(dá)分析
1 實驗材料
1.1 實驗用魚
1.2 主要試劑和儀器
2 實驗方法
2.1 組織樣本采集
2.2 牙鲆各組織RNA的提取
2.3 cDNA第一鏈的合成
2.4 CXCL9基因cDNA克隆驗證
2.4.1 中間序列驗證RCP引物和RACE引物合成
2.4.2 CXCL9中間序列驗證
2.4.3 PCR產(chǎn)物純化
2.4.4 目的片段的連接與轉(zhuǎn)化
2.4.5 陽性克隆的檢測與測序
2.4.6 3'RACE-ready cDNA和 5'RACE-ready cDNA的制備
2.4.7 大菱鲆趨化因子cDNA 5'和 3'末端的快速擴(kuò)增(RACE)
2.5 序列和進(jìn)化分析
2.6 實時熒光相對定量PCR
3 結(jié)果與分析
2.1 牙鲆CXCL9基因的克隆
2.2 牙鲆CXCL9基因的序列比對及同源性分析
2.3 實時熒光定量PCR檢測結(jié)果
4 討論
第三章 牙鲆兩種新型單外顯子PoCCR6A和PoCCR6B基因的克隆和表達(dá)分析
1 實驗材料
1.1 實驗用魚
1.2 總RNA的提取及cDNA的合成
1.3 總DNA的提取
1.4 牙鲆PoCCR6A和PoCCR6B的克隆
1.5 序列分析和進(jìn)化樹分析
1.6 PoCCR6A和PoCCR6B的組織表達(dá)
1.7 PoCCR6A和PoCCR6B在細(xì)菌感染后的表達(dá)
1.8 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 牙鲆PoCCR6A和PoCCR6B基因的克隆分析
2.2 序列分析和進(jìn)化樹分析
2.3 牙鲆PoCCR6A和PoCCR6B基因的組織表達(dá)分析
2.4 PoCCR6A和PoCCR6B趨化因子受體在鰻弧菌感染后組織中的表達(dá)分析
3 討論
總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
碩士期間科研成果
致謝
本文編號:3845831
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